Молекулярная биотехнология. Принципы и применение - Глик Б., Пастернак Дж. 2002

Словарь терминов

Адаптор (Adaptor) 1. Синтетический двухцепочечный олигонуклеотид с одним тупым концом и одним липким. После пришивания адаптера тупым концом к ДНК-мишени последнюю можно встраивать в подходящий вектор, используя приобретенный ею липкий конец. 2. Синтетический одноцепочечный олигонуклеотид, у которого после самогибридизации появляются липкие концы и внутренний сайт для рестрицируюшей эндонуклеазы. Когда адаптор встраивают в клонирующий вектор, у последнего появляется новый сайт рестрикции.

Аденин, A (Adenine) Пуриновое основание, комплементарное тимину и урацилу. Одно из азотистых оснований, входящих в состав ДНК и РНК.

Активатор (Activator) 1. Вещество, стимулирующее транскрипцию специфического гена или оперона. 2. Белок, связывающийся с оператором и ускоряющий транскрипцию; используется также название «активаторный белок».

Актин (Actin) Белок мышечных волокон. Входит в состав актомиозина — основного сократительного мышечного белка.

Аллель (Allele) Одна из двух (или нескольких) альтернативных структурных форм гена.

Аллостерическая регуляция (Allosteric regulation) Регуляция активности фермента, осуществляемая эффекторной молекулой, которая связывается с участком в молекуле фермента, удаленным от активного центра.

Альгинат (Alginate) Полисахарид, синтезируемый различными водорослями и бактериями; состоит из остатков ß-D-маннуроната и а-L-гулуроната.

Альтернативный сплайсинг (Alternative splicing) Соединение экзонов данного гена в разных комбинациях с образованием различающихся зрелых молекул мРНК.

Аминоацил-тРНК (Aminoacyl-tRNA) Молекула тРНК, к 3'-концу которой присоединена специфическая аминокислота.

Аминоацильный сайт, A-сайт (Arainoacyl site) Участок рибосомы, связывающий аминоцил-тРНК в процессе трансляции.

Аминокислота (Amino acid) Мономерная единица («строительный блок») белковых молекул.

Ампликон (Amplicon) Плазмидный вектор вируса простого герпеса типа 1.

Анаэробные микроорганизмы (Anaerobes) Микроорганизмы, растущие в отсутствие кислорода.

Антибиотик (Antibiotic) Вещество, синтезируемое одним микроорганизмом и оказывающее ингибирующее действие на другие микроорганизмы и раковые клетки.

Антиген (Antigen) Вещество, воспринимаемое организмом как чужеродное и вызывающее специфический иммунный ответ — выработку антител.

Антикодон (Anticodon) Триплет нуклеотидов в молекуле тРНК, комплементарный нуклеотидам специфического кодона в молекуле мРНК.

Антипараллельная ориентация (Antiparallel orientation)

Противоположная направленность (5'→3' и 3'→5') цепей в двухцепочечных молекулах нуклеиновых кислот.

«Антисмысловая» РНК (Antisense RNA) РНК-последовательность, комплементарная какому-то участку или всей молекуле специфической мРНК.

«Антисмысловая» цепь (Antisense chain) 1. Транскрибируемая (кодирующая) цепь в молекуле хромосомной ДНК. 2. Одна из цепей в двухцепочечной молекуле ДНК, нуклеотидная последовательность которой комплементарна таковой у соответствующей мРНК.

Антисыворотка (Antiserum) Жидкая составляющая крови, содержащая антитела.

Антитело (Antibody) Белок (иммуноглобулин), синтезируемый В-лимфоцитами в ответ на попадание в организм различных антигенов и специфически с ними взаимодействующий.

Антифризный белок (Antifreeze protein) Богатый аланином белок, вырабатываемый в печени некоторых водных организмов и предотвращающий замерзание плазмы крови. Обнаружен также в клетках некоторых насекомых, растений и бактерий, где он регулирует образование кристаллов льда при низких температурах.

Аптамер (Aptamer) Синтетический полинуклеотид, связывающийся с белком, в норме не взаимодействующим с нуклеиновыми кислотами.

Аттенуированная (ослабленная) вакцина (Attenuated vaccine) Вакцина, приготовленная с использованием ослабленных тем или иным образом микроорганизмов.

Аутологичные клетки (Autologous cells) Клетки, взятые от данного организма, культивированные, возможно, генетически измененные и вновь введенные в организм-донор.

Аутосома (Autosome) Любая хромосома, не являющаяся половой. В соматических клетках человека присутствуют 22 пары аутосом и одна пара половых хромосом.

Аутосомное наследование (Autosomal inheritance) Не сцепленное с полом наследование какого-либо признака.

Ацилпереиосящий белок (Acyl carrier protein) Низкомолекулярный белок, компонент более крупного комплекса, участвующего в биосинтезе жирных кислот или поликетидов.

Аэробные микроорганизмы (Aerobes) Микроорганизмы, растущие только в присутствии кислорода.

Arabidopsis thaliana Растение с очень небольшим геномом, использующееся в качестве модельной системы для изучения процессов роста и развития.

Бакмцда (Bacmid) Челночный вектор на основе генома AcMNPV, способный существовать в клетках E.coli и клетках насекомых.

Бактериофаг (фаг) (Bacteriophage) Вирус, инфицирующий бактерии.

Бактериоцин (Bacteriocin) Вещество, синтезируемое одним микроорганизмом и убивающее клетки другого микроорганизма.

Баллистическая трансфекция (BiolLstics, Microprojectile bombardment) Введение ДНК в растительные и животные клетки или органеллы с помощью вольфрамовых или золотых шариков. ДНК осаждают, покрывают ею шарики и «обстреливаю» ими клетки.

G-белки (G proteins) Мембранные белки, активизирующиеся после взаимодействия с GTP. Участвуют в передаче сигнала от клеточных рецепторов к ферментам на внутренней поверхности мембран.

Белки теплового шока (Heat-shock proteins) Белки, синтезируемые в ответ на резкое повышение температуры.

Белок одноклеточных организмов, БОО (Single-cell protein) Белковые продукты, синтезируемые монокультурой микроорганизмов и использующиеся в качестве пищевых добавок к рациону животных.

Бетаин (Betaine) Низкомолекулярное соединение, служащее донором метальной группы при биосинтезе метионина.

Библиотека кДНК (cDNA library) Коллекция клонов кДНК, синтезируемых in vitro на матрицах мРНК, происходящих из одной ткани или клеточной популяции.

Бинарная векторная система (Binary vector system)

Двухплазмидная система Agrobacterium, предназначенная для переноса участка Т-ДНК, несущего клонированные гены, в растительные клетки. Гены вирулентности локализованы на одной плазмиде, а встроенный участок Т-ДНК — на другой.

Бинарное деление (Binary fission) Прямое, не связанное с половым процессом разделение прокариотической клетки на примерно одинаковые по размерам дочерние клетки.

Биоаккумуляция (Bioaccumulation) Накопление какого-либо вещества (например, ДДТ) в организмах данной пищевой цепи.

Биодеградация (Bioremediation) Разрушение загрязняющих веществ, попавших с окружающую среду, с помощью живых микроорганизмов.

Биоконтроль (Biocontrol) Процесс, в котором используются живые организмы для ограничения роста и развития патогенных микроорганизмов.

Биомаркер (Biomarker) Биологический признак, который позволяет судить о прогрессировании патологического процесса или об эффективности лечения.

Биомасса (Biomass) 1. Клеточная масса, образующаяся в результате жизнедеятельности живых организмов. 2. Органическое вещество, которое может использоваться как источник энергии или химических соединений.

Биореактор, ферментер (Bioreactor) Устройство, в котором протекают биохимические реакции при участии живых микроорганизмов, клеточных экстрактов или ферментов. Часто этот термин относится к сосуду, в котором растут микроорганизмы.

Биотиновое мечение (Biotin labeling) 1. Присоединение молекулы биотина к молекуле другого вещества. 2. Включение биотинсодержащего нуклеотида в молекулу ДНК.

Блоттинг (Blotting) Перенос разделенных молекул из одной среды (например, геля) на твердый носитель (бумагу, нитроцеллюлозный фильтр).

Праймер-опосредованная прогулка («блуждающая затравка») (Primer walking) Один из методов секвенирования протяженных сегментов ДНК (>1 т.п.н.) с использованием праймера (затравки), комплементарного концу уже известной последовательности. На основании данных, полученных на первом этапе, синтезируют новый праймер, перекрывающийся с концом уже секвенированного участка, и используют его для определения нуклеотидной последовательности следующего участка клонированной ДНК. Эту процедуру повторяют до тех пор, пока не секвенируют весь сегмент.

Бокс Прибнова (Pribnow box) Нуклеотидная последовательность у прокариот, расположенная за 10 нуклеотидов до сайта инициации транскрипции. Обычно состоит из 6 нуклеотидов: ТАТААТ.

Бокс Хогнесса (Hogness fox) Нуклеотидная последовательность у эукариот, расположенная за 25 нуклеотидов до сайта инициации транскрипции. Обычно состоит из 8 нуклеотидов.

Бреть, пробел (Gap) Отсутствие одного или нескольких нуклеотидов в одной из цепей двухцепочечной ДНК.

Быстрая амплификация концов кДНК, RASE (Rapid amplification of cDNA ends) Получение двухцепочечньтх концевых участков кДНК, комплементарных 3'- или 5'-концам молекул специфических мРНК (3'RACE или 5'RACE соответственно).

Вакцинация (Vaccination, preventive immunization) Введение в организм антигена с тем, чтобы индуцировать в нем выработку антител к возможному инфицирующему агенту.

Вариабельные домены (Variable domains) Участки полипептидных цепей антитела, имеющие неодинаковую аминокислотную последовательность у молекул разных антител. Отвечают за антигенную специфичность последних.

Вектор (Vector) Самореплицирующаяся молекула ДНК (например, бактериальная плазмида), используемая в генной инженерии для переноса генов от организма-донора в организм-реципиент, а также для клонирования нуклеотидных последовательностей.

Вестерн-блоттинг (Western blotting) Перенос белковых молекул, разделенных с помощью гель-электрофореза, на твердую подложку.

Вирион (Virion) Вирусная частица.

Вирулентность (Virulence) Характеристика патогенности микроорганизма.

