Биотехнология - Ю.О. Сазыкин 2006
Краткий терминологический словарь
Автолиз — самораспад (лизис) клеток микроорганизмов под действием внутриклеточных гидролитических ферментов.
Агар — смесь полисахаридов, получаемых из красных морских водорослей; после расплавления и охлаждения образует плотный гель; в качестве основы для питательных сред используется в микробиологии.
Аденин — пуриновое основание, комплементарное тимину и урацилу, одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав РНК и ДНК.
Актнномицеты — многоклеточные бактерии со сложным циклом развития. Среди почвенных актиномицетов часто встречаются штаммы-антагонисты, т.е. продуценты антибиотиков.
Альгинат — полисахарид, синтезируемый разными водорослями, состоящий из остатков ß-D-маннуроната и а-L-гулуроната.
Амбисом — лилосомальный препарат антифунгального антибиотика амфотерицина В, используемый при лечении системных микозов, с пониженной токсичностью по сравнению со «свободным» амфогерицином В.
Амикацин — полусинтетический аминогликозидный антибиотик на основе канамицина, не подвергается инактивации защитными ферментами резистентных к аминогдикозидам штаммов бактерий — фосфотрансферазами, трансферазами, ацетилтрансферазами (независимо от того, на какие функциональные группы действуют эти ферменты).
Амнноацил-тРНК — молекула транспортной РНК; к ее 3'-концу присоединена аминокислота, в 3'-положении.
6- Аминопенициллановая кислота (6АПК) — бициклическое ядро пенициллиновой молекулы, получаемое в биотехнологической промышленности из бензил пенициллина путем ферментативного отщепления радикала при С-6; служит ключевым соединением для получения на ее основе новых (полусинтетических) пенициллинов, нечувствительных к беталактамазам, с более широким спектром действия, реагирующих с другим пенициллинсвязывающим белком и т.п.; получение новых пенициллинов связано с химическим или ферментативным замещением свободной аминогруппы в 6АПК.
7- Аминоцефалоспорановая кислота (7АЦК) — бициклическое ядро цефалоспорина С, получаемое в биотехнологической промышленности химическим или ферментативным путем; на основе 7АЦК при использовании биотрансформации получают ряд полусинтетических цефалоспоринов (цефалотин, цефазолин, цефалоридин, цефоперазон и др.).
Анабиоз — состояние организма, характеризующееся почти полным, но обратимым прекращением жизнедеятельности; одна из форм приспособительных реакций микроорганизмов к крайне неблагоприятным условиям внешней среды.
Антибиоз — термин, введенный в литературу в 1890 г. и используемый для обозначения явления микробного антагонизма — между грибами и бактериями и между разными видами бактерий.
Антивитамины — вещества, близкие по своей химической природе к соответствующим витаминам, но не обладающие их свойствами. В основе действия антивитаминов лежит вытеснение соответствующего витамина из его комплекса в ферментативной системе; в результате образуется неактивный фермент, нарушается обмен веществ и возникает тяжелое заболевание. Примером антивитаминов могут служить сульфаниламидные препараты, близкие по химической структуре с парааминобензойной кислотой (предшественник фолиевой кислоты).
Антибиотик — термин, введенный З. Ваксманом в 1941 г. — химическое вещество, образуемое микроорганизмами, подавляющее рост и разрушающее бактерии и другие микроорганизмы, даже находясь в разбавленных растворах, к антибиотикам относят низкомолекулярные химические структуры — вторичные метаболиты микроорганизмов, т.е. появляющиеся в определенной фазе роста культуры. Антибиотики не только подавляют рост микроорганизмов, но и являются сигнальными молекулами, участвующими в перестройке метаболизма своего продуцента при изменении питательной среды (например, при отсутствии в ней источников углерода, азота, фосфора); не являются продуктами матричного синтеза.
Антибиотики полуснитетические — производные природных антибиотиков, получаемые путем химической трансформации, а также антибиотические структуры, при получении которых сочетаются методы как химической, так и биологической трансформации; это цефалоспорины, пенициллины, макролиды, аминогликозиды, рифамицины, антрациклины, тетрациклины и т.д.
