Практическая химия белка - А. Дарбре 1989

Аналитические методы
Колоночная хроматография аминокислот
Определение аминокислот

8.16.3.1. Постколоночная модификация. До начала 70-х годов элюирующиеся с ионообменной колонки аминокислоты детектировались реакцией с нингидрином, смешивание с реагентом проводилось в послеколоночном реакторе с последующим прохождением раствора через нагретую спираль. Интенсивность образующейся окраски измерялась сначала в одном колориметре при 570 нм, а затем в другом, где при 440 нм определялась концентрация пролина и гидроксипролина.

РИС. 8.4. Разделение аминокислот ионообменной хроматографией и одноколоночной системе. Колонка (6X460 мм), заполненная смолой типа W-З до высоты 220 мм. Натрийцитратные буферы: pH 3,25 (0,2 М Na+, с 1%-ным пропанолом-2; pH 3,95 (0,4 М Na+); pH 6,4 (1,0 М Na+). Температура 50—60 °С. Скорость потока 44 мл/ч (буфер), 22 мл/ч (нингидрин). Кювета 12 мм. Вся шкала 2,0 А. Смесь аминокислот для построения градуировочного графика (50 нмоль каждого компонента в 100 мкл). С разрешения фирмы Beckman.

РИС 8 5 Одноколоночное разделение аминокислот (гидролизат гликопротеина). Анализатор фирмы Beckman, модель 119Cl. Колонка (6X460 мм), заполненная смолой типа W-3H до высоты 370 мм. Na-цитратные буферы фирмы Beckman: pH 3,33 (0 20 М Na+); pH 4,25 (0,20 М Na+); pH 6,04 (1,0 М Na+). Температура 30 и 60°С. Скорость потоков 30 мл/ч (буфер), 15 мл/ч (нингидрин). Кювета 12 мм. Вся шкала 0,5 А. Объем образца 100 мкл. Концентрация (нмоль) каждого компонента указана в скобках над пиком. С разрешения фирмы Beckman.

В 1972 г. в качестве селективного флуорогенного реагента на первичные амины был предложен флуорескамин [375], а несколько позднее он стал использоваться для модификации аминокислот после их выхода с колонки аминокислотного анализатора. Получаемая при этом чувствительность определения в 10—100 раз превышала возможности нингидринового метода [21]. Для измерений применялся флуориметр с длиной волны возбуждения 340 нм и эмиссией при 450 нм. Широкому распространению флуорескамина помешали его нестабильность в водных средах и высокая стоимость. Этих недостатков лишен введенный в практику почти одновременно с флуореcкамином [320] о-фталевый альдегид (ОФА), вытеснивший в значительной степени флуорескамин и применявшийся в аминокислотных анализаторах многими исследователями. Образование флуоресцирующего производного с ОФА с максимумом возбуждения при 360 нм и максимумом эмиссии при 455 нм происходит при pH 9—11. Лизин дает слабую флуоресценцию, усиливающуюся при добавлении реагента бриджа. Цистеин реагирует только в присутствии иодоуксусной кислоты [78], а цистин лучше определять в виде цистеиновой кислоты после окисления надмуравьиной кислотой. Пролин, гидроксипролин и вторичные амины вступают в реакцию только после окисления хлорамином-Т, N-сукцинимидом или гипохлоритом [33, 178, 321]. Если нет необходимости определять пролин и гидроксипролин, то безусловно выгодно использовать ОФА; чувствительность определения производных достигает 5 пмоль, для нингидрина она составляет 100 пмоль, как для первичных, так и для вторичных аминогрупп. Среднее относительное стандартное отклонение для аминокислот равно 6% (разброс 3—24%) [85].

Более поздние методы определения аминокислот с постколоночной модификацией основаны на использовании таких флуорогенов, как 7-хлоро-4-нитробензо-2-окса-1,3-диазол, позволяющий обнаружить все аминокислоты, включая пролин и гидрооксипролин, на уровне 1 пмоль [415], и 4-фторо-7-нитробензо- 2,1,3-оксадиазол [391] с пределом обнаружения 5 пмоль для пролина и 20 пмоль для других аминокислот.

8.16.3.2. Предколоночная модификация. Применение постколоночной модификации сопряжено с техническими трудностями осуществления смешивания каждой разделяемой аминокислоты в элюате с раствором реагента в соответствующих, оптимальных для реакции условиях. Провести предколоночную обработку аминокислот реагентами проще, а полученные соединения могут быть разделены с помощью ОФ-ВЭЖХ, но по имеющимся данным, воспроизводимость результатов уступает достигаемой в постколоночном методе. Наиболее изученные производные аминокислот — фенилтиогидантоины — продукты деградации пептидов по методу Эдмана (гл. 13) не использовались непосредственно для анализа аминокислот, хотя детально разработаны несколько методов их идентификации, в том числе ВЭЖХ [186, 420]. Методом ВЭЖХ за 30 мин разделяются также окрашенные аналоги ФТГ — диметиламиноазобензолтиогидантоины [412] (см. гл. 14).