Вирус-помощник (Helper virus) Вирулентный штамм вируса, в присутствии которого дефектный вирус может размножаться в клетке-хозяине.

Внутренний сайт связывания рибосомы, IRES (Internal ribosomal entry site) Нетранслируемая последовательность, расположенная после одного из кодирующих участков полицистронной мРНК, которая связывается с малой рибосомной субчастицей и образует инициирующий комплекс.

Время генерации (Generation time) Время, за которое в популяции одноклеточных организмов удваивается число клеток. Называется также временем удвоения.

Вставка (Insert) Сегмент ДНК, встроенный в клонирующий вектор.

Вторичный метаболит (Secondary metabolite) Вещество, не являющееся обязательным для роста или функционирования клетки, но синтезирующееся в стационарной фазе (обычно участвует в защите клеток или микроорганизмов от тех или иных воздействий).

«Вырожденные» праймеры (Degenerate primers) Синтетические олигонуклеотиды, в одном из сайтов которых находятся разные основания vir-Гены (vir Genes) Группа генов Ti-плазмиды, обеспечивающие перенос Т-ДНК в растительную клетку.

Гамета (Gamete) Репродуктивная гаплоидная клетка многоклеточного организма.

Гаплоидный (Haploid) Термин, характеризующий организм (клетку), у которого имеется один набор хромосом.

Гаплотип (Haplotype) Комбинация аллелей на одной хромосоме диплоидного организма.

Ген (Gene) Транскрибируемый участок хромосомы, кодирующий функциональный белок либо тРНК или рРНК.

Ген «самоубийства», «суицидальный» ген (Suicide gene)

Ген, вызывающий при определенных условиях гибель собственной клетки.

Генетический код (Genetic code) Система записи генетической информации в виде последовательности нуклеотидов, в которой каждые три нуклеотида, составляющие кодон, кодируют одну аминокислоту. Состоит из 64 кодонов, кодирующих все 20 аминокислот и три терминирующих кодона.

Генетический полиморфизм (Genetic polymorphism) Наличие двух или более аллельных форм отдельных генов.

Ген-кандидат (Candidate gene) Структурный ген в геноме человека, мутация в котором лишь предположительно (до получения доказательств) является причиной конкретного наследственного заболевания.

Ген-митень (Target gene) 1. Клонированный ген. 2. Ген, подвергаемый специфическому воздействию. 3. Ген, интересующий исследователя.

Генная иммунизация (Genetic immunization) Индукция у организма иммунного ответа без введения антигена, путем включения в клетки гена, кодирующего белок- антиген.

Генная терапия ex vivo (Ex vivo gene therapy) Введение гена (или генов) в изолированные клетки больного. После культивирования и трансформации клетки вводят в организм больного с помощью трансфузии, инфузии или инъекции. Эта процедура позволяет устранять генетические дефекты.

Г енная терапия in vivo (In vivo gene therapy) Введение гена (генов) непосредственно в ткань или орган с целью устранения генетического нарушения.

Генная терапия с использованием клеток зародышевой линии (Germ line gene therapy) Введение гена (генов) в оплодотворенное яйцо или клетки эмбриона на ранней стадии. Чужеродный ген оказывается в ядрах всех клеток развивающегося организма, в том числе половых, и изменяет его фенотип.

Генная терапия с использованием «антисмысловых» последовательностей (Antisence therapy) Лечение in vivo генетического заболевания путем блокирования синтеза

белка включением в геном нуклеотидной последовательности, комплементарной специфической мРНК.

Генная терапия соматических клеток (Somatic cell gene therapy) Введение гена в клетку, отличную от половой, с целью коррекции генетического дефекта.

Геном (Genome) Совокупность генов гаплоидного набора хромосом данного организма.

Геномная библиотека, банк (библиотека) генов (Genome library) Набор клонированных фрагментов ДНК, в совокупности составляющих индивидуальный (групповой, видовой) геном. Если речь идет о крупном геноме (млекопитающие), то получают хромосомоспецифичные библиотеки.

Генотип (Genotype) Генетическая конструкция организма, набор всех его аллелей.

Генотинирование (Genotyping) Определение всех аллелей всех локусов данной хромосомы.

Ген-регулятор (Regulator gene, repressor gene) Ген, кодирующий белок-репрессор, который связывается с оператором и регулирует транскрипцию «своего» оперона.

Ген-репортер (Reporter gene) Ген, кодирующий легко выявляемый продукт. Такие гены используют, например, для того, чтобы убедиться, что данная генетическая конструкция успешно введена в клетку, орган или ткань.

Гены «домашнего хозяйства» (Housefold genes) Набор основных структурных генов, обеспечивающих жизнедеятельность клетки.

Гетерозигота (Heterozygote) Организм, в геноме которого имеются одна или несколько пар различающихся аллелей.

Гетерологичный зонд (Heterologous probe) Сегмент ДНК одного организма, использующийся для скрининга библиотеки сходных ДНК другого организма.

Гетеромерный белок (Heteromeric protein) Белок, состоящий из двух и более разных полипептидных цепей (субъединиц).

Гибридизация (Hybridization) Отжиг двух полинуклеотидных цепей, часто из разных источников, с образованием ДНК/РНК- или ДНК/ДНК-гибридов, стабилизируемых водородными связями.

Гибридизация ДНК (DNA hybridization) Спаривание двух молекул ДНК, часто из разных источников, благодаря образованию водородных связей между комплементарными нуклеотидами. Используется для выявления специфических нуклеотидных последовательностей в препарате ДНК.

Гибридный белок, химерный белок (Fusion protein) Продукт клонированных совместно двух или более кодирующих последовательностей из разных генов. Представляет собой одну полипептидную цепь.

Гибридный ген (Hybrid gene, chimeric gene) Ген, состоящий из частей двух или нескольких генов и экспрессирующийся как единое целое с образованием гибридного (химерного) белка.

Гибридома (Hybridoma) Гибридная клеточная линия, полученная при слиянии нормальных антителообразующих клеток (лимфоцитов) и миеломных клеток. Обладает способностью к неограниченному росту и синтезу моноклональных антител.

3'-гидроксильная группа (3'-hydroxyl group) Гидроксильная группа, связанная с 3'-атомом углерода сахарного остатка (рибозы или дезоксирибозы) концевого нуклеотида молекулы нуклеиновой кислоты.

Гипервариабельный участок (Hypervariable region) Сайт вариабельной части тяжелой или легкой цепи молекулы иммуноглобулина, характеризующийся большей изменчивостью у антител разной специфичности по сравнению с другими ее сегментами - каркасными участками.

Гликозилирование (Glycosylation) Ковалентное присоединение сахарного остатка к белковой молекуле.

β-1,3-глюканаза (ß-1,3-giucanase) Растительный фермент, синтезируемый клетками растений в ответ на проникновение в них патогенных грибов. Гидролизует определенные компоненты клеточной стенки последних. Синтезируется также некоторыми бактериями.

Гомодимерный белок (Homodimeric protein) Белок, состоящий из двух идентичных полипетидных цепей (субъединиц).

Гомозигота по доминантному гену (Homozygous dominant) Организм, у которого оба аллеля данного локуса доминантны.

Гомозигота по рецессивному гену (Homozygous recessive)

Организм, у которого оба аллеля данного локуса рецессивны.

Гомозиготность (Homozigosis) Наличие идентичных аллелей в одном или нескольких локусах. Клетка или организм с такими аллелями называется гомозиготой.

Гомологичные хромосомы (Homologous chromosomes) Хромосомы, включающие идентичные наборы генов, одинаково расположенных друг относительно друга. Образуются в результате дупликации пар родительских хромосом.

Гомологичные (Homologous) Происходящие из одного источника или имеющие сходную структуру или эволюционное происхождение.

Гомомерный белок (Homomeric protein) Белок, состоящий из двух или более идентичных полипептидных цепей (субъединиц).

Гомополимер (Homopolymer) Полимер, состоящий из одинаковых мономерных единиц.

Группа несовместимости (Incompatibility group) Группа плазмид, представители которых могут сосуществовать в одной клетке.

Группа совместимости (Compatibility group) Группа плазмид, члены которой не способны сосуществовать в одной бактериальной клетке.

Гуанин, G (Guanine) Пуриновое основание, комплементарное цитозину. Одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК и РНК.

Гуморальный иммунный ответ (Humoral immune response)

Синтез антител В-клетками иммунной системы в ответ на присутствие в организме чужеродных антител.

Двойная гетерозигота (Double heterozygote) Организм, гетерозиготный одновременно по двум генным локусам.

Двойной кроссинговер (Double crossingover) Кроссинговер, происходящий одновременно в двух точках пары гомологичных хромосом.

Двухцистроииый вектор (Dicistronic vector) Клонирующий вектор, предназначенный для экспрессии двух генов в одной клетке млекопитающих. Гены находятся под контролем одного промотора и сигнала полиаденилирования.

Дегалогенирование (Degalogenation) Отщепление атома галогена (хлора, иода, брома, фтора), обычно при биодеградации.

Дезоксирибоза (Deoxyribose) Пятиуглеродный моносахарид, входящий в состав ДНК.

Дезоксирибозим (Deoxyribozyme) Молекула ДНК, обладающая каталитической активностью.

Дезоксирибонуклеаза I, ДНКаза I (Deoxyribonuclease I, DNase I) Фермент, расщепляющий двухцепочечную ДНК. Используется для очистки препаратов РНК и бесклеточных экстрактов.

Дезоксирибонуклеиновая кислота, ДНК (Deoxyribonucleic acid, DNA) Полимер, состоящий из дезоксирибонуклеотидов; видоспецифичный носитель генетической информации.

Деления (Deletion) Выпадение участка хромосомы из ее внутренней области.

Денатурация (Denaturation) 1. Расхождение цепей двухцепочечной молекулы ДНК или РНК. 2. Нарушение нативной конформации биологических макромолекул в результате разрушения нековалентных (водородных) связей.

Деренрессия (Derepression) Индукция транскрипции гена в результате подавления функций репрессора — блокирования его связывания с промотором.

Диазотроф (Diazotroph) Организм, способный фиксировать азот.

Диаминопимелиновая кислота (Diaminopimelic acid) Непосредственный предшественник L-лизина у бактерий и растений, один из компонентов клеточной стенки у некоторых бактерий.