Антиген — генетически чужеродное вещество, образуемое другим видом организма, взаимодействующее со специфическими рецепторами Т- и В-лимфоцитов и вызывающее иммунный ответ — выработку антител; обычно в роли антигена выступают чужеродные частицы (клетки, бактерии и др.) или крупные молекулы (белки, полисахариды) чужого организма, однако в ряде случаев антигенами могут быть мелкие молекулы (гаптены).
Антисыворотка — жидкая составляющая крови, содержащая антитела.
Антитело — белок (иммуноглобулин), синтезируемый В-лимфоцитными клетками в ответ на проникновение в организм различных антигенов и специфически с ними взаимодействующий. Антитела — сывороточные глобулины. Обладают свойством специфически связываться с антигеном, активировать комплемент, усиливать фагоцитарную активность макрофагов и нейтрализовать бактериальные токсины.
Антикодон — триплет каждой транспортной тРНК, специфически взаимодействующий в рибосомно-матричной системе с определенным кодоном матричной мРНК; в результате этого взаимодействия аминокислотная цепь синтезируемой полипептидной цепи соответствует последовательности кодонов в мРНК, и происходит передача генетического кода (на стадии трансляции).
Апоптоз — запрограммированная гибель части популяции клеток многоклеточного организма; общебиологическое явление, отвечающее за поддержание необходимого и достаточного количества клеток, элиминацию клеток, ненужных на данной стадии онтогенеза. Морфологически апоптоз проявляется в уплотнении ядерного хроматина, с более поздним распадом ядра на фрагменты и образованием апоптозных телец, подвергающихся фагоцитозу. В аспекте фармации важен поиск агентов как избирательно тормозящих процессы, включенные в апоптоз (например, в случае болезни Альцгеймера, т.е. при старческой дегенерации нейронов), так и стимулирующих апоптоз (например, в случае опухолевых клеток или клеток с внутриклеточными паразитами; последние, например хламидии, могут продуцировать ингибиторы апоптоза для предотвращения гибели клетки).
Ауксин — специфический фактор роста растительной клетки и регулятор синтеза вторичных метаболитов растений — производных индолил-уксусной кислоты (индолил-3-уксусная кислота, нафтилуксусная кислота и др.).
Биообъект — средство производства для получения лекарственных, профилактических, диагностических препаратов; может существовать как организм или фермент (промышленный био катал и затор).
Биотрансформация — процесс превращения веществ с помощью микроорганизмов в определенные продукты с ценными практическими свойствами.
Блок-мутанты — мутанты, получаемые из продуцента антибиотика, лишенного способности синтезировать определенный фрагмент антибиотической молекулы.
Вакцины — препараты для создания активного искусственно приобретенного иммунитета с целью профилактики и лечения инфекционных заболеваний. Основные требования к вакцинным препаратам: высокая или умеренная иммуногенность, безопасность, низкая реактогенность, стабильность при хранении, стандартизуемость, возможность включения в ассоциированные вакцины.
Валидация — термин, использующийся в правилах GMP, означающий особенно тщательную и многостороннюю проверку технологии в целом или части технологической цепочки на производстве. В отношении биотехнологического производства лекарственных средств валидация проводится, в частности, при замене штамма-продуцента целевого продукта и при изменении состава питательной среды.
Вариабельные домены — участки полипептидных цепей иммуноглобулина, имеющие неодинаковую аминокислотную последовательность у молекул разных иммуноглобулинов и отвечающие за антигенную специфичность последних.
Вектор — часть рекомбинантной ДНК, обеспечивающая ее проникновение в клетку и репликацию в этой клетке; вектор конструируется на основе плазмид, фагов, космид.
Вирион — внеклеточная, покоящаяся форма вирусной частицы; выполняет функцию переноса генома вируса из одной клетки в другую или из одного организма в другой.
Вирулентность — характеристика патогенности микроорганизма, свойственна только грам отри нательным бактериям.
Витамины — низкомолекулярные органические соединения разной химической природы, абсолютно необходимые в небольших количествах для нормальной жизнедеятельности организмов человека и животных. Природные источники витаминов — главным образом растения и микроорганизмы.