Обзор по прсдколоночной модификации аминокислот и пептидов с последующим разделением производных ВЭЖХ см. в работе [360].

Дансиламинокислоты. Для идентификации дансиламииокислот при определении аминокислотной последовательности белков широко используется метод тонкослойной хроматографии (гл. 10 и 11). Недавно дансильные производные были успешно разделены па колонках с обращенной фазой [15, 152, 167, 202, 330, 340, 363, 394, 403]. Чувствительность обнаружения составляет 100 пмоль при спектрофотометрическом и несколько фемтамолей при флуоресцентном [15, 202] или хемилюминесцентном определениях [166, 200].

Дансильные производные при анализе аминокислот не дают результатов, сравнимых с получаемыми при использовании ОФА. Один из недостатков дансилирования состоит в том, что для одной аминокислоты возникает несколько пиков, например пик О-дансилтирозина и O,N-дидансилтирозина наряду с пиком N-дансилтирозина. Преимущество же состоит в возможности одновременной с другими аминокислотами идентификации пролина и гидроксипролина. Было предложено применять [403] дансильные производные аминокислот для анализа состава пептидов с высокой степенью чувствительности и для количественного определения N- и С-концевых остатков, в частности С-концевых остатков амидов аминокислот, отщепленных ферментативными методами от амидированных пептидов на уровне 50 пмоль с УФ-детекцией [340]. d- и L-изомеры дансиламино- кислот разделены методом ВЭЖХ [209, 208].

Производные с о-фталевым альдегидом. о-Фталевый альдегид реагирует с аминокислотами в присутствии ß-меркаптоэтанола при 25 °С с образованием замещенного изоиндола [341]. Соединения, не содержащие а-водородного атома, дают флуоресцентный сигнал, составляющий по интенсивности <1% флуоресценции эквивалентного количества глицина [83], для цистина эта величина составляет 3%, даже если реакция проводится при 100 °С [84].

В присутствии меркаптоэтанола реакция ОФА с первичными аминогруппами завершается за 0,1—1,0 мин, но образующиеся производные глицина, лизина, гидроксилизина и фосфосерина имеют период полупревращения 1—4 мин [374]. Была изучена стабильность ОФА-2-меркаптоэтанолпроизводных аминокислот [80] и проведено их разделение методом ВЭЖХ за 22 мин [79]; показано, что разрушение продуктов может быть сведено к минимуму при быстром введении в колонку. Интенсивность флуоресценции для лизина и гидроксилизина повышается до 40—50% при добавлении к реакционному раствору реагента бридж-35. Цистин может быть определен количественно в виде цистеиновой кислоты и карбоксиметилцистеина.

Вторичные аминокислоты (пролин и гидроксипролин) не взаимодействуют с ОФА непосредственно, но при их окислении гипохлоритом образуются первичные аминогруппы, вступающие в реакцию. Эти аминокислоты могут быть определены также после модификации 4-хлоро-7-нитробензофураном (НБФ) [376]. Прекрасные результаты были получены при разделении ОФА производных аминокислот методом ВЭЖХ с флуорометрическим детектором [79, 160, 161, 163, 187—189, 210, 219, 376].

Новые возможности не только для повышения чувствительности определения, но и селективности обнаружения некоторых производных, например основных аминокислот [191], открывает применение электрохимических детекторов.

Автоматизация анализа флуорогенных соединений предъявляет повышенные требования к их устойчивости, которым не удовлетворяют аддукты ОФА-меркаптоэтаноламинокислоты. Более длинный период полупревращения имеют ОФА-этантиольные производные. Хотя падение интенсивности флуоресценции на 20—50% за 6—8 ч наблюдается и у этих соединений [342], процесс их синтеза и последующего разделения в автоматическом варианте был опробован при исследовании аминокислот плазмы [111].

В 1984 г. описан [74] автоматический рутинный метод анализа ОФА-производных аминокислот на колонке Altex Ultrasphere ODS (250x4,6 мм) с размером частиц 5 мкм с предколонкой Brownlee, заполненной сорбентом C18(5 мкм). В этой системе без смены носителя удалось проанализировать более 2000 образцов.