Дигидрофолатредуктаза (Dihydrofolatereductase) Фермент, катализирующий образование тетрагидрофолиевой кислоты.

Дидезоксинуклеотид, ddNTP (Dideoxynucleotide) Полученный искусственным путем нуклеозидтрифосфат, лишенный 2'- и З'-гидроксильных групп при углеродных атомах сахарного кольца.

Дикий тип (Wild type) Наиболее часто встречающийся в природной популяции фенотип с признаками, детерминируемыми «нормальными» (немутантными) аллелями.

Диплоид (Diploid) Организм, клетки которого содержат два гомологичных набора хромосом.

Дисульфидная связь (Disulphide bond) Ковалентная связь между двумя атомами серы, входящими в молекулы цистеина. Стабилизирует третичную структуру полипептидных цепей.

Дитиотрейтол (Dithiothreitol) Низкомолекулярный ти- олсодержащий восстанавливающий агент. Добавляется в буферные растворы в низкой концентрации для предотвращения окисления сульфгидрильных групп в белках. В высоких концентрациях используется для восстановления дисульфидных связей.

Длинные концевые повторы, LTR (Long terminal repeats)

Прямые повторяющиеся последовательности на концах ДНК-копии генома ретровирусов.

ДНК-зонд (DNA probe) Фрагмент ДНК, меченный тем или иным образом и использующийся для гибридизации со специфическим участком в молекуле ДНК. Позволяет идентифицировать комплементарные ему нуклеотидные последовательности.

ДНК-лигаза (DNA lygase) Фермент, катализирующий образование фосфодиэфирной связи между 3'-гидроксильной группой и 5'-фосфатом соседних нуклеотидов в месте одноцепочечного разрыва молекулы ДНК.

ДНК-маркирующий сайт, STS (Sequence tagged site)

Уникальный для данного локуса олигонуклеотид, который может использоваться для его идентификации методом ПЦР.

ДНК-полимераза (DNA polymerase) Фермент, катализирующий синтез полинуклеотидной цепи из отдельных нуклеотидов с использованием другой цепи в качестве матрицы и ДНК-затравки со свободной З'-ОН-группой.

ДНК-полимераза Taq (Taq DNA polymerase) Термостабильная ДНК-полимераза (сохраняет активность при 95 °С) бактерии Thermits aquaficus. Часто применяется в методе ПЦР.

Додецилсульфат натрия (Sodium dodecyl sulfate) Анионный детергент, использующийся для денатурации белков.

Домен (Domain) Участок полипептидной цепи, выполняющий определенную функцию (например, цитоплазматический домен, трансмембранный домен и т.д.).

Доминантный ген (Dominant gene) Ген, проявляющийся в фенотипе независимо от присутствия в геноме другого аллеля этого гена.

Доминирование, доминантность (Dominancy) Участие только одного аллеля в определении признака у гетерозиготной особи.

Емкость вектора (Vector capacity) Максимальный размер участка ДНК, который может быть клонирован в данном векторе.

Енолаза (Enolase) Фермент, катализирующий превращение 2-фосфоглицерата в фосфоенолпируват.

Енолредуктаза (Enolreductase) Фермент, участвующий в синтезе поликетидных антибиотиков.

Животное-основатель (Founder animal) Организм, несущий чужеродный ген в клетках зародышевой линии, который при спаривании дает начало чистой линии трансгенных организмов.

Заместительная терапия (Replacement therapy) Введение в организм метаболитов, кофакторов, гормонов, восполняющих их дефицит, обусловленный генетическим дефектом.

Зонд (Probe) 1. Соединение, меченное тем или иным способом и использующееся для выявления родственных биохимических молекул в сложном образце. 2. Олигонуклеотид, использующийся для выявления комплементарных последовательностей с помощью гибридизации.

Изопропил-β-D-тиогалактопиранозид, ИПТГ (Isopropyl- ß-D-thiogalactopyranoside) Индуктор lac-(лактозного) оперона. В технологии рекомбинантных ДНК используется для индукции клонированных генов, находящихся под контролем системы lac-репрессор—laс-промотор.

Иммунотерапия (Immunotherapeutic procedure) Использование антитела или химерного белка, содержащего сайт связывания антитела, дія лечения больного или облегчения его состояния.

Иммунный ответ (Immune response) Совокупность физиологических процессов в организме, индуцируемых при попадании в него чужеродных антигенов.

Иммуноаффинная хроматография (Immunoafiinity chromatography) Метод очистки, при котором фиксированное на матрице антитело связывает специфический белок, присутствующий в сложной смеси других белков.

Иммунологический анализ (Immunoassay) Метод, основанный на способности антитела узнавать специфический компонент в биологическом образце.

Иммунологический скрининг (Screening by immunological assay) Скрининг геномной библиотеки, основанный на выявлении продукта гена-мишени иммунологическими методами. Проводится в отсутствие подходящего ДНК-зонда.

Иммуносупрессия (Immunosupression) Потеря способности иммунной системы организма к иммунному ответу на тот или иной антиген.

Иммунотоксин (Immunotoxin) Химерный белок, состоящий из двух доменов, один из которых обладает свойствами антитела, а другой — токсина. Первый домен

обеспечивает связывание химерного белка со специфической молекулой или клеткой, а второй инактивирует молекулу-мишень или убивает клетку.

Ингибирование конечным продуктом (End-product inhibition) Ингибирование фермента метаболитом — конечным продуктом метаболического пути.

Индолил-3-уксусная кислота, ИУК (Indole-3-acetic acid) Растительный гормон, относящийся к классу ауксинов, стимулирующий рост растений.

Индуктор (Inducer, Inductor) Небольшая молекула, связывающаяся с регуляторным белком-репрессором, что приводит к дерепрессии соответствующих генов.

Индукция (Induction) Дерепрессия гена или группы генов под действием индуктора.

Инициация (Initiation) Начало синтеза биополимера.

Инициирующий кодон (Initiation codon) Кодон AUG в составе мРНК, кодирующий метионин (N-формилме- тионин у прокариот), с которого начинается (инициируется) синтез полипептидных цепей. Другое название — сигнал инициации трансляции.

Инициирующий комплекс (Initiation complex) Структура, необходимая для инициации синтеза полипептидной цепи рибосомами. Состоит из малой (30S) субчастицы рибосомы, инициирующих факторов, формилметиониновой тРНК, GTP и транслируемой мРНК.

Инсектицид (Insecticide) Вещество или живой организм, убивающие насекомых.

Интеграция (Integration) Встраивание чужеродной ДНК (обычно с помощью гомологичной рекомбинации) в хромосому хозяйской клетки.

Интегрирующий вектор (Integrating vector) Вектор, специально сконструированный для того, чтобы с его помощью можно было встраивать (интегрировать) клонированную ДНК в геном клетки-хозяина.

Интерлейкин-2 (Interleukin-2) Лимфокин, секретируемый некоторыми Т-лимфоцитами и стимулирующий пролиферацию Т-клеток.

Нитрон (Intron) Транскрибируемый участок гена, не содержащий кодонов и вырезаемый из первичного транскрипта в ходе процессинга с образованием функциональной РНК.

Ионный канал (Ion channel) Трансмембранный белок, облегчающий транспорт определенных ионов.

Исключение (Excision) Вырезание сегмента ДНК из хромосомы или клонирующего вектора, осуществляемое in vivo или in vitro с помощью специфического фермента.

Искусственная бактериальная хромосома, ВАС (Bacterial artificial chromosome) Векторная система на основе F-плазмиды E.coli, использующаяся для клонирования длинных (100—300 т.п.н.) последовательностей.

Искусственная дрожжевая хромосома, YAC (Yeast artificial chromosome) Рекомбинантная ДНК, состоящая из дрожжевой плазмиды и интегрированных в нее центромерных и теломерных областей хромосом дрожжей и маркерных генов и содержащая несколько сайтов инициации репликации.

Искусственная хромосома P1 (P1 artificial chromosome)

Векторная система на основе фага Р1, использующаяся для введения в клетки E.coli вектора с крупной вставкой (100—300 т.п.н.) с помощью электропорации.

Искусственная хромосома человека, НАС (Human artificial chromosome) Хромосома, полученная объединением теломеры, центромеры и участков геномной ДНК человека.

Кандидатное картирование (Candidate gene cloning)

Стратегия идентификации гена конкретного заболевания, основанная на данных о возможном продукте данного гена.

Капсид (Capsid) Белковая оболочка вирусной частицы.

Картирование генов (Gene mapping) Определение положения данного гена на хромосоме относительно других генов.

Кассета (Cassette) Группа тандемных тесно сцепленных, функционально связанных локусов. Пример — кассетная модель половых типов у дрожжей.

ß-Кеторедуктаза (ß-Ketoreductase) Фермент, участвующий в синтезе поликетидных антибиотиков.

Кетосинтаза (Ketosynthase) Низкомолекулярный фермент, один из компонентов комплекса, участвующего в синтезе поликетидов.

В-клетки (В cells) Лимфоциты, продуцирующие антитела и происходящие из клеток костного мозга.

Клетки зародышевой линии (Germ line cells) Клетки, постепенно превращающиеся в гаметы (от первичных половых клеток до собственно гамет).

Клеточная линия (Cell line) Группа клеток, поддерживаемая в культуре путем пересевов.

Клеточно-опосредованный (клеточный) иммунитет (Cell- mediated immune response) Иммунные реакции, инициируемые клетками, а не антигенами или другими гуморальными факторами.

Клон (Clone) Популяция клеток или молекул, идентичных одной родоначальной клетке или молекуле.

Клонирование (Cloning) Совокупность процедур, использующихся для получения клонов. Клонирование многоклеточных организмов, например, включает пересадку ядер соматических клеток в оплодотворенное яйцо с удаленным пронуклеусом.

Клонирование генов (Gene cloning) Система методов, использующаяся для получения клонированных ДНК: выделение нужного гена из какого-либо организма, встраивание его в плазмиду (вектор), введение в клетку организма-хозяина, многократная репликация.

Клонирующий вектор (Cloning vector) Молекула ДНК (плазмидная или вирусная ДНК), предназначенная для клонирования ДНК-мишени.

Кодон (Codon) Три соседних нуклеотида, кодирующих определенную аминокислоту. Всего существует 64 сочетания нуклеотидов в кодонах; 61 из них кодируют 20 аминокислот, 3 являются нонсенс-кодонами.