Внешняя мембрана — компонент оболочки неотрицательных бактерий, отделенный от клеточной стенки пери плазматическим пространством. Наружная поверхность внешней мембраны состоит из полисахаридов и соприкасается со средой, внутренняя — из фосфолипидов и обращена в периплазматическое пространство. Внешнюю мембрану пересекают порино- вые каналы. Внешняя мембрана определяет природную резистентность некоторых видов грамотрицательных бактерий к определенным антибиотикам. Локализованный на наружной поверхности внешней мембраны липид А вместе с присоединенными к нему полисахаридными цепями является эндотоксином, играющим важную роль в патогенезе инфекций; также липид А служит объектом воздействия лекарственных средств.
Время генерации — время, за которое в популяции одноклеточных организмов удваивается число клеток.
Вторичный метаболит — вещество, не являющееся обязательным для роста или функционирования клетки, но синтезирующееся в стационарной фазе (обычно участвует в защите клеток или микроорганизмов от воздействий).
Гель-фильтрация — способ разделения веществ по размеру их молекул, основанный на использовании молекулярных сит.
Генетика — наука о наследственности и ее изменчивости.
Генетика формальная (генетика символов) — ее основу составляют классические законы Менделя.
Генетика молекулярная относится к началу 1950-х гг. после установления Дж. Уотсоном и Ф. Криком структуры ДНК как двойной спирали и решения вопроса о природе гена.
Генная иммунизация — индукция организмом иммунного ответа путем включения в клетки гена, кодирующего белок-антиген.
Геномика — новая научная дисциплина, возникшая в конце XX в. с целью познания генома, т.е. всей совокупности генов в организме. Применительно к фармации геномика позволяет выявлять новые гены — мишени для действия лекарственных средств или гены, с продуктами которых могут взаимодействовать лекарства.
Геномика сравнительная — установление степени близости по последовательности нуклеотидов в генах, полученных из разных источников.
Геномика структурная — установление полной последовательности нуклеотидных пар в гене, хромосоме (хромосомах).
Геномика функциональная — определение функций белка, кодируемого каждым отдельным геном, и роли этого белка в метаболизме.
Ген — единица наследственности; участок ДНК, содержащий специфическую для каждого гена последовательность нуклеотидов.
Гибридома — гибридная клеточная линия, полученная при слиянии нормальных антителообразующих клеток (лимфоцитов) и миеломных клеток; обладает способностью к неограниченному росту in vitro и синтезу моноклональных антител.
Гуанин — пуриновое основание, комплементарное цитозину; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав РНК и ДНК.
Индукция фермента — увеличение скорости синтеза фермента в ответ на появление в среде индуктора (индукция фермента связана с индукцией гена, кодирующего этот фермент).
Инокулятор — небольшой ферментер для стерильного выращивания посевного материала (инокулята), обычно — герметичная емкость с мешалкой, барботером и терморубашкой.
Интерлейкины — большая группа белков (ИЛ-1— ИЛ-18), включенных в системы передачи сигналов при иммунном ответе.
Интерфероны — группа белковых молекул, вырабатываемых клетками крови организма в ответ на введение вирусов и вирусных антигенов; с их помощью клетки иммунной системы обмениваются информацией (сигналами), а также обеспечивают защиту организма от вирусных инфекций.
Интроны — участки гена эукариот, которые транскрибируются, но в отличие от экзонов в зрелую мРНК не входят.
Капсид — белковая оболочка вирусной частицы.
Каспазы — семейство цистеиновых протеаз, участвующих в апоптозе, которые в нормальной клетке находятся в неактивном состоянии; в процессе активации (протеолитический механизм) включается так называемый «каспазный каскад»; для активации необходимы также апоптозные «шапероны» — белки, меняющие конформацию других белков; активированные каспазы участвуют в деструкции клетки.
Катаболитная репрессия — явление «глюкозного эффекта», заключающееся в том, что глюкоза как наиболее быстро усваиваемый субстрат вызывает разной силы, но постоянную репрессию катаболических ферментов; в биотехнологическом производстве может отрицательно влиять на синтез целевых продуктов — вторичных метаболитов.
Катионный белок нейтрофилов — BPI — белок с молекулярной массой 55 кДа, нейтрализующий эндотоксин грамотрицательных бактерий.
