Биохимия - Химические реакции в живой клетке Том 2 - Д. Мецлер 1980

Ферменты: белковые катализаторы клеток
Механизмы ферментативного катализа
Выводы

Итак, суммируя, можно сказать, что высокая каталитическая способность ферментов обусловлена, во-первых, тем, что ферменты сближают субстраты и связывают их с активным центром в подходящей ориентации. Во-вторых, ферменты содержат кислотные и основные группы ориентированные так, что становится возможным перенос протонов а субстрате. В-третьих, определенные группы в молекуле фермента (особенно нуклеофильные) могут образовывать ковалентные связи с субстратом, что приводит к формированию более реакционноспособных структур, чем субстрат. В-четвертых, фермент способен индуцировать напряжение, или искажение молекулы субстрата, которое часто сопровождается конформационным изменением в белковой молекуле. Нередко спрашивают: почему молекулы ферментов такие большие? Отчасти это, очевидно, связано с тем, что образование поверхности, комплементарной поверхностям субстратов и обладающей необходимой жесткостью, возможно лишь при достаточно сложной геометрии скелета полипептидной молекулы. Кроме того, чтобы функциональные группы фермента могли принимать непосредственное участие в катализе, они должны быть расположены соответствующим образом. Иногда для этого требуется, чтобы в определенном объеме была создана среда с более низкой диэлектрической постоянной. Наконец, имея в виду, что в ходе каталитического процесса происходят конформационные изменения, мы можем только удивляться тому, что природе удалось создать «машину» столь малых размеров.