ОФА был введен в программу автоматического анализа аминокислотной последовательности на секвенаторе для блокирования а-аминогрупп «остаточных» пептидов, когда пролин становится N-концевым в определяемой последовательности [41].

Реагенты для модификации с помощью ОФА.

OФА-реагент [214]. Растворяют 62 г борной кислоты и 25 г КОН в 900 мл воды. Подщелачивают до pH 10,4 45%-ным КОН и доводят до объема 1 л. Фильтруют через мембрану Millipore 0,22 и добавляют 2 мл меркаптоэтанола, 6 мл 30%-ного (масс./об.) бридж-35 и 1,2 г ОФА, растворенного в 15 мл метанола. Выдерживают в течение ночи в темноте под азотом при комнатной температуре. Реагент стабилен в течение 1 мес под азотом при 4 °С. ОФА использовался для определения аминокислот на уровне 10 пмоль [214] и фосфоаминокислот (разд. 8.11.2.3).

Реагент ОФА — этантиол [206]. Растворяют 100 мг ОФА в 5 мл метанола. Добавляют 50 мкл этантиола (ЭТ) и 10 мл 0,15 М натрийборатного буфера (pH 10,5), содержащего 0,2% реагента бридж-35. Смесь продувают азотом и оставляют стоять в темноте по крайней мере на 16 ч. Для сохранения стабильности каждые 4 дня к реагенту добавляют 10 мкл ЭТ (разд. 8.12.2.3).

Предколоночная дериватизация ОФА [187, 188].

Реагенты. Растворяют 50 мг о-фталевого альдегида в 1,25 мл метанола и добавляют 50 мкл 2-меркаптоэтанола и 11,2 мл 0,4 М боратного буфера подщелаченного до pH 9,5 с помощью 4 М NaOH. Реагент стабилен в течение 1—2 недель. Можно использовать раствор реагента фирмы Pierce. Он содержит ОФА в боратном буфере с добавкой реагента бридж-35 и 2-меркаптоэтанола. Реагент стабилен 6 мес при 4 °С.

Модификация. Белок гидролизуют в 6 М НСl, лиофилизуют и остаток растворяют в воде. Если для гидролиза использовалась метансульфокислота, гидролизат нейтрализуют 4 М NaOH. Разбавляют, если необходимо, 0,4 М боратным буфером (pH 9,5) до получения конечной концентрации по каждой аминокислоте <25 нмоль/мл. Перед гидролизом белок может быть окислен или карбоксиметилирован.

Аликвоту раствора образца 5—10 мкл смешивают с 5 мкл раствора реагента. Через одну минуту добавляют 20—100 мкл ацетата натрия (pH 7,0) и немедленно 20 мкл наносят на колонку. Внутренним стандартом служит 2-аминоэтанол.

Анализ сыворотки мочи или спинномозговой жидкости. Смешивают 25 мкл образца при энергичном размешивании с 75 мкл ацетонитрила. Центрифугируют при 1000 g 2 мин. Берут 10 мкл аликвоты для обработки ОФА.

ВЭЖХ. Используют колонки с носителем Ultrasphere ODS (45:240)Х4,6 мм с размером частиц 5 или 3 мкм и Microsorb C18 (100X4,6 мм). Необходима предохранительная колонка (СО : PELL сорбент ODS, 40 мкм), особенно для колонок с носителем C18 и размером частиц 3 мкм. Длина колонки практически не влияет на эффективность разделения аминокислот, поэтому предпочитают укороченные колонки (45—100 мм) для сокращения времени анализа. Иногда проблему составляет достижение четкого разделения глицина и треонина. Дело в том, что колонки даже одной фирмы значительно различаются между собой. В некоторых случаях глицин и треонин разрешаются полностью, на других колонках не удается достичь полного разделения даже варьированием состава элюирующей системы.

Измерения проводят на флуориметре с кюветой 9 мкл и фильтрами для возбуждения при 305—395 нм и эмиссии при 420—650 нм.

Для градиентного элюирования смешивают два предварительно дегазированных раствора:

Раствор А. 0,1 М ацетат натрия, pH 7,2 (для гидролизатов белков) или pH 6,4 (для физиологических жидкостей).

Раствор Б. Абсолютный метанол.