Кетолиды — полусинтетические антибиотики, производные эритромицина (телитромицин).
Клавулановая кислота — беталактамная структура, в которой сера в пятичленном кольце заменена на кислород; комбинируется с амоксициллином и защищает его от ферментативной инактивации (препараты «амоксиклав», «аугментин»).
Клеточная линия — популяция клеток, поддерживаемая в культуре путем пересевов.
Клетки миелондного ряда — фагоциты костномозгового происхождения, в том числе нейтрофилы, эозинофилы и моноциты.
Клон — генетически однородное потомство одной клетки.
Комплемент — белковый комплекс сыворотки крови, одна из составляющих врожденного иммунитета. Принимает участие в регуляции воспалительных процессов, активации фагоцитоза и литическом действии на клеточные мембраны.
Кофермекты — специфические низкомолекулярные органические соединения, необходимые для активации многих витаминов и их производных.
Конъюгация — процесс генетического обмена, обусловленный переносом генетической информации от клетки донора в клетку реципиента при непосредственном контакте клеток (у некоторых микроорганизмов это аналог полового процесса).
Конъюгативные плазмиды — плазмиды с генами, детерминирующими перенос плазмиды в другую клетку путем конъюгации.
Космида — плазмида, несущая cos-участок (липкие концы ДНК фага R) и являющаяся вектором с высокой емкостью и легким проникновением в клетку.
Кукурузный экстракт — основной компонент ферментационной среды при выращивании микроорганизмов в промышленных целях, содержащий широкий набор аминокислот и витаминов, а также большое количество молочной кислоты,
Лигаза — фермент, катализирующий образование фосфодиэфирной связи между соседними нуклеотидами, что позволяет восстанавливать за счет ковалентной связи углеводно-фосфатный «хребет» ДНК.
Лизис — растворение клеток микроорганизмов под влиянием разных агентов, например ферментов, бактериофагов, антибиотиков.
Лизоцим — фермент, катализирующий расщепление гликозидной связи между N-ацегилглюкозамином и N-ацетилмурамовой кислотой в полисахаридных «хребтах» пептидогликана (муреина) бактерий.
Лимфокины — обобщающее название молекул, относящихся к иммуноглобулинам и образуемых лимфоцитами. Включены в системы передачи сигналов между клетками иммунной системы.
Лиофильное высушивание (лиофилизация) — метод высушивания целевого продукта из замороженного состояния под вакуумом. В биотехнологии лиофилизация широко используется для длительного хранения культур микроорганизмов, живых вакцин, плазмы, сыворотки крови и ее препаратов, образцов исследуемого материала без существенного изменения исходных свойств. Преимущество лиофилизации перед высушиванием из водных растворов или суспензий состоит в том, что после сублимации формируется сухая пористая масса, лишенная свободной воды и почти сохранившая объем и структуру исходного вещества.
Макрофаги (А-клетки) — фагоцитирующие элементы лимфоидной ткани, способные кооперироваться с Т- и В-лимфоцитами, первыми контактируют с антигеном, перерабатывают его и, взаимодействуя с Т-лимфоцитами, передают информацию об антигене В-лимфоцитам.
Меласса — отход сахарного производства, содержащий около 50% сахаров, широко используемый в качестве источника углерода в микробиологическом производстве.
Миелома — лимфома, образующаяся из лимфоцитов В-клеточной линии.
Мобилизация — перенос неконъюгативных плазмид и хромосомных генов в другую клетку в виде коннтегратов с конъюгативными плазмидами.
Моноклональные антитела — однотипные антитела, строго специфичные в отношении одного эпитопа (антигенной детерминанты), синтезируемые гибридомами — клеточными гибридами, полученными при слиянии нормальных антителообразующих клеток с миеломной опухолевой клеткой, способной к неограниченному росту.
Мурамовая кислота — эфир молочной кислоты и N-ацетилглюкозамина, являющийся частью состава пептидогликана клеточной стенки бактерий.
Мутант — организм с измененными наследственными признаками, полученными в результате мутации.
Мутант с конститутивным ферментом — у которого произошла мутация, нарушившая либо образование репрессора, либо его связывание с оператором.