Коинтегративная векторная система (Cointegrative vector system) Двухплазмидная система, использующаяся для переноса клонированных генов в растительные клетки. Клонирующий вектор несет участок Т-ДНК, содержащий клонированный ген. После введения в клетку Agrobacterium он подвергается гомологичной рекомбинации с резидентной «разоруженной» (неонкогенной) Ті-плазмидой с образованием одной плазмиды, несущей генетическую информацию, необходимую для переноса генетически измененной области Т-ДНК в растительную клетку.

Комбинаторная библиотека (Combinatorial library) Библиотека, полученная встраиванием в вектор на основе фага X кДНК легкой и тяжелой цепей различных антител — по одной комбинации в вектор.

Компетенция (Competence) Способность бактериальных клеток воспринимать трансформирующую ДНК (обычно плазмиду).

Комплемент (Complement) Белковый комплекс сыворотки крови, один из составляющих врожденного иммунитета. Принимает участие в регуляции воспалительных процессов, активации фагоцитоза и литическом действии на клеточные мембраны. Активизируется взаимодействием с иммунным комплексом.

Комплементарная ДНК, кДНК (Complementary DNA)

Молекула ДНК, синтезированная на РНК-матрице с участием РНК-зависимой ДНК-полимеразы (обратной транскриптазы).

Комплементарные нуклеотидные последовательности (Complementary base sequences) Полинуклеотидные последовательности, которые взаимодействуют между собой в соответствии с правилами спаривания оснований: аденин (А) образует пару с тимином (Т) [или урацилом (U) в РНК], гуанин (G) — с цитозином (С).

Комплементарный гомополимерный «хвост» (Homopolymeric tail) Гомополимер из дезоксирибонуклеозидмонофосфатов, присоединяемый к 3'-ОН-концам обеих цепей фрагмента ДНК с тупыми концами. Создание комплементарных «хвостов» [например, poly(A) во встраиваемом фрагменте ДНК и poly(T) в векторе] позволяет клонировать фрагмент в составе рекомбинантной плазмиды.

Комплементация (Complementation) Восстановление фенотипа дикого типа (или близкого к нему фенотипа) при объединении в одной клетке двух ДНК с двумя рецессивными мутациями, находящимися в транс-конфигурации.

Конкатемерные молекулы (Concatemeric molecules) Длинные молекулы ДНК, состоящие из нескольких тандемно повторяющихся единиц. В такой форме находится геном некоторых фагов во время репликации.

Константа Михаэлиса, КМ (Michaelis constant, КМ) Кинетический параметр ферментативной реакции, численно равный концентрации субстрата, при которой скорость реакции составляет половину максимальной. Характеризует сродство фермента к субстрату. Чем ниже КМ, тем прочнее связывание между субстратом и ферментом.

Константный домен (Constant domain) Неизменная для данного класса иммуноглобулинов часть полипептидной цепи (легкой или тяжелой).

Конститутивный синтез (Constitutive synthesis) Постоянно происходящий в клетке или целом организме синтез РНК или какого-либо белка.

Контиг (Contig) Непрерывный набор клонов, охватывающих данную область хромосомы или всю хромосому.

Контрансфекция (Contransfection) Введение в одну эукариотическую клетку двух разных молекул ДНК. В случае системы экспрессии на основе бакуловирусов — процедура одновременного введения бакуловируса и вектора в клетки насекомых в культуре.

Конформационный полиморфизм одноцепочечной ДНК, SSCP (Single-strand conformational polymorphism) Различие в конформации одноцепочечных ДНК, отличающихся одна от другой всего одним нуклеотидом. Анализируемые ДНК подвергают денатурации. Денатурированные цепи принимают разную конформацию и при гель-электрофорезе мигрируют с разной скоростью.

Конъюгативные плазмиды (Conjugative plasmids) Плазмиды, способные передаваться от одной клетки другой во время конъюгации.

Конъюгация (Conjugation) Форма полового процесса. У бактерий — однонаправленный перенос ДНК из одной контактирующей клетки в другую.

Корепрессор (Corepressor) Небольшая молекула, связывающаяся с неактивным репрессором (апорепрессором) с образованием комплекса, присоединяющегося к оператору и блокирующего транскрипцию.

Корончатый галл (Crown gall) Опухоль растений, образование которой вызывают бактерии рода Agrobacterium.

Короткий концевой повтор, STR (Short tandem repeat)

Концевая нуклеотидная последовательность, состоящая из ди-, три- или тетрануклеотидных повторяющихся элементов.

Косегрегация (Cosegregation) Феномен, состоящий в том, что два признака наследуются совместно, т.е. их гены при крссинговере не разделяются.

Космида (Cosmid) Вектор, объединяющий свойства плазмидного вектора и вектора на основе фага X. Имеет cos-сайты.

Косупрессия (Cosupression) Подавление экспрессии специфического растительного гена при трансформации растения дополнительной копией этого гена, включенной в «смысловой» ориентации.

Кофактор (Cofactor) Низкомолекулярное вещество, необходимое для протекания определенной ферментативной реакции.

Коферментация (Cofermentation) Одновременный рост двух микроорганизмов в одном биореакторе.

Кроссинговер (Crossing-over) Взаимный обмен участками гомологичных хромосом, основанный на разрыве-соединении хроматид и приводящий к новой комбинации аллелей. Называется также рекомбинацией.

Ксенобиотик (Xenobiotic) Соединение, полученное искусственным путем, а не синтезированное живым организмом.

Ксилоза (Xylose) Пятиуглеродный сахар, основной компонент гемицеллюлозы.

Культура (Culture) Популяция клеток или микроорганизмов, выращиваемых в контролируемых условиях in vitro.

Культуральная среда (Culture medium) Твердая или жидкая среда, использующаяся для выращивания микроорганизмов in vitro.

«Кэп» (Сар) Метилированный гуанозин на 5'-конце многих мРНК эукариот.

Константа скорости ферментативной реакции. Чем выше эта величина, тем быстрее субстрат превращается в продукт.

k_cat/K_M Каталитическая эффективность ферментативной реакции. Чем она выше, тем быстрее и эффективнее субстрат превращается в продукт.

«Левый» элемент оперена (Upstream) Условное название участка оперона, расположенного перед сайтом инициации транскрипции, в направлении 5' от него. Обычно первое транскрибируемое основание оперона обозначается +1, а все «левые» элементы — цифрами со знаком «—».

Лигирование (Ligation) Соединение двух молекул ДНК с помощью фосфодиэфирных связей. In vitro катализируется ферментом ДНК-лигазой фага Т4.

Лигирование олигонуклеотидных зондов, ЛОЗ (Oligonucleotide ligation assay) Метод выявления однонуклеотидных замен в гене-мишени с помощью коротких олигонуклеотидов, комплементарных противоположным цепям тестируемого отрезка ДНК. Если замена отсутствует, то оба олигонуклеотида полностью гибридизуются с ДНК, и после добавления в реакционную смесь ДНК-лигазы происходит их сшивание (лигирование). В противном случае сшивание оказывается невозможным.

Лигноцеллюлоза (Lignocellulose) Комплекс лигнина, гемицеллюлозы и целлюлозы, составляющий структурный каркас клеточной стенки растений.

Лидерная последовательность (Leader sequence) Нетранслируемая последовательность мРНК, расположенная между 5'-концом и инициирующим кодоном AUG.

Лизис (Lysis) Разрушение клеточных стенок под действием ферментов, содержащихся в лизосомах, или других агентов.

Лизогения (Lysogeny) Интеграция генома бактериофага в геном клетки-хозяина. В результате индукции вирусная ДНК может выщепляться с образованием зрелых фаговых частиц.

Линкер (Linker) Синтетический олигонуклеотид, содержащий сайт рестрикции. Используется для соединения векторной и клонируемой ДНК, к концам которой по методу сшивания тупых концов присоединены линкеры.

Липаза (Lipase) Фермент, расщепляющий липиды.

Липкие концы (Cohesive ends) Взаимно комплементарные одноцепочные участки ДНК, выступающие по концам двухцепочечной молекулы; образуются в результате ступенчатых разрезов двухцепочечных ДНК.

Липополисахарид (Lipopolysaccharide) Соединение, содержащее липид, связанный с полисахаридом. Один из компонентов клеточной стенки бактерий.

Липосома (Liposome) Пузырек, образуемый одно- или двухслойной мембраной, состоящей из липидных молекул. Гидрофобная часть этих молекул обращена внутрь пузырька, гидрофильная — наружу. Внутри пузырька могут находиться нуклеиновые кислоты, лекарственные вещества и т.д., адресно доставляемые липосомой.

Литический цикл (Lytic cycle) Размножение вируса в клетке-хозяине, оканчивающееся лизисом клетки.

Локус (Locus) Место на хромосоме, где находится специфический ген.

Макромолекула (Macromolecule) Полимер с мол. массой от нескольких тысяч до сотен млн. дальтон (белки, нуклеиновые кислоты, полисахариды и т.д.).

Макрофаг (Macrophage) Крупный лейкоцит, обладающий способностью к фагоцитозу.

Маркерные экспрессируемые последовательности, EST (Expressed sequence tag) Короткие маркерные последовательности, характерные для каждого экспрессируемого гена человека. Позволяют изучать размеры, разнообразие и транскрипционную активность экспрессирующихся генов человека.

Маркерный ген (Marker gene) Ген с известной хромосомной локализацией, имеющий четкое фенотипическое проявление (устойчивость к антибиотику, ферментативная активность и т.д.).

Маркерный пептид (Marker peptid) Участок гибридной белковой молекулы, облегчающий идентификацию или очистку белка.

Матричная РНК, мРНК (Messenger RNA) Молекула РНК, в которой заключена информация об аминокислотной последовательности определенной белковой молекулы.

Матричная цепь (Template strand) Цепь ДНК или другой полинуклеотид, использующийся ДНК-полимеразой в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи.

Мезофильные микроорганизмы (Mesophile) Организмы, способные расти при температурах от 20 до 50 °С; оптимальная температура роста 37 °С.

Меристема (Meristematic tissue) Ткань растений, обладающая способностью к активному делению. У молодых растений обычно находится у кончиков корней и побегов.

Метаболизм (Metabolism) Совокупность физических и химических процессов, протекающих в организме и обеспечивающих его существование. Продукты метаболизма называются метаболитами.

