Биохимия - Химические реакции в живой клетке Том 2 - Д. Мецлер 1980
Организация метаболизма: катаболические пути
Брожение: «жизнь без кислорода»
Брожение, основанное на фосфоглюконатном и пентозофосфатном путях
Некоторые молочнокислые бактерии рода Lactobacillus, а также бактерии Leuconostoc mesenteroides осуществляют гетероферментативное молочнокислое брожение, в основе которого лежат реакции пентозофосфатного пути. Объясняется это, несомненно, отсутствием у этих организмов ключевого фермента альдолазы, необходимого для расщепления фруктозо-6-фосфата на две молекулы триозофосфата.
Путь превращений, показанный в уравнении (9-39), включает реакции, уже знакомые читателю. Глюкоза превращается в рибулозо-5-фосфат в ходе реакций пентозофосфатного пути. Рибулозо-5-фосфат расщепляется фосфокетолазой (рис. 8-4) на ацетилфосфат и фосфоглицериновый альдегид, которые далее превращаются соответственно в этанол и лактат. В итоге на одну сбраживаемую молекулу глюкозы синтезируется всего одна молекула АТР1).
Небольшое видоизменение уравнения (9-39) показывает путь сбраживания пентоз в ацетат и лактат с синтезом одной молекулы АТР на каждую молекулу ацетилфосфата. Еще одна молекула АТР образуется при окислении глицеральдегид-3-фосфата. Поскольку одна молекула АТР затрачивается для «затравки» пентозы, итоговый выход составляет две молекулы АТР.
Другой тип брожения [уравнение (9-40)] [40] встречается у бактерий рода Bifidobacterium. Процесс требует участия фосфокетолазы и фосфогексокетолазы (расщепляющей фруктозо-6-фосфат на эритрозо-4-фосфат и ацетилфосфат), а также ферментов системы структурной перестройки сахаров (разд. Д, 3). Выход АТР 21/2 моль на 1 моль глюкозы.
Другой путь брожения основан на окислении 6-фосфоглюконата по пути Энтнера — Дудорова [уравнение (9-18)]. Основываясь на реакциях этого пути, читатель легко сможет построить схему сбалансированного брожения, в результате которого глюкоза так же, как и в дрожжевом брожении, превращается в этанол и СО2. Каков будет ожидаемый выход АТР?
1) Фосфокетолазное расщепление может рассматриваться как процесс окислительного фосфорилирования Альдегидная группа «активного гликольальдегида», отщепленного от рибулозо-5-фосфата, окисляется в ацилфосфат за счет восстановления —СН2ОН в —СН3
Вопросы и задачи
1. Сколько молекул АТР может быть образовано на молекулу пальмитиновой кислоты при ее окислении в клетке до СО2 и воды? Расчет ведите, предполагая, что при окислении NADH компонентами митохондриальной цепи переноса электронов образуются 3 молекулы АТР, а при окислении FADH2— 2 молекулы АТР.
2. Если принять, что 1 моль АТР обеспечивает синтез 10,5 г сухого вещества клетки (гл. 3, разд. Г,1), то какое количество клеток (в граммах) может быть образовано на 1 г пальмитиновой кислоты, окисляемой в ходе метаболизма при условии, что весь образовавшийся при этом АТР расходуется на рост клеток?
3. Сколько молей АТР может быть образовано при полном окислении 1 моль уксусной кислоты? При полном окислении 1 моль глюкозы?
4. Сопоставьте значения ∆G0 и число образовавшихся молей АТР при полном окислении следующих соединений:
а) ацетата (pH 7);
б) двухуглеродного фрагмента жирной кислоты;
в) лактата (pH 7);
г) трехуглеродного фрагмента глюкозы (1/2 молекулы).
5. Аминокислоты с разветвленной боковой цепью, валин, лейцин и изо лейцин, часто распадаются в организме следующим образом. Пере аминирование приводит к образованию а-кетокислоты, которая под вергается окислительному декарбоксилированию с образованием ацил-СоА-производного. Последнее затем подвергается ß-окислению. Какие продукты в этом случае образуются из изолейцина Каким образом они затем превращаются в СО2? Какие затруднения могут встретиться при катаболизме валина и лейцина? Попытайтесь предложить рациональную схему соответствующих катаболических путей. Сравните свои предложения с реально установлениыми путями, приведенными на рис. 14-11.