Мутация — изменение генотипа, передающиеся по наследству.
Мутация внутригенная — изменение последовательности оснований ДНК в пределах одного гена.
Мутация индуцированная — мутация, возникающая после обработки культуры клеток мутагенами (физическими или химическими).
Мутация-миссеис — мутация, приводящая к изменению смысла — приводящая к замене одной аминокислоты в кодируемом белке на другую.
Мутация-ноисенс (бессмысленная мутация) — возникновение кодона, не кодирующего никакой аминокислоты, когда синтез белка прерывается.
Мутация спонтанная — мутация, причина которой неизвестна.
Мутасинтон — консервативный фрагмент молекулы антибиотика, модифицированный химически, вносимый в среду, где культивируется блок-мутант с целью образования мутасинтетического антибиотика.
Мутасинтез — получение с помощью блок-мутантов и мутасинтонов полусинтетических антибиотиков.
Мутагенез in vitro — обработка мутагенами выделенного фрагмента ДНК («локализованный» мутагенез) с усилением вероятности мутаций конкретного гена (частота мутаций может возрастать за счет использования высоких доз мутагена, которые не допустимы in vivo из-за летальных мутаций).
Несовместимость плазмид — неспособность плазмид существовать стабильно в одной и той же клетке, однако плазмиды одной группы могут быть несовместимы между собой и совместимы с плазмидами из других групп.
ПК-клетки — нормальные (естественные) киллерные клетки — популяции лимфоцитов, обладающих природным свойством распознавать и разрушать некоторые инфицированные вирусами и опухолевые клетки.
Нормофлоры — препараты, которые обеспечивают оптимальное функционирование резидентной микрофлоры ЖКТ (бифидумбактерины, молочнокислые и колибактерии).
Оболочка бактериальной клетки — термин, объединяющий внешнюю мембрану, клеточную стенку и внутреннюю плазматическую мембрану. В структуру оболочки грамотрицательных бактерий входит также пери- плазматическое пространство (между внешней и внутренней мембранами), имеющее структуру геля и пептидогликан (собственно клеточная стенка). У грамположительных бактерий отсутствует внешняя мембрана, а клеточная стенка гораздо толще (многослойный пептидогликан), чем у грамотрицательных. Периплазматическое пространство не имеет четкого оформления, как у грамотрицательных бактерий, ввиду отсутствия внешней мембраны.
Олигонуклеотид — короткий (15—20 нуклеотидов) сегмент одноцепочечной ДНК, обычно получают химическим путем.
Оператор — участок ДНК, расположенный рядом со структурным геном; в него входит промотор — место «посадки» РНК-полимеразы и место между промотором и структурным геном, на котором находится белок-репрессор.
Оперон — «генетическая единица», содержащая более одного структурного гена, с которой транскрибируется единая, полицистронная мРНК; биологический смысл оперона — в образовании сразу нескольких белков (ферментов), включенных в один многоступенчатый биологический процесс.
Отжиг — процесс реассоциации молекул ДНК с образованием водородных связей между комплементарными основаниями.
Парадигма — философский термин, означающий концепцию с выработанным критерием, признаваемую всеми исследователями в данной области науки.
Пассаж — пересев, перенос или пересадка клеток из одной культуральной среды в другую; число пересевов клеток равно числу пассажей.
Пассивный иммунитет — вид иммунитета, возникающий при введении в организм сыворотки, содержащей антитела, выработанные другим организмом в результате активной иммунизации.
Пенициллиназа — фермент, расщепляющий беталактамное кольцо у пенициллина и некоторых других беталактамных антибиотиков, обусловливает резистентность бактерий к пенициллину; ген пенициллиназы используется в генной инженерии как ген-маркер при конструировании векторов и отборе рекомбинантных штаммов.
Пептид — короткая цепочка аминокислот, соединенных пептидными связями.
Пептидная связь — ковалентная связь между свободной карбоксильной группой при а-углеродном атоме одной аминокислоты и свободной карбоксильной группой при таком же атоме соседней аминокислоты в полипептидной цепи.