Метаболическая перегрузка (Metatotic load) Нарушение метаболизма организма-хозяина в результате введения в его геном и экспрессии чужеродной ДНК.

Метилирование (Methylation) Присоединение к макромолекуле метальной группы. Например, при метилировании ДНК происходит присоединение такой группы к специфическим остаткам цитозина, а иногда аденина.

Метка (Label) Радиоактивный изотоп или идентифицируемый биохимическими либо иммунологическими методами лиганд (например, флуорофор), связывающийся с макромолекулой. Позволяет обнаружить меченое вещество в образце.

Метод отпечатков (реплик) (Replica plating) Перенос колоний микроорганизмов с одной чашки Петри на другую с помощью бархатной «печатки» с полным сохранением взаимного расположения колоний.

Метод случайных праймеров (Random primer method)

Способ получения меченых ДНК-зондов, основанный на применении синтетических олигонуклеотидов, содержащих все возможные комбинации из шести нуклеотидов, и на их гибридизации с денатурированной ДНК-мишенью. Олигонуклеотиды, комплементарные последней, спариваются с ней. В реакционную смесь добавляют все четыре дезоксирибонуклеотида (причем один из них меченый) и фермент, катализирующий синтез фрагментов ДНК с использованием цепей ДНК-мишени в качестве матрицы, а гибридизировавшихся фрагментов — в качестве затравки.

Микроинъекция (Microinjection) Введение в изолированную эукариотическую клетку ДНК или других молекул с помощью тонкой иглы.

Мини-сателлитная ДНК человека (Human minisatellite DNA) Некодирующая ДНК человека, обычно GC-богатая, содержащая тандемные повторы коротких (длиной 9—40 п.п.) сегментов.

Миссенс-мутация (Missense mutation) Мутация, в результате которой кодон, кодирующий какую-либо аминокислоту, изменяется с образованием кодона, кодирующего другую аминокислоту.

Мицелий (Mycelium) Вегетативное тело гриба, состоящее из тонких ветвящихся нитей.

Мишень (Target) В самом широком смысле — биологический объект (ткань, молекула, клетка, микроорганизм), которая интересует исследователя.

Мобилизация (Mobilization) Передача от одной бактериальной клетки другой хромосомных генов либо неконъюгатавных плазмид с участием конъюгативных плазмид.

Мобильным генетический элемент (Transposable element)

Участок ДНК, способный изменить свое положение в геноме. Среди таких элементов различают IS-элементы и транспозоны.

Молекулярная диагностика (Molecular diagnostic) Выявление молекулярно-биологическими методами патогенного микроорганизма, специфического вещества или измененной нуклеотидной последовательности, ответственных за то или иное заболевание.

Моноклональные антитела (Monoclonal antibodies) Однотипные антитела, строго специфичные в отношении одного эпитопа (антигенной детерминанты). Синтезируются гибридомами — клеточными гибридами, полученными при слиянии нормальных антителообразующих клеток с миеломной опухолевой клеткой, способной к неограниченному росту. Некоторые миеломные клетки синтезируют моноклональные тела самостоятельно.

Мультилокусная генетическая карта, карта сцепления (Multipoint map, multilociis linkage шар) Схема взаимного расположения локусов на хромосомах данного организма.

Мутагенез (Mutagenesis) Искусственное введение мутаций с помощью физических или химических агентов.

Мутант (Mutant) Организм, измененный в результате мутации; как правило, отличается от исходной формы (дикого типа).

Мутация (Mutation) Спонтанное или индуцированное изменение структуры гена.

Мутация со сдвигом рамки (Frameshift mutation) Мутация, связанная с появлением лишнего или с потерей одного или нескольких (в числе, не кратном трем) нуклеотидов. Приводит к нарушению триплетного кода и синтезу совершенно другого белка (если только синтез вообще не блокируется).

Нарушение комплементарности (Mismatch, misparing) Наличие в двухцепочечной молекуле ДНК одной или нескольких пар некомплементарных оснований.

Негативная регуляция (Negative control) Тип регуляции, при котором транскрипция гена подавляется регуляторным белком (репрессором); соответственно при инактивации белка-регулятора структурные гены остаются в активном состоянии.

Независимое распределение генов (Independent assortment) Распределение генов, локализованных на разных хромосомах, по гаплоидным гаметам с образованием всех возможных комбинаций генов. Лежит в основе закона Менделя о независимом распределении признаков.

Неметаболизирующиеся индукторы (Gratuitous inducers) Вещества, индуцирующие синтез индуцибельных ферментов, но не являющиеся для них субстратами, а потому остающиеся в исходном виде.

Неомицинфосфотрансфераза (Neomycinphospliotransferase) Фермент, инактивирующий антибиотики неомицин и канамицин. Часто используется как селективный маркер для трансгенных растений.

Неполная пенетрантность (Incomplete penetrance) Частичное проявление конкретного аллеля в группе родственных организмов. Характерна для большинства мутантных аллелей.

Непрерывная ферментация (Continuous fermentation) Культивирование микроорганизмов при непрерывном добавлении в биореактор среды и выведении такого же объема суспензии.

Нозерн-блоттинг (Nothern blotting) Перенос молекул РНК, подвергнутых элктроферезу, с геля на твердую подложку (нитроцеллюлозный или нейлоновый фильтр) с последующей ДНК—РНК-гибридизацией.

«Нокаут» (Knockout) Направленное разрушение гена с помощью гомологичной рекомбинации.

Нуклеаза S1 (S1 nuclease) Фермент, специфически деградирующий одноцепочечную ДНК.

Нуклеозцд (Nucleoside) Пуриновое или пиримидиновое азотистое основание, ковалентно связанное с пятиуглеродным сахаром (пентозой). Если сахаром является рибоза, то мы имеем дело с рибонуклеозидом, а если дезоксирибоза, то с дезоксирибонуклеозидом.

Нуклеотид (Nucleotide) Нуклеозид, к которому присоединена одна или более фосфатных групп; присоединение происходит по 5'-углеродному атому сахарного кольца. Нуклеозиды, связанные с рибозой, называются рибонуклеозидмонофосфатами (rNMP), рибонуклеозидцифосфатами (rNDP) или рибонуклеозидтрифосфатами (rNTP). Для нуклеозидов, связанных с дезоксирибозой, соответствующие названия таковы: дезоксирибонуклеозидмоно-, ди- и трифосфаты (dNMP, dNDP, dNTP).

N-конец (N terminus) Первая аминокислота (или несколько аминокислот) в белковой молекуле.

Обратная транскриптаза (Reverse transcriptase) РНК-зависимая ДНК-полимераза, использующая молекулу РНК в качестве матрицы для синтеза комплементарной цепи ДНК.

Обратная транскрипция—полимеразная цепная реакция (Reverse transcription—polymerase chain reaction) Способ получения в большом количестве кДНК, состоящий из двух этапов. Вначале in vitro синтезируют кДНК, используя обратную транскриптазу, мРНК в качестве матрицы и oligo(dT) в качестве праймера. Затем кДНК амплифицируют с помощью полимеразной цепной реакции (ПЦР), используя два праймера: один комплементарен участку первой цепи кДНК, а второй — другой цепи, комплементарной первой.

Одноцепочечный разрыв (Nick) Разрыв фосфодиэфирной связи между соседними нуклеотидами в одной цепи ДНК.

Окрашивание по Граму (Gram stain) Метод окрашивания микробиологических препаратов, позволяющий идентифицировать две группы бактерий: грамположительные и грамотрицательные. Основан на различии биохимического состава мембран бактериальных клеток.

Олигонуклеотид, олигомер (Oligonucleotide) Короткий (6—10 нуклеотидов) сегмент одноцепочечной ДНК. Обычно получают химическим путем.

Онкоген (Oncogene) Ген, экспрессия которого приводит к неконтролируемой пролиферации (трансформации) клеток.

Оператор (Operator) Участок ДНК, непосредственно примыкающий к структурному гену и регулирующий его транскрипцию при участии репрессора или активатора.

Оперон (Operon) Участок ДНК, содержащий несколько структурных генов, транскрибируемых с образованием одной полицистронной мРНК.

Опин (Opine) Продукт конденсации аминокислоты с кетокислотой и сахаром.

Оптимизация кодонов (Codon optimization) Модификация кодонов данного гена без изменения аминокислотной последовательности кодируемого им белка, направленная на то чтобы кодоны эффективно считывались хозяйским организмом.

Отжиг (Annealing) Процесс образования двухцепочечных молекул (ДНК—ДНК или ДНК—РНК) из одиночных полинуклеотидных комплементарных цепей.

Открытая рамка считывания (Open reading frame) Последовательность нуклеотидов, не содержащая терминирующих кодонов; кодирует полипептид или белок.

«Отпечаток пальцев» (DNA fingerprint) Набор рестрикционных фрагментов ДНК, характерный для данного индивидуума. Для получения «отпечатка» используют либо гель-электрофорез как таковой, либо в сочетании с ПЦР-амплификацией.

Отталкивание (Repulsion) Конфигурация, при которой два мутантных неаллельных гена находятся на разных хромосомах. Аналогично транс-конфигурации. См. также Сопряжение.

Пакующая клеточная линия (Packaging cell line) Клеточная линия, созданная для продуцирования вирусных частиц, не содержащих инфекционной нуклеиновой кислоты.

Палиндром (Palindrome) Участок двухцепочечной молекулы ДНК, обе цепи которого обладают одинаковой нуклеотидной последовательностью при прочитывании от 5'- к 3'- концу. Такие участки часто распознаются рестрицирующими эндонуклеазами типа II.

Параспоральный кристалл (Parasporal crystal) Плотно упакованные молекулы токсина, синтезируемые Bacillus thuringiensis при образовании спор.

Пассивный иммунитет (Passive immunity) Форма иммунитета, возникающая при введении в организм сыворотки, содержащей антитела, выработанные другим организмом в результате активной иммунизации. Наблюдается также у новорожденных.

Патогенез-зависимый промотор (Pathogenesis-related promotor) Промотор растительных генов, активизируемый при инфицировании растения патогенами.

Пенетрантность (Penetrance) Частота проявления данного аллеля в группе родственных организмов. При полной пенетрантности наблюдается проявление аллеля у всех членов выборки.

Пептид (Peptide) Короткая цепочка аминокислот, соединенных пептидными связями.

