Биохимия - Химические реакции в живой клетке Том 2 - Д. Мецлер 1980
Ферменты: белковые катализаторы клеток
Ферменты: белковые катализаторы клеток
Основы ферментативной кинетики
Образование и превращение комплекса ES
Линейные формы уравнений скорости
Диффузия и число активных соударений фермента с субстратом
«Эффект клетки» и вращение молекул
Обратимые ферментативные реакции
Реакции с участием двух и большего числа субстратов
Ингибирование и активация ферментов
Неконкурентное ингибирование и активация
Использование ингибиторов для изучения механизмов ферментативных реакций
Изотопный обмен в равновесных условиях
Аллостерические эффекторы и изменения конформации ферментов
Специфичность действия ферментов
Комплементарность поверхностей субстрата и фермента
Механизмы ферментативного катализа
Количественная теория переходного состояния
Ингибиторы, структурно подобные переходному состоянию
Эффекты сближения и ориентации
Регуляция ферментативной активности
Генетический контроль синтеза ферментов
Пространственное разделение: изолированные отсеки и организованные ансамбли
Регуляция активности ферментов
Усиление регуляторных сигналов
Видовые различия в механизмах регуляции
Типы реакций, катализируемых ферментами
Краткий обзор некоторых метаболических путей
Пусковая реакция или активация метаболитов
Цепь переноса электронов. Окислительное фосфорилирование
Классификация ферментативных реакций
Реакции нуклеофильного замещения (реакция типа 1)
Факторы, влияющие на скорости реакций замещения
Реакции нуклеофильного замещения у насыщенных атомов углерода
Механизм реакций двойного замещения
Другие ферменты, действующие на гликозиды
Реакции замещения у карбонильных групп
Участие ионов металла в действии протеиназ: карбоксипептидаза А
Замещение у атома фосфора
Нуклеаза микрококков (стафилококков)
Ядерная релаксация, индуцированная парамагнитными ионами
Аденилатциклаза и циклический АМР
Реакции множественного замещения и сопряжение реакций расщепления АТР с эндергоническими процессами
Перенос фосфатной, пирофосфатной и аденилатной групп от АТР
Общий механизм образования тиоэфиров, сложных эфиров и амидов
Конформационные изменения, индуцируемые фосфорилированием
Реакции присоединения и элиминирования
Присоединение к поляризованным двойным связям (реакция типа 2.А, табл. 7-1)
Стереохимия и обозначение сторон тригональных атомов углерода
Присоединение к двойной связи, сопряженной с карбонильной группой (реакции типа 2.Б.)
Присоединение к двойным связям, находящимся по соседству с карбоксильными группами
Присоединение к изолированным двойным связям
Элиминирование, сопряженное с декарбоксилированием
Обратимость реакций присоединения и элиминирования
Енольные промежуточные соединения в реакциях изомеризации
Перенос протонов, контролируемый диффузией
Раскрытие цикла, катализируемое изомеразами
Другие изомеразы фосфатов сахаров
∆5-3-кетостероид - изомераза и другие ферменты, катализирующие 1,3-миграцию протона
Замещение у карбонильной группы (реакции типа 5.А)
Присоединение енолят-аниона к карбонильной группе или к иминам (реакции типа 5.Б.)
Присоединение енолят-иона к двуокиси углерода (реакция типа 5.В. и обратная ей реакция)
Некоторые реакции изомеризации и перегруппировки
Коферменты - особые природные специализированные реагенты
Коферменты - особые природные специализированные реагенты
Кофермент А и фосфопантетеин
Структура и функции кофермента А
Ацилпереносящие белки и фосфопантетеин
Связанный биотин в роли простетической группы
Другие свойства ферментов, зависимых от биотина
Присоединение биотина к апоферментам
Ферментативные реакции с участием тиамина
Участие тиаминовых коферментов в деятельности нервных клеток
Пиридоксальфосфат в роли катализатора
Основная функция пиридоксальфосфата
Пиридоксаминфосфат в роли кофермента
Стереохимия PLP - зависимых ферментов
Наблюдаемые изменения оптических свойств кофермента
Построение детальной картины действия PLP - зависимого фермента
Кетокислоты и другие необычные электрофильные центры
Гистидин- и фенилаланиндезаминазы (аммиак-лиазы)
Пиридиннуклеотидные коферменты и дегидрогеназы
Прямой перенос атомов водорода
Конформационные изменения, сопровождающие каталитическое действие дегидрогеназ
Глицеральдегид-3-фосфат - дегидрогеназа и образование АТР в реакциях брожения
Некоторые необычные химические свойства пиридиннуклеотидов
Аналоги пиридиновых нуклеотидов
Флавопротеиды и их восстановительные потенциалы
Типичные реакции дегидрирования, катализируемые флавопротеидами
Ковалентно связанные и другие модифицированные флавиновые коферменты