Линейная зависимость площади пика от количества нанесенного образца сохраняется в диапазоне 500 фмоль — несколько сотен пикомолей вещества; при содержании <5 пмоль наблюдаются значительные отклонения от линейности для таких аминокислот, как серин, глицин, аланин, из-за наложения фоновых примесей. В этих случаях необходимо проводить коррекцию результатов путем вычитания данных «глухого» опыта. Для большинства аминокислот чувствительность 25—50 фмоль, рабочий интервал 50 фмоль — 1 нмоль. Па рис. 8.6 приведены результаты разделения аминокислот на колонке со смолой Ultraspere ODS (3 мкм) за 13,5 мин. Кривые элюирования гидролизатов вазопрессина и соматостатина в аналогичных условиях представлены на рис. 8.7.

Замечание. Смесь, содержащая более 60 аминокислот и аминов, была разделена с использованием предколоночной модификации с ОФА. Недавно на колонке Perkin Elmer C18 (4,6X32 мм), размер частиц 3 мкм (Jones, частное сообщение), проведен анализ менее чем за 7 мин. Цистеин определялся в виде карбокcиметильного производного, а метионин —в виде метионин-S-оксида; пролин и гидроксипролин — по методу, описанному в работе [376).

РИС. 8.6. Профиль элюирования смеси аминокислот, модифицированных ОФА. В каждом пике 40 пмоль вещества. Система ВЭЖХ включает два насоса (фирма Beckman, модель 100А), микропроцессор для создания режима градиентного элюирования (фирма Beckman, модель 421) и флуориметр (фирма Gilson, модель 121), снабженный 9-мкл кюветой и фильтрами с полосой пропускания 305—395 нм (для возбуждающего света) и 420—650 нм (для эмиссионного излучения). Эмиссионный фильтр снабжен диафрагмой с отверстием диаметром 2 мм. Диапазон шкалы флуориметра 0,1 отн. ед., временная константа 0,5 с. Образцы вводились в колонку с помощью инжeкционного клапана (фирма Beckman, модель 210), снабженного петлей объемом 20 мкл. Хроматографические пики записывались и обрабатывались с помощью интегратора системы C-RIA. Колонка с обращенной фазой Ultrasphere ODS (75x4,6 мм, частицы 3 мкм) соединена с предколонкой (30x2,1 мм), наполненной сорбентом СО: PELL ODS (частицы 40 мкм). Скорость потока 1,5 мл/мин, исходное давление на колонке 3100 psi. Любезно предоставлено д-ром В. N. Jones. Седьмой пик слева направо Asn.

Предколоночная дериватизация с 4-хлоро-7-нитробензофураном (НБФ) [3761 используется для модификации пролина и гидроксипролина. Аликвоту нейтрализованного образца разбавляют, если нужно, до конечной концентрации пролина —20 нмоль/мл. Смешивают равные объемы 0,4 М боратного буфера (pH 9,5) и метанольного раствора НБФ (2 мг/мл). Нагревают при 60 °С 5 мин в закрытом сосуде. Реакцию останавливают охлаждением до 0 °С, Аликвоту раствора наносят на колонку.

ВЭЖХ. Используется колонка Ultrasphere (250X4,6 мм) с частицами 5 мкм.

РИС. 8.7. Профили элюирования гидролизатов двух карбоксиметилированных полипептидов. Количество вещества в каждом пике выражено в пикомолях. а — кислотный гидролизат вазопрессина; найденные количества аминокислот находятся в хорошем соответствии с известным составом полипептида: Asp, Glu, CMC2, Gly, Arg, Tyr, Phe; б — ферментативный гидролизат соматостатина; ожидаемый состав соматостатина из данных аминокислотной последовательности; СМС2, Asn, Ser, Gly, Thr2, Ala, Trp, Phe3, Lys2.

Растворитель А. Тетрагидрофуран — 0,05 M ацетат натрия (pH 6,6) (1:99).

Растворитель Б. Метанол.

Линейный градиент от 30% до 45% Б при скорости 1,5% Б в минуту.

Скорость потока 1,0 мл/мин.

Обнаружение при длине волны возбуждения света 220 нм, эмиссии до 370 нм и шкалой чувствительности 0,1 мкА, НБФ-аддукты пролина и гидроксипролина элюируются в этих условиях за 6 мин.

Фенилтиокарбамильные производные. Реакция фенилизотиоцианата (ФИТЦ) с аминокислотами изучена детально, поскольку она лежит в основе методики деградации пептидов по Эдману, конечными продуктами которой являются фенилтиогидантоины [104]. Первая стадия этой реакции — образование фенилтиокарбамильных (ФТК) производных — используется для количественного определения аминокислот в так называемом PICO-TAG™-aнaлизе, разработанном и внедренном фирмой Waters. ФТК-аминокислоты стабильны, легко синтезируются и успешно идентифицируются после разделения методом БЭЖХ на обращенной фазе. В реакцию вступают как первичные, так и вторичные аминогруппы аминокислот и разделяются все производные одновременно. Обнаружение с УФ-детектором при 254 нм; это дешевле и проще, чем применение флуориметра для ОФА-производных. Для анализа был использован S35, меченный ФИТЦ [76, 151, 199].

