Биохимия и молекулярная биология - Белясова Н.А. 2002

Метаболизм. Процессы, приводящие к запасанию энергии
Улавливание энергии света биомолекулами
Фотосинтез

Фотосинтез представляет собой высокоэффективный процесс запасания энергии видимого света и трансформирования ее в энергию химических свя­зей биологических молекул. Осуществляется данный процесс в клетках рас­тений, водорослей и фототрофных бактерий, причем у большинства перечис­ленных организмов фотосинтез сопровождается использованием в качестве донора электронов воды и выделением молекулярного кислорода (уравне­ние 13.1). И только у аноксигенных бактерий, относящихся к классу Anoxyphotobacteria, вместо воды роль доноров электронов могут выполнять неко­торые иные восстановленные соединения, например сероводород. При этом не происходит образования О₂ (уравнение 13.2).

CO₂ + H₂O → (CH₂O) + O₂      (13.1)

CO₂ + 2H₂S → (CH₂O) + H₂O + 2S      (13.2)

Данное наблюдение принадлежит Корнелису ван Нилю, который в 1931— 1933 гг., будучи еще студентом-дипломником, исследовал особенности фото­синтеза у разных бактерий и сделал смелое предположение, перевернувшее взгляды исследователей на закономерности фотосинтеза. Исходя из выведен­ного им уравнения фотосинтеза для пурпурных серных бактерий (13.2), К. ван Ниль предположил, что не углекислота, а вода разлагается при фото­синтезе у растений, образуя молекулярный кислород, и предложил общее уравнение фотосинтеза (13.3):

CO₂ + 2H₂A → (CH₂O) + H₂O + 2A      (13.3)

В последнем уравнении H₂A представляет собой донор электронов, кото­рым у оксигенных организмов служит вода, а у аноксигенных бактерий — другие вещества (сероводород, молекулярный водород, изопропанол и др.). При этом выделяется дегидрированный донор электронов (А) и происходит восстановление углекислоты до органического соединения (СН₂О). Эти пре­вращения и составляют суть процесса фотосинтеза.

Интересно отметить, что вода является очень плохим донором электронов и ни один из окислителей, которыми располагают живые организмы, не явля­ется достаточно мощным, чтобы отщепить от молекулы Н₂О атомы водорода. Это становится возможным лишь в результате фотохимических превращений особых молекул хлорофиллов, которые становятся сильными окислительны­ми агентами и приобретают способность окислять воду.

Процесс фотосинтеза требует обязательного участия мембран. У прокари­от эту роль выполняют впячивания плазматической мембраны, а у эукари­от — мембраны тилакоидов, расположенные в хлоропластах. Тилакоиды находятся в строме хлоропластов, образуя стопки (граны). Внутреннее со­держимое тилакоидов называют люменом.

В мембранах тилакоидов располагаются компоненты транспорта электро­нов, сгруппированные в 2 фотосистемы, и АТР-синтаза. Фотосистемы ис­пользуются для переноса электронов и сопряженного с ним перевода прото­нов в люмен, в результате чего на тилакоидной мембране создается протон­ный градиент. Энергия протонного градиента запускает синтез АТР, подобно тому, как это имеет место при окислительном фосфорилировании. Однако, в отличие от дыхательной цепи, в фотосистемах электроны движутся от плохо­го донора (молекулы воды) к плохому акцептору (NADP⁺), т. е. в противопо­ложном по сравнению с дыханием направлении. Соответственно и энергия при таком направленном «вверх» потоке электронов должна затрачиваться. Действительно, для восстановления NADP⁺ электроны должны дважды воз­будиться светом.

Характеристика компонентов фотосистем. Компоненты фотосистем представляют собой белковые комплексы, содержащие фоточувствительные молекулы (пигменты) и переносчики восстановительных эквивалентов.

Пигменты представлены в основном хлорофиллами, каротиноидами и фикобилинами. Основную роль в процессе фотосинтеза играет зеленый, со­держащий ионы магния тетрапиррольный пигмент — хлорофилл a (рис. 13.1). Этот хромофор представляет собой магнийпорфирин и похож по структуре на гем (железопорфирин). Однако у хлорофилла a имеются сле­дующие основные отличия: с одним из пиррольных колец слито пятое, цик­лопентановое кольцо; одно из пиррольных колец частично восстановлено; одна из кислотных боковых цепей представляет собой эфир фитола — двадцатиуглеродного высокогидрофобного спирта. Остаток фитола придает молекуле хлорофилла амфифильные свойства и служит «якорем», с помощью которого хромофор может удерживаться в липидном бислое тилакоидной мембраны. При этом гидрофильная голова (магнийпорфирин) находится на поверхности мембраны, обра­щенной к водной фазе стромы, и расположена параллельно плоскости мем­браны. Таким образом, достигается ориентация хлорофилла в хлоропластах, способствующая наиболее эффективному улавливанию световой энергии.