Механизм действия флавиновых дегидрогеназ
Комплексы металлов с флавинами и металлофлавопротеиды
Реакции восстановленных флавинов с кислородом
Липоевая кислота и окислительное декарбоксилирование а-кетокислот
Химические реакции с участием липоевой кислоты
Пируват : ферредоксин - оксидоредуктаза
Окислительное декарбоксилирование перекисью водорода
Пируват-формиат-лиазная реакция
Расщепление а-кетокислот и фосфорилирование на субстратном уровне
Тетрагидрофолиевая кислота и другие птериновые коферменты
Коферментные формы фолиевой кислоты
Одноуглеродные группы и соединения в процессах метаболизма
Коферментные формы витамина В12
Восстановление цианкобаламина и синтез алкилкобаламинов
Три реакции неферментативного расщепления коферментных форм витамина В12
Ферментативные функции В12 коферментов
Стереохимия действия витамин В12-зависимых ферментов
Реакции переноса метильных групп
Организация метаболизма: катаболические пути
Жирные кислоты с разветвленной цепью
Окисление насыщенных углеводородов
Окисление ненасыщенных жирных кислот
Карнитин и проницаемость митохондрий
Цикл трикарбоновых кислот
Эффективный путь расщепления прочной связи
Синтез регенерирующегося субстрата оксалоацетата
Общие свойства каталитических циклов
Катаболизм промежуточных продуктов цикла трикарбоновых кислот
Пути окисления, связанные с циклом трикарбоновых кислот
Окисление оксалата до СО2 через формиат
Катаболизм пропионилкофермента А и пропионата
Катаболические пути, связанные с образованием полуальдегида малоновой кислоты
Метилмалонильный путь утилизации пропионата
Катаболизм сахаров
Образование АТР, сопряженное с окислением субстратов
Брожение: «жизнь без кислорода»
Брожение, основанное на пути Эмбдена - Мейергофа
Маслянокислое и бутанольное брожение
Сбраживание этанола и ацетата в бутират и капроат
Брожение, основанное на фосфоглюконатном и пентозофосфатном путях
Гемопротеиды
Некоторые названия, которые следует запомнить
Хиноны как переносчики водорода
Цепь переноса электронов и окислительное фосфорилирование
Химическая активность митохондрий
Последовательность функционирования переносчиков электронов
Стехиометрия и участки окислительного фосфорилирования
Регуляция дыхания, разобщение и обменные реакции
Термодинамика и «обращенный поток электронов»
Реконструкция фосфорилирующих частиц
Теории окислительного фосфорилирования и модельные эксперименты
Энергозависимые процессы в митохондриях
Транспорт через митохондриальные мембраны
Использование энергии неорганических реакций
Восстановленные неорганические соединения как субстраты дыхания
Перевод жирных кислот в ненасыщенную форму
Биосинтез; как образуются новые молекулы
Метаболические петли и биосинтетические семейства
Ключевые промежуточные соединения и биосинтетические семейства
Сопряжение фосфорилирования с последовательным расщеплением фосфатазой
Карбоксилирование и декарбоксилирование; синтез жирных кислот
Роль восстановителей в реакциях биосинтеза
Обращение окислительной стадии под действием сильного восстановителя
Регуляция восстановительной способности систем, содержащих NAD и NADP
Восстановленный ферредоксин в восстановительном биосинтезе
Биосинтез мономеров
Роль карбонильных групп в образовании и в разрыве цепей
Биосинтез из формиата, формальдегида и метанола
Биосинтез глюкозы (глюкогенез)
Построение углеводородных цепей с двухуглеродными единицами
Цепи кетокислот. Процесс удлинения
Декарбоксилирование как движущая сила в биосинтезе
Стабилизация и прекращение роста цепи путем образования циклов
Образование разветвленных цепей
Биосинтез полимеров и их модификация
Характерные особенности биосинтеза
Необратимая модификация и катаболизм полимеров
Гидроксилирование и другие модификации белков соединительных тканей
Регуляция процессов биосинтеза
Общий взгляд на клеточный метаболизм
Фосфофруктокиназа - ключевой регуляторный фермент
Некоторые частные пути углеводного и липидного обмена
Взаимопревращения моносахаридов
Взаимопревращения нуклеотидсахаров
Инозит и D-глюкуроновая кислота
Превращения фруктозо-6-фосфата
Синтез и утилизация олигосахаридов
Синтез полисахаридов
Высокоспецифические трансферазы
Удлинение цепи путем встраивания
Внутриклеточное расщепление полисахаридов и гликолипидов
Можно ли вылечить лизосомные болезни?
Специальные аспекты метаболизма жирных кислот
Ненасыщенные жирные кислоты и продукты их превращения
Метаболизм триглицеридов, фосфолипидов и гликолипидов
Регуляция метаболизма триглицеридов
Синтез фосфолипидов и гликолипидов
Полипренильные (изопреноидные) соединения