Пептидогликан — полимер, составляющий жесткую основу клеточной стенки грамположительных и грамотрицательных бактерий; пептидогликановый слой у грамположительных бактерий толще, чем у грамотрицательных. Пептидогликан как гигантская сверхмолекула охватывает всю клетку (пептидогликановый саккулюс) и содержит длинные полисахаридные нити, состоящие из перемежающихся остатков N-ацетилглюкозамина и мурамовой кислоты, с отходящими от последней короткими пептидными цепочками. Цепочки параллельных полисахаридных нитей замыкаются и образуют поперечные (перекрестные) мостики, благодаря которым пептидогликан превращается в непрерывную сеть.
Периклазматнческое пространство — пространство между внешней мембраной и цитоплазмой у грамотрицательных бактерий, имеющее структуру геля, в котором локализованы защитные системы микробной клетки, например беталактамазы и ферменты, инактивирующие аминогликозидные антибиотики,
Пиримидины — азотистые основания, входящие в состав нуклеиновых кислот (тимин, цитозин и урацил). Другой тип азотистых оснований — пурины (аденин и гуанин).
Плазмида — внехромосомный генетический элемент. Известны разные классы плазмид: одно-, многокопийные, кольцевые (замкнутые) и линейные. Размеры плазмид меньше, чем у хромосомы. Они могут содержать несколько десятков генов, в том числе гены антибиотикорезистентности. На основе плазмид конструируются векторы.
Полимеразная ценная реакция — метод, с помощью которого могут быть размножены in vitro фрагменты ДНК, в том числе отдельные гены. Для осуществления полимеразной цепной реакции используется термостабильная ДНК-полимераза и олигонуклеотидные ДНК-зонды, комплементарные тем последовательностям противоположных цепей ДНК, которые фланкируют (четко обозначают) границы гена, фрагмент которого должен быть размножен. Последовательность стадий: денатурация ДНК, отжиг зондов, синтез ДНК.
Полинуклеотид — линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных фосфодиэфирными связями. Полинуклеотидами являются, например, молекулы ДНК и РНК.
Полипептид — линейный полимер, состоящий из аминокислот, соединенных пептидными связями. Полипептидом является, например, белковая молекула.
Полиэтиленгликоль — поверхностно-активное вещество, которое используется при слиянии (фузии) протопластов.
«Помпы» — системы активного (энергозависимого) выброса чужеродных для клеток бактерий веществ, например антибиотиков, которые локализованы в цитоплазматической мембране.
Прион — изоформа нормального белка нервной ткани с молекулярной массой 27 — 30 кДа, включенного в регуляцию циркадных ритмов активности и покоя, участвующего в передаче нервных импульсов; белок с само инфицирующей способностью, который не является для человека чужеродным белком, поэтому иммунотерапия в этом случае не эффективна.
Прокариоты — микроорганизмы без оформленного ядра и митохондрий, хромосома которых, содержащая генетическую информацию, находится в цитоплазме клетки. Клетки прокариот по размеру значительно меньше, чем клетки эукариот.
Протеолиз — ферментативное расщепление белков. Одним из способов регуляции метаболизма, когда активная и неактивная форма фермента могут разниться по количеству аминокислотных остатков в ферментном белке, является ограниченный протеолиз.
Протеолитические ферменты (протеазы) — ферменты, расщепляющие пептидные связи в белковых молекулах.
Протопласт — микробная или растительная клетка, лишенная клеточной стенки. Оболочку составляет только цитоплазматическая мембрана. Протопласты стабильны только в гипертонической среде (например, в 20 % сахарозе).
Пили — ворсинки на поверхности клетей донора, через которые в клетку реципиента при конъюгации переходит генетическая информация.
Пориновые белки — компоненты структуры внешней мембраны грамотрицательных бактерий. Тримеры пориновых белков формируют заполненные водой порнновые каналы, через которые низкомолекулярные вещества (например, антибиотики) проникают в периплазматическое пространство клетки, минуя барьер внешней мембраны.
Протопластирование - удаление клеточной стенки у микробных и растительных клеток.
Рапамицин — иммуносупрессор макролидной структуры, образуемый Streptomyces hygroscopicus, действует на более поздний этап ответа на чужеродный антиген, чем циклоспорин А, прерывая каскад ответных реакций на сигнал извне на уровне фосфатидилинозитолкиназы.