Рис. 13.1. Структура молекулы хлорофилла а

Другие хлорофиллы зеленых растений (b, c, феофитин), а также хлоро­филлы некоторых водорослей и бактерий (хлоробиум-хлорофилл, бактерио-хлорофиллы) отличаются от хлорофилла а структурой заместителей у пир­рольных колец, отсутствием иона магния (феофитин), спектрами поглощения. Существование в клетке хлорофиллов с разными спектрами поглощения позволя­ет увеличить диапазон улавливаемого излучения.

Каротиноиды и фикобилины служат вспомогательными пигментами. Они еще больше увеличивают спектр поглощаемой организмом энергии, а кроме того, защищают хлорофиллы от избытка света и от окисления кислородом, который выделяется при фотосинтезе. Каротиноиды — это желтые, оранже­вые, красные или коричневые пигменты, сильно поглощающие в фиолетовой области спектра. В хлоропластах присутствуют две группы каротиноидов — каротины (углеводороды, бульшую часть которых составляют тетратерпе­ны, подробно рассматриваются в главе 17) и ксантофиллы (по химическому строению сходны с каротинами, но содержат кислород). Фикобилины харак­терны для цианобактерий и хлоропластов красных водорослей.

Для более полного улавливания световой энергии пигменты в фотосисте­мах собраны с помощью белков в антенные комплексы. В каждом антен­ном комплексе насчитывается по несколько сотен молекул пигментов, и их основная функция состоит в передаче поглощенной энергии хлорофиллу а. Таким образом, можно сравнить антенный комплекс с воронкой, «загоняю­щей» энергию к хлорофиллу реакционного центра фотосистемы. Энергия возбуждения (экситон) передается от молекулы к молекуле посредством элек­трического поля возбужденного электрона (очевидно, возбужденный электрон в молекуле, поглотившей квант света, передает свою энергию близлежащей молекуле таким образом, что в той тоже возбуждается электрон).

Транспортирующие электроны компоненты фотосистем представлены комплексом цитохрома b/f (агрегат интегральных мембранных белков, со­держащий два цитохрома: b₅₆₃ и f), феофитином, мембраносвязанными пластохинонами (Q_A и Q_B), а также мобильными переносчиками, функции кото­рых выполняют пластохинон Q_P, пластоцианин и ферредоксин. Пластохинон по структуре и функциям очень напоминает убихинон (рис. 12.1). Пла­стоцианин представляет собой белок с одним атомом меди, координационно связанным с боковыми цепями аминокислот: при переносе электрона Cu на­ходится попеременно в степени окисленности +1 и +2. Ферредоксин является железосерным белком типа 4Fe, 4S^2-, переносящим электроны. Цепь перенос­чиков замыкает фермент, транспортирующий электроны на NADP⁺.

Установлено, что фотосинтез требует участия двух фотосистем: II и I. Фо­тосистема II содержит в реакционном центре хлорофилл а, имеющий опти­мум поглощения при 680 нм (Р₆₈₀), а в реакционном центре фотосистемы I (Р₇₀₀) содержится хлорофилл а с оптимумом поглощения 700 нм.

Световые реакции фотосинтеза. Процесс фотосинтеза условно можно разделить на 2 этапа: световые и темновые реакции. Световые реакции тре­буют участия видимого света и осуществляются в тилакоидных мембранах. Их итогом является восстановление NADP⁺ и синтез АТР. Темновые реакции могут осуществляться и в условиях отсутствия видимого света, в строме, и под ними обычно подразумевают восстановление СО₂ при участии АТР и NADPH.

