БИОХИМИЯ - Л. Страйер - 1984
ТОМ 3
Часть IV ИНФОРМАЦИЯ
ГЛАВА 29. ЭУКАРИОТИЧЕСКИЕ ХРОМОСОМЫ И ВЫРАЖЕНИЕ ГЕНОВ У ЭУКАРИОТ
Эукариотическая клетка содержит гораздо больше генетической информации, чем прокариотическая. Например, в клетке человека в 1000 раз больше ДНК, чем в клетке Е. coli, и примерно в 100000 раз больше, чем в одном вирионе фага X. Это изобилие ДНК наделяет эукариот большими потенциальными возможностями, которых нет у прокариот. Другое отличие состоит в том, что ДНК высших организмов ассоциирована с основными белками - гистонами, а хромосомы низших организмов таких белков не содержат. Предназначение этих основных белков - упаковывать ДНК, с тем чтобы при контурной длине, равной многим сантиметрам, она могла бы поместиться в объеме диаметром несколько микрометров. Характерная морфология эукариотических хромосом, которую легко наблюдать в световом микроскопе, показывает, что они организованы значительно сложнее, чем геномы прокариотических клеток. К тому же форма эукариотических хромосом резко меняется в ходе клеточного цикла. Еще одна важная особенность, которая собственно и отличает эукариот от прокариот, состоит в том, что эукариотические хромосомы окружены ядерной мембраной. Этой мембраны у прокариот нет, равно как нет и других внутренних мембран. Благодаря наличию мембраны транскрипция и трансляция у эукариот разделены во времени и в пространстве, тогда как у прокариот они тесно сопряжены. В ядрах высших организмов первичные транскрипты подвергаются значительной модификации, расщепляются и их фрагменты соединяются. Лишь небольшая часть синтезированных в ядре РНК выходят в цитозоль в виде мРНК. Очевидно,
что у эукариот выражение (экспрессия) генов осуществляется значительно более сложным путем, чем у прокариот. Исследования в этой области быстро развиваются, поскольку мы научились выделять и клонировать гены эукариот, определять в них последовательность нуклеотидов и осуществлять их выражение в хорошо изученных системах. По всему чувствуется, что мы находимся на пороге раскрытия одной из важнейших проблем биологии — механизма клеточной дифференцировки.
Рис. 29.1. Фазово-контрастная микрофотография хромосомы типа ламповой щетки из ооцита
29.1. Эукариотическая хромосома содержит одну молекулу двухспиральной ДНК
Можно ли утверждать, что хромосома содержит одну длинную молекулу ДНК? В течение многих лет на этот вопрос было трудно ответить, так как очень длинные молекулы ДНК невероятно чувствительны к разрыву под действием сил сдвига. Бруно Зимм (Bruno Zimm) решил эту проблему с помощью метода вязкостной эластометрии, позволяющего измерять длину самых крупных молекул ДНК в смеси. Молекулы ДНК растягивают в потоке жидко - сти, и затем им дают свернуться в нормальное состояние. Время, за которое свертывается половина молекул, зависит от их молекулярной массы. Клетки плодовых мушек лизировали в камере для измерений, чтобы избежать разрывов ДНК при переносе образцов. Нуклеазы инактивировали, инкубируя образцы в присутствии детергента при 65°С. Кроме того, для гидролиза связанных с ДНК белков добавляли проназу.
Масса самых крупных молекул ДНК в полученной смеси составляла 41 • 106 кДа. Эта величина хорошо согласуется с известным содержанием ДНК в самой большой хромосоме Drosophila melano-gaster - 43 • 106 кДа. Превосходное совпадение результатов наблюдалось также в случае мутанта с транслокацией, затрагивающей самую большую хромосому. В этой хромосоме содержится дополнительный кусок ДНК, благодаря которому содержание ДНК в ней достигает 59 • 106 кДа. Измеренное количество ДНК в этой молекуле составило 58 • 106 кДа. Радиоавтографы ДНК D. melanogaster (рис. 29.2) подтверждают существование очень длинных молекул ДНК. Эти исследования показали, что хромосома дрозофилы содержит одну непрерывную молекулу ДНК. Кроме того, эта молекула ДНК линейная и неразветвленная.
Рис. 29.2. Радиоавтограф молекулы ДНК Drosophila melanogaster. Контурная длина этой ДНК равна 1,2 см
29.2. Эукариотическая ДНК прочно связана с основными белками - гистонами
ДНК эукариотических хромосом находится не в свободном виде, а прочно связана с группой небольших основных белков, называемых гистонами. На долю гистонов приходится около половины массы эукариотических хромосом; вторую половину составляет ДНК. Этот нуклеопротеиновый материал хромосомы называется хроматином. Если обработать хроматин солью или разбавленной кислотой, гистоны и ДНК можно диссоциировать. Образовавшуюся смесь можно затем разделить с помощью ионообменной хроматографии. Гистоны подразделяются на пять типов, обозначаемых соответственно H1, H2A, Н2В, Н3 и Н4. Они имеют массу от 11 до 21 кДа (табл. 29.1). Удивительная особенность гистонов - высокое содержание положительно заряженных боковых цепей: примерно каждый четвертый остаток - лизин или аргинин.
Благодаря посттрансляционным модификациям определенных боковых цепей каждый гистон существует в нескольких формах. Например, лизин-16 гистона Н4 может быть ацетилирован. Кроме того, гистоны могут быть метилированы, ADP-рибозилированы и фосфорилированы. Изменения заряда, способности к образованию водородных связей и формы молекул гистонов в результате таких ковалентных модификаций могут играть важную роль в регуляции доступности ДНК для репликации и транскрипции.
Таблица 29.1. Гистоны