Ревертант — мутант, появляющийся в результате реверсии (возвращения) к исходному фенотипу с восстановлением в ДНК исходной последовательности нуклеотидов.
Резистентность множественная лекарственная (полнрезистентность) — применительно к эпидемиологии антибиотикорезистентности означает наличие в плазмиде или в хромосоме ряда генов, обусловливающих резистентность к ряду разных антибиотиков.
Рекомбинантная ДНК — молекула ДНК, полученная объединением in vitro разнородных, нигде в природе вместе не существующих фрагментов ДНК.
Рекомбинантный белок — белок, кодируемый клонированной рекомбинантной ДНК.
Рестриктаза — фермент, расщепляющий углеводно-фосфатную цепь нуклеотидов в ДНК.
Рибонуклеиновая кислота, РНК — нуклеиновая кислота, состоящая из рибонуклеотидов, у которых сахаром является рибоза, а одним из пиримидинов — урацил (вместо тимина в ДНК).
Секреция — выведение вещества из клетки во внешнюю среду.
Система комплемента — серия последовательных процессов активации комплемента (сложного белкового комплекса сыворотки крови) и ферментативных реакций, запускаемых в ответ на образование комплекса антиген—антитело.
Скорость роста — показатель интенсивности роста культуры, равный отношению прироста биомассы в экспоненциальной фазе к соответствующему интервалу времени.
СПИД — синдром приобретенною иммунодефицита — антропонозная инфекционная болезнь, вызываемая вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ), поражающего иммунную систему. Вирус, проникнув в кровь, разносится кровью и лимфой по всем органам и тканям, поражает клетки иммунной системы. Это приводит к нарушению защитной функции иммунной системы, угнетению реакций иммунитета на антигены, угнетению синтеза антител к ВИЧ, фагоцитозу, снижению продукции интерферона, интерлейкинов, комплемента. ВИЧ-инфекция отличается тотальным поражением Т-, В- и А-клеток иммунной системы. Для антигенов ВИЧ характерна большая изменчивость. Специфическая профилактика отсутствует.
Сплайсинг — удаление (вырезание) после транскрипции из мРНК интронов (участков, не несущих информации) и связывание оставшихся экзонов за счет ковалентной связи.
Сидерофор — низкомолекулярное соединение, являющееся переносчиком железа в микробную клетку иногда даже против градиента концентраций.
Сигма-фактор — субъединица РНК-полимеразы, которая играет роль в узнавании этим ферментом промотора и является аллостерическим эффектором. После инициации транскрипции сигма-фактор отделяется от РНК-полимеразы.
Скрининг — отбор и первичная оценка на биологическую активность природных веществ.
Секвенирование — определение последовательности нуклеотидных пар в ДНК; ключевая операция для характеристики геномов разных организмов.
Стенка (клеточная стенка) бактерий — жесткая опорная структура оболочки, обусловливающая форму клеток и расположенная над цитоплазматической мембраной. Клеточная стенка противодействует лизису клеток вследствие различия осмотических давлений цитоплазмы клетки и внешней среды. Основной полимер клеточной стенки — пептидогликан.
Суспензионная культура — тип культуры, в которой клетки размножаются в толще жидкой питательной среды в виде суспензии.
Телитромицин — новый макролидный антибиотик — производное эритромицина. Обладает высокой активностью против эритромицинорезистентных штаммов кокковых бактерий.
Т-лимфоциты (Т-клетки) — лимфоциты, дифференцируемые главным образом в тимусе, выполняющие ключевые функции в развитии и регуляции иммунного ответа.
Транспозон — фрагмент ДНК, имеющий функции генетического элемента, перемещающийся из одного репликона в клетке в другой и из одного места в репликоне в другое место. В транспозон часто включены гены резистентности к антимикробным агентам.
Тимин — пиримидиновое основание, одно из четырех азотистых оснований в составе ДНК.
Токсоиды (анатоксины) — бактериальные токсины (например, дифтерии и столбняка), инактивированные формалином, но сохранившие при этом антигенность.
Трансдукция — осуществляемый фагом перенос генетического материала, хромосомного или внехромосомного происхождения, из клетки в клетку.