Пептидил-тРНК (Peptidyl-tRNA) Молекула тРНК с присоединенной к ней растущей полипептидной цепью.

Пептидная вакцина (Peptide vaccine) Короткая цепочка из аминокислот, индуцирующая образование антител к специфическому инфекционному агенту.

Пептидная связь (Peptide bond) Ковалентная связь между свободной карбоксильной группой при a-углеродном атоме одной аминокислоты и свободной карбоксильной группой при таком же атоме соседней аминокислоты в полипептидной цепи.

Первичная культура (Primary culture) Культура клеток или тканей, взятых непосредственно от организма.

Первичный транскрипт (Primary transcript) Молекула РНК, транскрибированная с эукариотического структурного гена и не подвергшаяся процессингу (т.е, содержащая все зкзоны и интроны).

Первое антитело (Primary antibody) Антитело, связывающееся с молекулой-мишенью при проведении иммунологического анализа (например, с помощью метода ELISA).

Периодическая ферментация (Batch fermentation) Культивирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала времени. Свежую среду инокулируют посевным материалом и проводят культивирование в непрерывном режиме, не добавляя новых порций среды и не удаляя продуктов, пока процесс не завершится сам собой.

Периодическая ферментация с добавлением субстрата (Fed-Batch fermentation) Культивирование микроорганизмов в течение ограниченного интервала времени с периодическим добавленим субстрата и сбором продукта только по завершении процесса.

Периплазматическое пространство (Periplasmatic space) Пространство между плазматической мембраной бактериальной клетки и наружной мембраной или клеточной стенкой.

Пиримцдины (Pyrimidine) Один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пиримидинам относятся тимин, цитозин и урацил. Второй тип оснований — пурины; к ним относятся аденин и гуанин.

Пироген (Pyrogen) Вещество, продуцируемое бактериями и вызывающее повышение температуры у человека.

Плазмида (Plasmid) Внехромосомный генетический элемент, способный к длительному автономному существованию и репликации. Обычно это двухцепочечная кольцевая ДНК длиной 1—200 т.п.н.

Плазмида-помощник (Helper plasmid) Плазмида, восполняющая функции другой плазмиды в той же клетке. Некоторые плазмиды-помощники способствуют переносу неконъюгативных плазмид из донорной клетки в реципиентную.

2 мкм-плазмида (2 μm plasmid) Существующая в природных условиях двухцепочечная кольцевая плазмида длиной 6318 п.н., обнаруженная в ядре Saccharomyces cerevisiae. На ее основе получены многие плазмидные векторы для дрожжевых клеток.

Плазмидная несовместимость (Plasmid incompatibility) Механизм регуляции числа копий плазмид одного типа в бактериальной клетке. Обеспечивает невозможность внутриклеточного сосуществования плазмид, принадлежащих к одной группе совместимости.

Плазмовирус (Plasmovirus) Генетическая конструкция, которая содержит ретровирусные гены, находящиеся под контролем 5'-LTR-пpoмотopa, а также «терапевтический» ген и ген env, управляемые цитомегаловирус- ным промотором.

Пластида (Plastid) Органелла растительных клеток (например, хлоропласт). Многие пластиды имеют собственный геном.

Подвид (Subspescies) Группа в пределах вида, обладающая признаками, не характерными для остальной части членов популяции данного вида.

Позитивная регуляция (Positive control) Тип регуляции, при котором регулируемый ген транскрибируется только в присутствии белка-активатора.

Позитивно-негативный отбор (Positive-negative selection) Методика, при которой одновременно происходит отбор клеток, несущих вставку в специфическом хромосомном сайте (позитивный отбор), и «отбраковка» клеток, несущих вставку в другом, неспецифическом сайте.

Позитивный отбор (Positive selection) Отбор клеток по наличию в них маркерного гена, благоприятствующего росту на селективной среде (например, среде с антибиотиком).

Позиционное картирование (Positional gene cloning) Одна из стратегий идентификации гена заболевания в отсутствие данных о продукте этого гена и каких-либо генов-кандидатов. В подобных случаях сначала определяют хромосомную локализацию (позицию) гена. Затем получают геномные клоны, охватывающие картированный сайт (используя соответствующие маркеры), идентифицируют и анализируют присутствующие в них экзоны. Используя целый ряд методов (идентификация GC-островков, улавливание экзонов, секвенирование, компьютерный анализ и т.д.), определяют, какой именно ген ответствен за данное заболевание.

Позиционно-кандидатное картирование (Positional-candidate gene cloning) Одна из стратегий идентификации гена заболевания, когда данные о продукте этого гена отсутствуют, но ген картирован в том же хромосомном районе, что и уже идентифицированные гены и EST. Сначала анализируют современные генетические и транскрипционные карты, с тем чтобы выявить кодирующие последовательности (гены, внутригенные EST), находящиеся в этом районе, затем с помощью мутационного анализа или какими-либо другими методами выявляют экзоны, связанные с данным заболеванием.

Полиаденилирование (Polyadenylation) Ферментативное присоединение остатков аденина к 3'-концу молекулы эукариотической мРНК. Этот богатый аденином 3'-конец называется роlу(А)-хвостом.

Поливалентная вакцина (Multivalent vaccine) Вакцина, дающая иммунный ответ на несколько инфекционных агентов или на разные эпитопы одной молекулы.

Поликетцдсинтаза (Polyketide synthase) Фермент, участвующий в биосинтезе поликетидных антибиотиков.

Поликетцдные антибиотики (Polyketide antibiotics) Класс антибиотиков, которые образуются в результате последовательной ферментативной конденсации карбоновых кислот (ацетата, пропионата и т.д.).

Полилинкер (Polylinker) Короткий участок ДНК, содержащий несколько уникальных сайтов узнавания для эндонуклеаз; в эти сайты встраивают чужеродную ДНК (осуществляют клонирование).

Полимеразная цепная реакция, ПЦР (Polymerase chain reaction) Метод амплификации специфического сегмента ДНК с помощью термостабильной ДНК-полимеразы с использованием олигонукпеотидных ДНК-зондов, комплементарных последовательностям противоположных цепей ДНК, фланкирующим амплифицируемый сегмент. Процесс состоит из серии циклически повторяющихся реакций: денатурации ДНК, отжига зондов, синтеза ДНК.

Полиморфизм длины рестриционных фрагментов, ПДРФ (Restriction fragment length polymorphism; RFLP) Вариабельность длины фрагментов ДНК, образующихся при ее расщеплении рестриктазами. Обусловлена мутационным изменением сайтов рестрикции или появлением новых сайтов. Обнаруживается при разделении фрагментов с помощью гель-электрофореза.

Полиморфизм коротких тандемных повторов, STRP (Short tandem repeat polymorphism) Вариабельность блоков из тандемных ди-, три- или тетрануклеотидных повторяющихся элементов по числу этих элементов при частоте встречаемости блоков в большой популяции не менее 1%. STRP-локусы выявляют с помощью гель-электрофореза после проведения ПЦР с использованием праймеров, комплементарных уникальным последовательностям, фланкирующим данный локус.

Полиморфный сайт (Polymorphic site) Участок хромосомы, представленный в популяции более чем одним вариантом и встречающийся с частотой не менее 1%.

Полинуклеотид (Polynucleotide) Линейный полимер, состоящий из 20 и более нуклеотидов, соединенных друг с другом фосфодиэфирными связями. Полинуклеотидами являются, например, молекулы ДНК и РНК.

Полипептид (Polypeptide) Линейный полимер, состоящий из аминокислот, соединенных друг с другом пептидными связями. Полипептидом является, например, белковая молекула.

Полицистронная мРНК (Multigene RNA, polysistronic message) Молекула мРНК, кодирующая более одного белка. Образуется при транскрипции двух или более соседних генов, входящих в состав одного оперона.

Полиэдрин (Polyhedrin) Белок капсида бакуловирусов; накапливается в больших количествах в ядрах пораженных клеток насекомых.

Полное сцепление (Complete linkage) Совместное наследование двух или более соседних генных локусов в хромосоме. Проявляется отсутствием рекомбинаций между ними и стабильным попаданием в одну гамету при митозе.

Посттрансляционные модификации (Posttranslational modifications) Изменение структуры белковых молекул после завершения их синтеза рибосомами. К таким модификациям относятся: фосфорилирование, гликозилирование, окисление цистеина, отщепление сигнальных последовательностей и т.д.

«Правый» элемент оперона (Downstream) Условное название участка, расположенного после сайта инициации транскрипции, в направлении 3’ от него.

Праймер (Primer) Короткий олигонуклеотид, который гибридизуется с матрицей и служит затравкой при ее копировании.

Предранний ген (Immediate-early gene) Фаговый ген, транскрибируемый сразу же после заражения клеток. Его продукт необходим для транскрипции других генов бактериофага — так называемых задержанноранних и поздних.

«Прогулка по хромосоме» (Chromosome walking) Метод идентификации нуклеотидных последовательностей, фланкирующих известные гены, для которых имеются олигонуклеотидные зонды. Фланкирующие последовательности используются затем в качестве зондов для идентификации прилегающих к ним последовательностей, и т.д.

Проект «Геном человека» (Human Genome Project) Международная программа, целью которой является построение генетической и физической карт генома человека и определение полной нуклеотидной последовательности ДНК.

Прокариоты (Procaryotes) Организмы, у которых нет ограниченных мембранами ядра и органелл. К прокариотам относятся все бактерии.

Промотор (Promoter) Участок молекулы ДНК, с которым связывается РНК-полимераза, что сопровождается инициацией транскрипции соответствующих генов. Обычно находится перед 5'-концом регулируемого гена.

Протеиназы, протеолитические ферменты (Protease) Ферменты, расщепляющие пептидные связи в белковых молекулах.

Протеолиз (Proteolysis) Ферментативное расщепление белков.

Протопласт (Protoplast) Бактериальная, дрожжевая или растительная клетка, стенка которой разрушена ферментативным или химическим путем.

Профаг (Prophage) ДНК бактериофага, интегрированная в геном бактериальной клетки-хозяина и реплицирующаяся вместе с ней.

Процессинг (Processing) Совокупность процессов образования зрелых молекул РНК и белков в клетке. Включает ряд последовательных расщеплений молекулы-предшественника эндонуклеазой или протеиназами.