У растений фотосинтетический перенос электронов начинается с фотосис­темы II. Энергия поглощенного света поступает от антенных комплексов к хлорофиллу а реакционного центра Р₆₈₀ и переводит один из его электронов в возбужденное состояние. Возбужденный электрон сразу передается на распо­ложенный рядом феофитин, а в молекуле хлорофилла появляется положи­тельно заряженная «дырка» с очень высоким сродством к электрону, т. е. возникает положительно заряженный радикал Р₆₈₀. «Дырка» очень быстро заполняется электроном, извлеченным из воды водорасщепляющим фермен­том (Н₂О → 2Н⁺ + SО₂ + 2к) при участии ионов марганца. Возбужденный электрон мигрирует по цепи переносчиков (рис. 13.2) и достигает второй «дырки» в Р₇₀₀ фотосистемы I, которая, в свою очередь, образовалась при переносе «горячего» электрона на электронный акцептор (по-видимому, пластохинон). Здесь электрон воз­буждается вторично и далее по переносчикам фотосистемы I передается на NADP⁺ (рис. 13.2). Такое движение электронов по цепи переносчиков назы­вается нециклическим потоком, или Z-схемой. Важной отличительной осо­бенностью этого процесса является то, что электрон дважды возбуждается в реакционных центрах двух фотосистем, и поэтому его энергии хватает для восстановления NADP⁺. Реакцию образования NADPH катализирует ферредоксин-NADP-редуктаза, содержащая FAD в качестве простетической груп­пы. Следует отметить, что для восстановления никотинамидных кофакторов требуются гидрид-ионы: 2 электрона от двух молекул восстановленного ферредоксина конвергируют, а протон поступает из стромы.

Рис. 13.2. Схема потоков электронов в фотосистемах тилакоидных мембран. Зиг­загообразные стрелки символизируют фотохимическое возбуждение электронов и переход их на более высокий энергетический уровень; обычные стрелки указы­вают путь электронов в нециклическом потоке; пунктирная стрелка указывает путь электронов при их поступлении в циклический поток

Кроме образования NADPH, нециклический поток электронов обусловли­вает перенос протонов в люмен и создание на тилакоидной мембране элек­трохимического градиента. Это происходит на этапе переноса водорода от восстановленного пластохинона Q_P на комплекс цитохромов b/f которые, как известно (глава 12), являются переносчиками электронов. Когда протоны, согласно закономерностям облегченной диффузии, выходят из люмена в строму, они используют каналы АТР-синтазы, и происходит синтез АТР. Этот механизм запасания энергии носит название фотофосфорилирование, и его принцип сходен с механизмом окислительного фосфорилирования.

Кроме описанного выше нециклического потока, в тилакоидных мембра­нах могут осуществляться циклические потоки электронов. В них электрон возбуждается только единожды, в реакционном центре фотосистемы I, и не происходит образования NADPH. Поток становится циклическим, когда элек­троны от ферредоксина передаются не на NADP⁺, а обратно, к пластохинону Q_P (рис. 13.2, 13.3, пунктирные стрелки). Такое движение электронов обеспе­чивает клетку только АТР, но не NADPH. Циклический поток электронов преобладает при низких концентрациях NADP⁺, что обусловлено накоплени­ем в клетке NADPH.

На рис. 13.3 показано расположение компонентов фотосистем, их суб­стратов, а также продуктов. Можно видеть, что основные продукты световых реакций фотосинтеза — NADPH и ATP — накапливаются в строме, т. е. там, где они должны расходоваться в темновых реакциях.

Темновые реакции фотосинтеза. К темновым реакциям фотосинтеза относят фиксацию, т. е. восстановление и включение в состав органических соединений, СО₂. У большинства фотосинтезирующих организмов этот про­цесс осуществляется в цикле Кальвина (цикл носит имя Мелвина Кальвина, получившего за его открытие Нобелевскую премию).

Цикл Кальвина условно можно разделить на три этапа: 1) карбоксилирование рибулозодифосфата; 2) восстановление 3-фосфоглицерата до аль­дегида; 4) регенерация рибулозодифосфата — акцептора СО₂.

Углекислота, восстанавливаемая в цикле Кальвина, поступает в строму хлоропластов зеленых растений через устьица в листьях и зеленых стеблях, а в клетки водорослей и цианобактерий — в растворенном виде. Ключевой ре­акцией восстановления СО₂ является карбоксилирование рибулозодифосфата. Данную реакцию катализирует необычный фермент — рибулозодифосфат-карбоксилаза/оксигеназа, обладающая двумя активностями: карбоксилазной и оксигеназной (рис. 13.4).