Урацил — пиримидиновое основание, одно из четырех азотистых оснований в составе РНК.
Фагоциты — клетки разных типов (разная морфология, продолжительность жизни и т.д.), имеющие общие сходные свойства: направленное передвижение, способность к фагоцитозу (поглощению и уничтожению микробных клеток), продукции активных форм кислорода, многих бактерицидных белков и пептидов, медиаторов иммунного ответа; к фагоцитам относятся дифференцирующиеся в макрофаги полиморфоядерные нейтрофилы с короткой продолжительностью жизни и мононуклеарные клетки с длительной продолжительностью жизни.
Фрагмент — Fab-ф. — антигенсвязывающий фрагмент; фрагмент молекулы иммуноглобулина lg, взаимодействующий с антигеном.
Хламидия — грам отрицательная патогенная бактерия, внутриклеточный паразит, размножающийся только внутри животных клеток. Система экскреции белков у хламидий обеспечивает ее инвазию в клетку макроорганизма и разрушение защитных механизмов последней. Клеточная стенка хламидий содержит аналог пептидогликана, синтез которого чувствителен к беталактамным антибиотикам.
Циклоспорин А — циклопептид, состоящий из 11 аминокислотных остатков, обладает иммуносупрессорными свойствами; реагирует с цитозольным белком циклофилином, после чего их комплекс инактивирует кальций-нейрин и прерывает на этой стадии сигнальную трансдукцию — каскад ответных реакций на чужеродный антиген; подавляет отторжение трансплантатов и используется при пересадке органов и тканей.
Цистрон — эквивалент гена; термин, используемый в молекулярной биологии и биохимии, например полицистронная мРНК.
Цитозин — пиримидиновое основание, одно из четырех азотистых оснований в составе РНК и ДНК.
Цитокины — обобщающее название для секретируемых лейкоцитами и другими клетками иммунной системы молекул при иммунном ответе.
Штамм — культура генетически однородных микроорганизмов.
Экспрессия — «выражение себя», реализация своего предназначения.
Экспрессия гена — транскрипция и трансляция (выражение своей «сущности» в матричной РНК — транскрипция, а затем в белке — трансляция).
Экэоны — несущие информацию участки генов эукариот, которые сохраняются в транскрипте после удаления (вырезания) из него нитронов. Последовательность экзонов составляет зрелую мРН К. Наличие экзонов и нитронов в генах эукариот является проблемой для генных инженеров, если в задачу последних входит перенос гена человека в бактериальную клетку. В этом случае ген не должен содержать интронных участков. С помощью обратной транскриптазы зрелая мРНК гена «переписывается» на ДНК, и такой искусственный, состоящий только из экзонов ген, включается в вектор, а потом и в бактериальную клетку.
Электрофорез — классический биохимический метод разделения несущих заряд молекул (белка, нуклеиновых кислот и др,), основанный на разной для разных молекул скорости их движения в электрическом поле. В настоящее время метод двухмерного электрофореза является основным, используемым в протеомике, позволяя вести мониторинг белков во время любого цикла развития клетки, при реагировании клетки на внешнее воздействие и т.д.
Эндотоксины — токсические субстанции, входящие в структуру бактерий (обычно в клеточную стенку) и высвобождающиеся из них после лизиса. Чаще это название применяют по отношению к липополисахаридам клеточной стенки грамотрицательных бактерий.
Эпитоп (антигенная детерминанта) — фрагмент молекулы (молекул) антигена, локализующийся внутри или на поверхности молекулы, индуцирующий иммунный ответ и определяющий его специфичность.
Эргостерин — исходный продукт производства жирорастворимого витамина Dz. Источником эргостерина являются фитопланктон, бурые и зеленые водоросли, но особенно богаты эргостерином дрожжи и плесневые грибы. Бактерии, как правило, синтезируют незначительные количества стеринов.
Эффектор аллостерический — общее обозначение регуляторных молекул, ингибирующих или активирующих аллостерические ферменты.
Эукариот — организм с оформленным ядром и с более сложной, чем у прокариот, организацией клетки; низшие эукариоты — грибы, дрожжи, простейшие; высшие — растения, животные.