Биохимия - Химические реакции в живой клетке Том 2 - Д. Мецлер 1980
Организация метаболизма: катаболические пути
Окисление жирных кислот
Метаболизм включает в себя необозримое множество различных химических реакций. Многие из них организованы в сложные циклы, в которых иногда трудно разобраться. Однако имеются здесь и логика, и порядок. За небольшим исключением, метаболические пути складываются из последовательно идущих реакций, описанных в гл. 7, 8 и 10 (и подытоженных в табл. 9-1), и каждая такая цепь реакций организована для выполнения определенной химической задачи.
В этой главе мы проанализируем некоторые из основных путей катаболизма питательных веществ и клеточных компонентов. Реакции анаболизма (биосинтеза) будут рассматриваться в последующих главах.
При сгорании углеводородов выделяется значительно больше энергии, чем при сгорании большинства других органических соединений, и неудивительно, что жиры, являющиеся основной формой запасания питательных веществ в организме, имеют в основном углеводородную природу. С энергетической точки зрения наибольшее значение имеют жирнокислотные компоненты. Большинство аэробных клеток способно к полному окислению жирных кислот до СО2 и воды в результате процессов, протекающих в матриксе митохондрий эукариотических клеток.
Местом химической атаки служит окисленный конец жирной кислоты. В качестве первой стадии осуществляется «Пусковая реакция», в ходе которой жирная кислота через последовательность химических превращений S1A(а) [см. табл. 7-2 — Ред.] переходит в форму водорастворимого ацил-СОА-производного — соединения, в котором «активированы» а-водороды жирнокислотных радикалов [уравнение (9-1)]:
Эта реакция катализируется ацетат-тиокиназой [уравнение (7-30)] и другими ацил-СоА — синтетазами — ферментами, активирующими жирные кислоты. Имеется по меньшей мере два типа таких ферментов; одни из них специфичны к углеродным цепям средней длины (от 4 до 12 атомов углерода), другие же — к более длинным цепям. Митохондрии также содержат ацил-СоА — синтетазы [1], способные расщеплять GTP до GDP и Pi — в этом случае осуществляется последовательность реакций SlA(y).
Основные типы метаболических реакций
Реакция |
Таблица (страница) |
Рисунок |
Текст (страница) |
1. Нуклеофильное замещение |
88 |
91 |
|
А. У —CH2Y |
93 |
||
Б. У — СО—Y |
192 |
103 |
|
В. У атома фосфора |
115 |
||
Г. У атома серы |
139 |
||
S1. Последовательное замещение у Р и С, часто сопровождаемое расщеплением АТР. Используется в синтезе эфиров, амидов, тиоэфиров, а также при фосфорилировании на субстратном уровне |
136 |
132 |
|
2. Присоединение |
|||
А. К С = О или C = N |
88 |
140 |
|
Б. К С = С |
145 |
||
3. Элиминирование |
|||
А. С образованием С = О или C = N |
140 |
||
Б. С образованием С = С |
145 |
||
В. С декарбоксилированием 4. Образование енолят-анионов и енаминов и их участие в реакциях изомеризации |
89 |
7-9 |
153 154 |
5. Енолят-анионы в роли нуклеофилов |
89 |
160 |
|
А. Замещение у С = О |
162 |
||
S 5A. Биотинзависимое карбоксилирование |
195 |
194 |
|
Б. Присоединение по С = О (альдольная конденсация) |
7-10 7-11 |
162 |
|
В. Присоединение к СО2(ß-карбоксилирование) |
170 |
||
6. Некоторые структурные перегруппировки 7. Тиаминзависимое а-расщепление S7A. Синтез |
90 |
8-3 |
176 201 |
АТР с участием фосфокетолазы |
8-4 |
206 |
|
S7B. Окислительное декарбоксилирование а-кетокислот |
8-19 |
268 |
|
S7C. Реакция с участием пируват-формиат-лиазы |
8-19 |
274 |
|
8. Реакции шиффовых оснований пиридоксаль-фосфата |
8-6, 8-7 |
209 |
|
9. Реакции переноса водородов и электронов |
239, 257 |
237 |
|
A. NAD+- и NADP+-зависимые |
239 |
8-10 |
240 |
Б. Флавинзависимые |
257 |
8-14 |
253 |
В. Липоатзависимые |
8-18 |
268 |
|
Г. Реакции железо-серных белков |
(10-4)—(10-6) |
379 |
|
Д. Реакции хинонов |
10-8 |
383 |
|
Е. Реакции цитохромов |
10-3 |
373 |
|
Ж. Селензависимое дегидрирование |
331 |
||
S9C. Образование АТР, сопряженное с окислением альдегида |
8-13 |
246 |
|
10. Витамин В12-зависимые реакции |
290 |
283 |
|
Реакции изомеризации |
292 |
||
Реакции, катилизируемые рубоиуклеотидредуктазой |
294 |
||
Реакции переноса метильиой группы |
296 |
||
11. Гидроксилирование Реакции с участием диоксигеназ |
435 |
||
Реакции с участием моноксигеназ (гидрокси- лаз) |
436 |
||
Флавинсодержащих Птеридинозависимых |
437 438 |
||
Кетоглутаратзависимых |
440 |
||
Аскорбатзависимых |
441 |
||
Цитохром P-450-зависимых |
443 |
||
12 Реакции с перекисями |
|||
Окислительное декарбоксилирование |
273 |
||
С участием глутатионпероксидазы |
370 |
||
13. Реакции с участием фолиевой кислоты |
281 |
8-20, 8-21 |
275 |