Предколоночная модификация фенилизотиоцианатом [151].

Реагенты. ФИТЦ (в 1-миллиметровых ампулах, запаянных в вакууме), триэтиламин («для секвенирования»), аминокислоты (фирма Pierce). Пиридин и триэтиламин перегнаны над нингидрином и гидридом кальция. Ацетонитрил и метанол для ВЭЖХ (фирма Burdik and Jackon). Буфер для конденсации: ацетонитрил — пиридин —триэтиламин — вода (10:5:2:3). Стабилен в течение месяца при —5 °С. ФТК-аминокислоты устойчивы, если хранятся замороженными при pH 6,8.

Модификация. В небольшой пробирке высушивают досуха гидролизат белка или раствор аминокислот. Растворяют остаток в 100 мкл буфера для конденсации и высушивают досуха на роторном испарителе или высокоскоростном концентраторе (Speed-Vac Concentrator). Эта предварительная обработка необходима для удаления следов НСl и дает возможность избежать появления постороннего пика на хроматограмме вблизи гистидина.

Добавляют 100 мкл буфера для конденсации и 5 мкл ФИТЦ. Оставляют на 5 мин при комнатной температуре. Упаривают и затем сушат в глубоком вакууме (0,5—10-2 мм рт. ст.). Вновь растворяют образующиеся ФТК-аминокислоты в 250 мкл 0,05 М аммонийацетатного буфера или смеси вода — ацетонитрил (7:2). Вводят с помощью инжектора 1 —10 мкл (100—1000 пмоль каждой аминокислоты) на колонку с обращенной фазой. Аликвота может быть одновременно исследована на обычном анализаторе для контроля полноты превращения аминокислот в ФТК-производные.

ВЭЖХ. Используют обычно колонки (250X4,6 мм) с носителем С3 и С18 и частицами 5 мкм (Altex, Dupont и IBM).

Системы растворителей:

A. 0,05 ацетат аммония (pH 6,8), подкисленный фосфорной кислотой.

Б. 0,1 М ацетат аммония (pH 6,8) в различных растворителях:

1) ацетонитрил — вода (50:50);

2) метанол — вода (80:20);

3) ацетонитрил — метанол — вода (44:10:46).

B. Ацетонитрил — вода (70:30).

Прекрасное разделение ФТК-аминокислот было получено с использованием градиента растворителей (см. ниже) при температуре колонки 52 °С и общем времени анализа 30—40 мин. Поглощение измерялось в УФ-свете при 254 нм:

Время, мин

Содержание

растворителя, %


А

В

В

0

100

0

0

15

85

15

0

30

50

50

0

30,1

0

0

100

40

100

0

0

Приведенная методика описана в работе [76]. В табл. 8.1 приведены коэффициенты молярного поглощения ФТК-аминокислот (последние указаны в порядке их элюирования с колонки).

Процедура определения аминокислотного состава, называемая PICO∙ТАС™-анализом, заключается в обработке избытком ФИТЦ нескольких (до 12 одновременно) образцов и удалении летучих компонентов в вакууме в специально сконструированном приборе. В диапазоне 5—1000 пмоль зависимость величины сигнала от количества вещества линейна. Возможна автоматизация процесса. Все белковые аминокислоты включая аспарагин, глутамин, цистеиновую кислоту, карбоксиметилцистеин, гомосерин, метионинсульфоксид и метионинсульфон, гидроксипролин и гидроксилизин могут быть проанализированы на специальной колонке PICO-TAG™. Результаты разделения стандартной смеси аминокислот (фирма Pierce Н) в количестве 250 пмоль и 1 пмоль (за 12 мин) приведены на рис. 8.8 и 8.9.

Таблица 8.1. Коэффициенты молярного поглощения ФТК-аминокислот в системах растворителей А, Б (1) и В (см. текст) [151]

А мшюкислота

Молярное поглощение при 254 нм (1 моль/см)

Аминокислота

Молярное поглощение при 254 нм (1 моль/см)

Ala

15772

Arg

13874

Glu

14465

Pro

15235

KM-Cys

15500

Tyr

16524

Hyp

15420

Val

16295

Ser

14824

Met

16716

Gly

15326

Ile

21375

His

12645

Leu

17069

Ihr

15152

Phe

16293

Ala

16316

Lys

30224



Для любых предложений по сайту: [email protected]