Прочитывание терминатора, сквозное прочитывание (Readthrough) «Проскакивание» транскрипции через специфический терминатор. Аналогичный термин используется и в отношении трансляции.

«Прыжки по хромосоме» (Chromosome jumping) Один из вариантов метода «прогулки по хромосоме», характеризующийся тем, что в результате мутации маркерный ген, использующийся для скрининга, перемещается (прыгает), что позволяет выявить новые сцепленные с ним гены.

Психрофилы (Psychrophile) Микроорганизмы, способные расти при температуре 0—5 °С.

Пурины (Purine) Один из двух типов азотистых оснований, входящих в состав нуклеиновых кислот; к пуринам относятся аденин и гуанин. Второй тип оснований — пиримидины; к ним относятся тимин, урацил и цитозин.

Pseudomonas широко распространенная грамотрицательная бактерия. Многие ее виды, обитающие в почве, продуцируют пигмент, флуоресцирующий в УФ-свете.

Рамка считывания (Reading frame) Один из трех возможных способов считывания нуклеотидной последовательности в виде триплетов. Открытая рамка считывания не содержит терминирующих кодонов и может транслироваться в белок.

Расстояние на генетической карте (Map distance) Расстояние между двумя генами, определяемое по частоте рекомбинаций на анализируемом участке. За единицу картирования принимают расстояние между генами, вероятность рекомбинации между которыми равна 1% (одной сантиморганиде).

Реактор с механическим перемешиванием (Stirred tank fermenter) Биореактор, в котором для равномерного распределения газа по всему объему используются мешалки.

Регуляторный белок (Regulatory protein) Белок, «включающий» или «выключающий» транскрипцию.

Рекомбинантная ДНК (Recombinant DNA) Молекула ДНК, полученная объединением in vitro разнородных, вместе нигде в природе не существующих, фрагментов ДНК.

Рекомбинантная плазмида (Recombinant plasmid) Плазмида, измененная методами генной инженерии. Состоит из участков разных плазмид либо содержит сегменты ДНК других организмов.

Рекомбинантный белок (Recombinant protein) Белок, кодируемый клонированной рекомбинантной ДНК.

Ренатурация (Renaturation) Воссоединение цепей двухцепочечной ДНК, разошедшихся при денатурации.

Репликативная форма, РФ (Replicative form) Промежуточная форма двухцепочечной вирусной нуклеиновой кислоты, служащая матрицей для синтеза ДНК и РНК. Представляет собой релаксированное (открытое) кольцо

Репликация (Replication, reduplication) Процесс самовоспроизведения (синтеза) ДНК.

Репликация по типу катящегося кольца (Rolling circle model) Процесс репликации кольцевых молекул ДНК с образованием конкатемерной дуплексной ДНК (ДНК, состоящей из нескольких тандемно повторяющихся единиц генома).

Репрессия (Repression) Один из двух альтернативных (наряду с индукцией) механизмов регуляции генов. Состоит в подавлении транскрипции или трансляции путем связывания белка-репрессора с оператором.

Репрессор (Repressor) Белок, связывающийся с оператором или промотором данного гена и блокирующий связывание с этими элементами РНК-полимеразы.

Рестриктаза, рестрицирующая эндонуклеаза (Restriction endonuclease) Бактериальный фермент, расщепляющий двухцепочечную молекулу ДНК в специфических сайтах.

Рестрикционная карта (Restriction шар) Диаграмма расположения на молекуле ДНК сайтов узнавания рестриктазами.

Ретровирусы (Retroviruses) Группа PHК-содержащих вирусов, содержащих обратную транскриптазу; синтезированная на РНК-матрице двухцепочечная ДНК может встраиваться в хромосому инфицированной этим вирусом клетки.

Рецессивный аллель (ген) [Recessive allele (gene)] Аллель, кодирующий признак, который проявляется только у особей, несущих этот аллель в гомозиготном состоянии.

Рибоза (Ribose) Пятиуглеродный моносахарид. Входит в состав РНК.

Рибозим (Ribozyme) Молекула РНК, обладающая ферментативной активностью.

Рибонуклеиновая кислота, РНК (Ribonucleic acid, RNA) Нуклеиновая кислота, состоящая из рибонуклеотидов, у которых сахаром является рибоза, а одним из пиримидинов — урацил (вместо тимина).

Рибосома (Ribosome) Клеточная органелла, рибонуклеопротеидная частица, при участии которой осуществляется синтез белка (трансляция). Состоит из двух субчастиц, большой и малой.

Рибосомная РНК, рРНК (Ribosonial RNA, rRNA) РНК, входящая в состав рибосом.

Рибулозо-1,5-бисфосфат—карбоксилаза (Ribulozo bis-phosphate carboxylase) Наиболее распространенный фермент, присутствующий в тканях всех зеленых растений и ответственный за связывание диоксида углерода на начальном этапе фотосинтеза.

Ризосфера (Rhizosphere) Слой почвы, непосредственно примыкающий к корням растений и характеризующийся повышенным содержанием микроорганизмов.

РНК-полимераза (RNA polymerase, RNA synthetase)

Фермент, осуществляющий синтез РНК из рибонуклеозидтрифосфатов. Матрицей может служить ДНК или РНК, соответствующие РНК-полимеразы называют ДНК- или РНК-зависимыми.

Rec А Бактериальный белок, участвующий в рекомбинации и репарации ДНК.

Rhizobium Вездесущие бактерии, обитающие в корнях растений или в примыкающем к ним слое почвы.

Сайт встраивания (клонирования) (Cloning site) Специфический участок векторной молекулы, в который встраивают фрагмент чужеродной ДНК. Очень часто это уникальный сайт рестрикции.

Сайт рестрикции (Restriction site) Нуклеотидная последовательность в молекуле ДНК, узнаваемая рестриктазой. Обычно представляет собой короткий палиндром.

Сайт-специфический мутагенез (Site-specific mutagenesis) Внесение in vitro мутации в конкретный сайт клонированной последовательности. Позволяет идентифицировать функциональные участки в молекулах белков и получать белки с заранее заданными свойствами. Иногда называется олигонуклеотид-направленным мутагенезом.

Самореплицирующийся элемент (Self-replicating element) Внехромосомная молекула нуклеиновой кислоты, способная к независимой от хромосомной ДНК (автономной) репликации. Примером такого элемента служит плазмида.

Сантиморганида, сМ (Centimorgan) Единица измерения расстояния на генетической карте. I сМ соответствует расстоянию между генами, рекомбинация между которыми происходит с частотой 1%. Для хромосом человека 1 сМ равна примерно 10⁶ п.н. Эта единица была введена Т.Мограном, когда он проводил эксперименты по изучению генетического сцепления у Drosophila.

Саузери-блоттинг (Southern blotting) Обнаружение специфических нуклеотидных последовательностей пугем переноса денатурированных молекул ДНК, подвергнутых электрофорезу, с агарозного геля на нитроцеллюлозный или найлоновый фильтр за счет капиллярного эффекта и гибридизации с меченым зондом, комплементарным искомой последовательности.

Секвенирующий гель (Sequencing gel) Длинная пластина полиакриламидного геля, позволяющая проводить электрофоретическое разделение олиго- и полинуклеотидов, различающихся по длине всего на 1 нуклеотид.

Секреция (Secretion) Выведение веществ из клетки во внешнюю среду.

Селекция (Selection) 1. Наука о методах создания новых сортов культурных растений и пород животных 2. Отбор нужных организмов (клеток) в смешанной популяции.

СЕРН (Centre d'Etude de Polymorpliisme Humain) Центр по изучению полиморфизма у человека, находящийся в Париже. Располагает базой данных по генетической и молекулярно-генетической изменчивости популяций человека из большинства регионов земного шара.

Серотип (Serotype) Антигенная характеристика клетки (бактерии, клетки крови и т.д.), установленная на основе ее взаимодействия с антителами.

Сибсы (Sibses) Прямые потомки одних и тех же родителей (братья и/или сестры).

Сигма-фактор (Sigma factor) Бактериальный белок, обеспечивающий узнавание ДНК-полимеразой ее участка связывания в молекуле ДНК и инициацию транскрипции.

Сигнал полиаденилирования (Polyadenylation sygnał) Нуклеотидная последовательность, ответственная за окончание транскрипции и детерминирующая ферментативное присоединение остатков аденина к 3'-концу молекулы мРНК.

Сигнальная последовательность (Signal region, initiator element) Нуклеотидная последовательность в гене, служащая местом связывания белка (фактора транскрипции), который регулирует транскрипцию.

Сигнальный пептид, сигнальная последовательность, лидерный пептид (Signal peptide) N-концевой участок белковой молекулы длиной 15—30 аминокислот, обеспечивающий секрецию белка (перенос через мембрану). После секреции этот участок отщепляется от белковой молекулы.

Сидерофор (Siderophore) Низкомолекулярное вещество, эффективно связывающее железо. Синтезируется многими почвенными микроорганизмами, обеспечивая их железом, которое затем поставляется растениям, находящимся с этими микроорганизмами в симбиотических отношениях.

Симбиоз (Symbiosis) Сосуществование разных организмов, при котором каждое из них выполняет свои функции. В некоторых случаях взаимовыгодно.

Синдром (Syndrome) Совокупность ряда симптомов (признаков), характерных для данного заболевания.

Система комплемента (Complement cascade) Серия последовательных процессов активации комплемента (сложного белкового комплекса сыворотки крови) и ферментативных реакций, запускаемая в ответ на образование комплекса антиген—антитело.

Скрещивание (Gross, crossing, mating) Однократное скрещивание генетически различающихся организмов.

Скрининг (Screening) Метод (или комплекс методов) идентификации единичного объекта (особи в популяции, клетки с искомыми свойствами, участка нуклеотидной последовательности и т.д.) путем перебора большого числа объектов.

Соматическая клетка (Somatic cell) Любая неполовая клетка многоклеточного организма.

Сопряжение (Coupling) Конфигурация, при которой две доминантные или две рецессивные формы двух разных генов находятся на одной хромосоме. Аналогично цис-конфигурации. См. также Отталкивание.

Сплайсинг (Splicing) Вырезание из предшественника мРНК интронов и ковалентное соединение экзонов с образованием зрелых молекул мРНК.

Стационарное состояние (Steady state) Состояние непрерывного процесса ферментации, при котором число клеток, удаляемых из ферментера и поступающих в него, одинаково.

