Основы биохимии Том 1 - А. Ленинджер 1985
Биомолекулы
Вода
Классификация аминокислот на основе их R-групп
Рассмотрим теперь структуру 20 аминокислот, встречающихся в белках. Дело облегчается тем, что все аминокислоты можно сгруппировать на основе признаков, свойственных их R-группам. в частности их полярности (табл 5-3), т.е. способности R-групп к взаимодействию с водой при биологических значениях pH (вблизи pH 7,0). По степени полярности все R-группы аминокислот можно расположить в виде непрерывного ряда, начиная от полностью неполярных, или гидрофобных (т.е. водоотталкивающих), R-гpyпп и кончая сильно полярными, или гидрофильными («любящими») воду), R-группами.
Таблица 5-3. Классификация аминокислот в соответствии с полярностью их R-гpyпп (при pH 7)
Неполярны |
е R-группы |
Аланин Валин Изолейцин Лейцин |
Метионин Пронин Триптофан Фенилаланин |
Полярные, но незаряженные R-группы |
|
Аспарагин Глицин Глутамин Серин |
Тирозин Треонин Цистеин |
Отрицательно заряженные R-группы |
|
Аспарагиновая кислота Глутаминовая кислота |
|
Положительно заряженные R-группы |
|
Аргинин Гистидин Лизин |
Строение 20 стандартных аминокислот показано на рис. 5-6. Имеется четыре основных класса аминокислот, содержащих R-группы следующих типов: 1) неполярные, или гидрофобные, 2) полярные, но незаряженные, 3) отрицательно заряженные и 4) положительно заряженные. Внутри каждого класса имеется определенная градация по полярности, размерам и форме R-гpyпп.