6. Для цикла трикарбоновых кислот в качестве «затравки» требуется регенерирующийся субстрат оксалоацетат. Назовите четыре мета болических источника этого соединения (необязательно, чтобы все они имелись у животных); отметим, что два из них являются аминокислотами.
7. Метаболизм глюкозы начинается с действия гексокиназы:
При физиологических условиях эта реакция практически необратима. Почему?
8. Многие соединения, встречающиеся в клетке, синтезируются из веществ, участвующих в реакциях гликолиза и цикла трикарбоновых кислот, или из близко родственных им соединений. Используя в качестве исходного субстрата пируват, укажите реакции, ведущие к образованию следующих соединений:
а) аспарагиновой кислоты,
б) молочной кислоты,
в) этанола,
г) ацетоуксусной кислоты,
д) ацетона,
е) аланина,
ж) уксусной кислоты,
з) глутаминовой кислоты,
и) б-аминолевулиновой кислоты,
к) пропионовой кислоты.
9. Радиоактивную глюкозу, меченную углеродом 14С в положениях 3 и 4, инкубировали в анаэробных условиях с бесклеточным гомогенатом печени. В каких положениях будет содержать 14С образовавшийся в результате лактат?
10. Рассмотрите превращения в цикле трикарбоновых кислот следующих соединений, меченных углеродом 14С: 1-14С-пирувата, 2-14С-пирувата, 2-14С-ацетата, 1-14С-сукцината. Укажите положение метки в оксалоацетате после завершения одного цикла. Из каких субстратов после одного цикла будет образовываться 14СО2?
11. Предположим, что в дрожжевой клетке между NAD+, NADH, глицеральдегид-3-фосфатом, 1,3-дифосфоглицератом, этанолом и ацетальдегидом установилось равновесие.
а. Каково изменение стандартной свободной энергии для сопряженной пары окислительно-восстановительных реакций, в которых участвуют эти соединения, т. е. для суммарной реакции:
б. Какой будет равновесная концентрация ацетальдегида при концентрации этанола 1 М и концентрациях глицеральдегид-3-фосфата и 3-фосфоглицерата 10 мМ?
в. Чему будет равно ∆G0 процесса, в котором приведенная выше реакция сопряжена с синтезом 1 моль АТР?
г. Какой будет в равновесии концентрация ацетальдегида при концентрациях остальных соединений, указанных в п. «б» и при сопряжении процесса с синтезом 1 молекулы АТР в условиях, когда показатель состояния фосфорилирования (дополнение 3-А) Rр = 104?
12. Нематоды Ascaris lumbricoides (а также многие другие беспозвоночные) могут жить в полностью анаэробных условиях, получая энергию путем сбраживания глюкозы в сукцинат и пируват [см. Landsperger W. J., Harris В. G., JBC, 251, 3599—3602 (1976)].
а. Чему равно ∆G' (pH 7) для такого брожения?
б. Хотя одним из продуктов является пируват, у этих организмов практически отсутствует пируваткиназа. По-видимому, они превращают фосфоенолпируват в малат [уравнение (7-76)], который далее поступает в митохондрии. Составьте схему реакций превращения малата в наблюдаемые продукты в митохондриях.
в. Сколько молей ATP на 1 моль глюкозы образуется при таком брожении в цитозоле? Считается, что еще один моль АТР вырабатывается за счет процессов, происходящих в митохондриях. Предложите путь реакций соответствующего процесса (см. рис. 10-11).
г. У Ascaris накапливается также и ацетат. Объясните, как это может происходить в анаэробных условиях.
13. У устриц пируват, образующийся в процессе брожения, описанного в задаче 12, реагирует с глутаматом, образуя аланин и а-кетоглутарат. Последний может подвергаться окислительному декарбоксилированию и превращаться в пропионат. Напишите уравнение сбалансированного брожения, в процессе которого глутамат и глюкоза превращаются в аланин, пропионат и сукцинат. Чему равно ∆G' (pH 7)? Каков должен быть выход АТР на 1 моль сбраживаемой глюкозы?