Рис. 13.4. Реакции превращения рибулозодифосфата, катализируемые рибулозодифосфат-карбоксилазой/оксигеназой

Оксигеназная активность реализуется в отсутствии СО₂ и в присутствии О₂, а продукты этой реакции участвуют в фотодыхании. Рибулозодифосфат-карбоксилаза/оксигеназа очень медленно работает: скорость ее катализа в сотни раз меньше, чем для большинства других ферментов. Поэтому в хлоро­пластах этот фермент может составлять до половины всего белка. Считается, что это самый распространенный на Земле белок, преобладающий в количе­ственном отношении над другими белками. На уровне данного фермента осуществляется регуляция скорости цикла Кальвина.

Восстановление продуктов карбоксилазной реакции (2 молекул 3-фосфоглицерата) происходит с участием фосфоглицераткиназы и глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы. Обратные реакции, катализируемые этими ферментами, имеют место в гликолизе (рис. 9.3). В этом процессе затрачива­ется энергия АТР и восстановительные эквивалентны, поставляемые NADPH.

Регенерация рибулозодифосфата осуществляется в результате межмоле­кулярных перестроек с участием трансальдолаз и транскетолаз (принимают также участие в пентозофосфатных путях, описаны в главе 9). В превращения вступают 3 соединения: глицеральдегид-3-фосфат, образующийся из него в ходе изомеризации дигидроксиацетонфосфат, а также фруктозо-1,6-дифосфат, который образуется в реакции альдольной конденсации из двух триозофосфатов (см. Гликолиз, глава 9).

В результате описанных превращений из 6 молекул СО₂ в ходе 6 оборотов цикла Кальвина синтезируется 1 молекула гексозы. При этом затрачивается 18 молекул АТР и 12 молекул NADPH (рис. 13.5). Таким образом, фиксация углекислоты обходится клетке очень дорого: на включение лишь одной моле­кулы СО₂ в органическое соединение расходуется 3 молекулы АТР и 2 молекулы NADPH.

Цикл Кальвина изображают замкнутым, однако, как и в ЦТК, многие его промежуточные продукты используются в качестве предшественников для биосинтеза клеточных соединений. Так, 3-фосфоглицерат может превра­щаться в пируват (реакции гликолиза); эритрозо-4-фосфат — в ароматические аминокислоты; рибозо-5-фосфат — в нуклеотиды; гексозофосфаты — в полисахариды (последние три промежуточных соединения формируются на стадии межмолекулярных перестроек). Так же, как и в дру­гих циклах, существуют анаплеротические реакции, не позволяющие циклу прерываться.

Рис. 13.5. Цикл Кальвина

Скорость цикла Кальвина строго регулируется, поскольку на фиксацию СО₂ не должно расходоваться чересчур много клеточной энергии. Основной принцип регуляции цикла состоит в том, чтобы «подогнать» скорость фикса­ции СО₂ к скорости световых реакций фотосинтеза, где образуются необхо­димые для фиксации АТР и NADPH. Поэтому, не смотря на то что цикл Кальвина не требует непосредственного участия видимого света, наиболее интенсивно он все же протекает в условиях освещения. Основной стадией, лимитирующей скорость фиксации углекислоты, является карбоксилирование рибулозодифосфата. Активность карбоксилазы значительно увеличивается при освещении, чему способствуют следующие причины:

1) карбоксилаза аллостерически активируется фруктозо-6-фосфатом и ин­гибируется фруктозо-1,6-дифосфатом. В свою очередь, содержание этих про­дуктов контролирует фермент фруктозо-1,6-дифосфатаза, которая активирует­ся светом и катализирует расщепление фруктозодифосфата;

2) еще одним аллостерическим активатором карбоксилазы является NADPH, а его количество возрастает на свету при интенсивном нецикличе­ском потоке электронов;

3) скорость рассматриваемой ферментативной реакции возрастает при по­вышении рН от 7 до 9. Фермент работает в строме, а ее защелачивание явля­ется следствием закисления люмена при создании протонного градиента на тилакоидной мембране;

4) карбоксилаза активируется ионами марганца, которые высвобождаются в строму при переносе протонов в люмен в процессе транспорта электронов.

Кроме этого, свет активирует еще один фермент цикла Кальвина — глицеральдегид-3-фосфат-дегидрогеназу, который, очевидно, меняет свою специфичность (от NADH к NADPH) под действием света.

С₄-путь фиксации СО₂. Описанный выше процесс включения СО₂ в со­став 3-фосфоглицерата (результат карбоксилазной реакции рибулозодифосфат-карбоксилазы/оксигеназы) называется С₃-путем, а растения, в которых он осуществляется — С₃-растениями. В то же время существует альтернатив­ный С₄-путь (цикл Хэтча—Слэка), отличающийся присутствием дополни­тельной начальной стадии — фиксации СО₂ в составе четырехуглеродного соединения (оксалоацетата). Эту реакцию катализирует фосфоенолпируват-карбоксилаза — фермент, работающий гораздо быстрее, чем рибулозодифосфат-карбоксилаза/оксигеназа. В результате у С₄-растений углекислота вклю­чается в состав оксалоацетата намного эффективнее, чем у С₃-растений в со­став 3-фосфоглицерата. Однако С₄-путь требует дополнительных стадий и затрат энергии: на фиксацию одной молекулы СО₂ здесь затрачивается 5 мо­лекул АТР вместо 3 в С₃-пути (рис. 13.6). Тем не менее, С₄-растения (кукуру­за, сахарный тростник, сорго, многие сорняки, произрастающие в умеренной зоне и др.) растут гораздо быстрее, чем С₃-растения (пшеница, рожь, овес, рис и др.). Причиной такого несоответствия служит фотодыхание — расточительный процесс, ха­рактерный для всех С₃-растений и практически отсутствующий растений.

Рис. 13.6. Цикл Хэтча—Слэка (С₄-путь фиксации СО₂)

Фотодыхание. Этот процесс обязан существованию оксигеназной актив­ности рибулозодифосфат-карбоксилазы/оксигеназы. Молекулярный кислород конкурирует с СО₂ за активный центр данного фермента, и часть рибулозо­дифосфата превращается в фосфогликолат (рис.13.4). Этого не происходит у С₄-растений, поскольку большинство их имеет своей родиной тропические страны, где высокое испарение влаги заставило растения выработать меха­низм закрывания устьиц, через которые ткани вентилируются газами, в са­мые жаркие часы дня (при максимальном солнечном освещении). Чтобы та­кой механизм не привел к снижению скорости фиксации СО₂, растения запа­сают углекислоту в составе малата или аспартата (образуются из оксалоацетата в цикле Хэтча—Слэка), а затем расходуют по мере надобности (реакции декарбоксилирования). В этом случае концентрация СО₂ в зеленых частях растений всегда находится на высоком уровне и отсутствует конкуренция О₂ за активный центр фермента, поскольку молекулярный кислород поступает в клетки в ограниченных количествах при закрывании устьиц.

Субстратом фотодыхания служит гликолат, который образуется при де­фосфорилировании фосфогликолата. При фотодыхании (в отличие от мито­хондриального дыхания, тоже характерного для растений в темноте) потреб­ление О₂ и выделение СО₂ не связано с запасанием энергии, наоборот, здесь расходуются восстановительные эквиваленты и ATP, а фиксированный в цикле Кальвина углерод бесполезно теряется в виде СО₂. Показано, что фото­дыхание может приводить к реокислению и выделению до 50% углерода, фиксированного в цикле Кальвина. До сих пор не разгадана целесообразность этого столь неэкономного и ограничивающего эффективность роста растений процесса.

Последовательность событий фотодыхания изображена на рис. 13.7. Можно видеть, что отдельные стадии этого процесса осуществляются в раз­ных органеллах. Итогом фотодыхания является образование одной молекулы фосфоглицерата (3 атома «С») из двух молекул гликолата (4 атома «С»), а участие кислорода приводит к окислению четвертого атома углерода в углекислоту. По-видимому, назначение сложной последовательности превра­щений в фотодыхании состоит в том, чтобы вернуть в цикл хотя бы часть углеро­да из гликолата, который накапливается в избытке.

Рис. 13.7. Фотодыхание

При фотодыхании происходит потеря одного атома углерода из каждых четырех, причем следует учитывать, что на фиксацию этого атома углерода уже затрачена энергия в цикле Кальвина. Кроме этого, при окислении глици­на и дезаминировании серина выделяется аммиак, на включение которого в состав аминокислот снова придется затрачивать энергию. В результате фото­дыхание снижает потенциальную урожайность С₃-растений на 30—40%.