Стволовые клетки (Stem cells) Митотически активные стволовые клетки, в результате деления которых происходит замещение погибших клеток в многоклеточном организме.

Структурный ген (Structural gene) Ген, кодирующий какой-либо белок.

Ступенчатый разрыв (Staggered cut) Разрезание двухцепочечной ДНК, при котором разрывы в комплементарных цепях располагаются не строго один напротив другого, а немного смешены.

Субклонирование (Subcloning) Перенос части уже клонированной молекулы ДНК в другой клонирующий вектор.

Субстрат (Substrate) Вещество, превращение которого катализируется специфическим ферментом.

Субтилизин (Subtilisin) Протеолетический фермент, синтезируемый клетками Bacillus substilis.

Субъединичная вакцина (Subunit vaccine) Вакцина, содержащая лишь отдельные компоненты патогенного микроорганизма.

Супрессия (Supression) Восстановление утраченной генетической функции, обусловленное подавлением эффекта одной мутации под действием второй.

Сцепление (Linkage) Взаимосвязанная передача от клетки к клетке генов, локализованных на одной хромосоме.

CG-островки, HTF-островки (CpG islands, HpaІІ tiny fragments) CG-богатые последовательности размером до нескольких сотен пар; фланкируют с 5'-конца многие транскрибируемые гены позвоночных и содержат сайты рестрикции для НраІІ.

Cos-сайты (Cos-sites) Нуклеотидные последовательности на концах генома фага К, необходимые для упаковки ДНК в фаговые частицы.

Тандемный повтор (Tandem array) Нуклеотидная последовательность, состоящая из нескольких одинаковых элементов, соединенных «голова-к-хвосту».

ТАТА-бокс (ТАТА box) Участок, располагающийся в промоторной области генов эукариот за 25 нуклеотидов до сайта инициации транскрипции, с которым связывается РНК-полимераза. Другое название — бокс Хогнесса. Аналогом у прокариот служит бокс Прибнова.

Т-ДНК (Т-DNA) Фрагмент Ti-плазмиды, который встраивается в ядерную ДНК клетки-хозяина и стабильно наследуется ею. Вызывает образование опухоли у растений (корончатого галла).

Тельца включения (Inclusion bodies) Мелкие частицы из кристаллизовавшегося белка, образующегося в избыточном количестве в бактериальной клетке при заражении ее вирусом или при встраивании вирусного генома в ДНК клетки-хозяина. Их наличие свидетельствует о патологических изменениях в клетке.

Температура плавления, Тm (Melting temperature) Температура, при которой происходит разрыв половины водородных связей в полинуклеотидном дуплексе.

Терминальная трансфераза (Terminal transferase, deoxynucleotidyl transferase) Фермент, катализирующий присоединение к 3'-концу молекулы ДНК дезоксинуклеозидмонофосфатов. Используется для клонирования кДНК при участии комплементарных гомополимерных «хвостов» [poly (А) — poly (Т)].

Терминация (Termination) Остановка синтеза макромолекулы.

Терминирующий кодон (Terminating codon) Кодон, определяющий окончание (терминацию) синтеза полинуклеотидной цепи. Обычно это кодоны UAA, UAG и UGA,

Термофильный (Thermophylic) Характеризует теплолюбивые организмы, обычно растущие при температуре выше 50 °С. Некоторые термофильные организмы могут расти при температуре от 90 до 100 °С.

Тимидилатсинтаза (Thymidylate synthase) Фермент, катализирующий метилирование урацила с превращением его в тимин.

Тимин, Т (Thymine) Пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав ДНК.

Тканевый активатор плазминогена (Tissue plasminogen activator) Белок, участвующий в разрушении сгустков крови.

Т-клетки (Т cells) Лимфоциты, играющие ключевую роль в иммунном ответе.

ТH-лимфоциты, Т-хелперы (T_H-lymphocytes, helper cells)

Т-лимфоциты, играющие основную роль в узнавании чужеродного антигена.

Трансгенный организм (Transgenic organism) Организм, геном которого содержит чужеродный генетический материал, включенный методами генной инженерии.

Трансгеноз (Transgenesis) Введение чужеродного гена в растительную или животную клетку и его передача в ряду поколений.

Трансдукция (Transduction) Перенос генетического материала из одной бактериальной клетки в другую с помощью бактериофага.

Транскрипт (Transcript) Молекула РНК, синтезированная на специфической ДНК как на матрице.

Транскрипционное картирование (Transcription mapping) «Привязка» индивидуальных транскриптов (клонов кДНК или экспрессированных последовательностей- мишеней) к хромосомным районам с помощью метода флуоресцентной гибридизации in situ, ПЦР и т.д.

Транскрипция (Transcription) Процесс синтеза РНК, катализируемый PH К-полимеразой, в котором в качестве матрицы используется одна из цепей ДНК.

Транслокация (Translocation) 1. Хромосомная перестройка, заключающаяся в переносе участка хромосомы в новое положение на той же или на другой хромосоме или в переносе целой хромосомы на другую хромосому. 2. Перемещение молекулы мРНК во время трансляции на один кодон.

Трансляция (Translation) Синтез полипептидной цепи рибосомой с использованием в качестве матрицы мРНК.

Трансляция in vitro (In vitro translation) Синтез белков, который осуществляется либо на очищенной ДНК с использованием бактериальных экстрактов, либо на мРНК с использованием экстрактов зародышей пшеницы или ретикулоиитов кролика. Экстракты содержат рибосомы, тРНК и белковые факторы; в реакционную смесь добавляют также ATP, GTP и аминокислоты.

Транспозаза (Transposase) Фермент, участвующий в транспозиции (перемещении из одного сайта в другой) некоторых мобильных генетических элементов.

Транспозиция (Transposition) Перемещение мобильного генетического элемента из одного локуса в другой.

Транспозоны (Transposones) Мобильные генетические элементы, несущие структурные гены, которые детерминируют функции, не связанные с самим процессом перемещения (например, гены устойчивости к антибиотикам).

Транспортная РНК, тРНК (Transfer RNA) Молекула РНК, выступающая в роли адаптора при специфическом переносе аминокислот к растущей полипептидной цепи в процессе трансляции.

Трансфекция (Transfection) Искусственное введение в эукариотические клетки изолированных молекул ДНК.

Трансформация (Transformation) 1. Перенос генетической информации в бактериальные клетки с участием плазмид или без них, но всегда — без участия вирусов; часто приводит к изменению фенотипа реципиентной клетки. 2. Превращение нормальных клеток животных в опухолевые.

Трихлоруксусная кислота, ТХУ (Trichloracetic acid) Органическое соединение, часто использующееся для осаждения белков и нуклеиновых кислот.

Тупой конец (Blunt end) Конец двухцепочечной молекулы ДНК, у которого не выступает ни одна из цепей.

Ті-плазмида (Ті plasmid) Плазмида почвенной бактерии Agrobacterium tumefaciens, Т-участок которой способен включаться в их ядерную ДНК, что приводит к образованию опухолей.

Ty-элемент (Ту element) Мобильный генетический элемент дрожжей (от англ. Tparnsposon of yeast).

Улавливание экзона (Exon trapping) Метод идентификации и клонирования зкзонов из геномных клонов. Фрагменты геномной ДНК (1—6 т.п.н.) встраивают в полилинкер вектора, расположенный внутри интрона, фланкированного двумя экзонами. Полученным искусственным геном (экзон 1—интрон—экзон 2) трансфицируют клетки Е.соli, в которых происходит его транскрипция и сплайсинг мРНК. Если в интроне присутствует экзон, то зрелая мРНК будет иметь большую длину, чем ожидалось. мРНК можно подвергнуть обратной транскрипции, провести ПЦР и выделить экзон.

Урацил, U (Uracil) Пиримидиновое основание; одно из четырех азотистых оснований, входящих в состав РНК.

Устойчивые клеточные линии (Established cell lines) Культуры клеток, способные к неограниченному росту in vitro. Получаются из перевиваемых клеточных культур, часть клеток которых приобретают селективные преимущества и обладают повышенной скоростью роста.

Участки, определяющие комплементарность, CDR (Complementary-determining regions) Гипервариабельные области вариабельных участков легкой и тяжелой цепей антитела, образующие антигенсвязывающие центры молекулы антитела.

Фактор транскрипции (Transcription factor) Белок, помогающий РНК-полимеразе пройти все этапы транскрипции и обеспечивающий избирательность этого процесса.

Фенилкетонурия (Phenyl ketonuria) Наследственное заболевание, характеризующееся нарушением миелинизации нервных волокон, снижением количества меланоцитов, судорогами, умственной отсталостью и т.д. Обусловлено нарушением обмена фенилаланина вследствие дефицита фенилаланилгидроксилазы. Наследуется по аутосомно-рецессивному типу.

Фенотип (Phenotype) Совокупность всех признаков особи, формирующаяся в процессе взаимодействия ее генотипа и внешней среды.

Фенотипическое смешивание (Phenotypic mixing, pseudotype formation) Образование вирусных частиц в результате упаковки генетического материала одного штамма вируса в белковый капсид другого при смешанной инфекции.

Ферментация (Fermentation) В промышленной микробиологии — крупномасштабное культивирование микроорганизмов в специальных емкостях (ферментерах, биореакторах).

Ферментный иммуносорбентный анализ, ELISA (Enzyme-linked immunosorbent assay) Метод обнаружения специфических молекул в образце. Образец фиксируют на твердой подложке и добавляют антитело, специфичное к маркерной молекуле (первое антитело). Несвязавшиеся молекулы первого антитела смывают и добавляют второе антитело, специфически связывающееся с первым. Ко второму антителу присоединен фермент, превращающий неокрашенный субстрат в окрашенный продукт. Добавляют неокрашенный субстрат и проводят количественное определение окрашенного продукта.

Ферредоксин (Ferredoxin) Железосерный белок, переносчик электронов.

Фертильность (Fertility) Способность организмов приносить жизнеспособное потомство.

Физическая карта (Physical map) Расположение генов на хромосоме, установленное с помощью различных методов (электронная микроскопия, секвенирование, рестрикционное картирование). Расстояние на такой карте измеряется в числе пар нуклеотидов.

Фиксация азота (Nitrogen fixation) Превращение атмосферного азота в аммиак. Катализируется ферментом нитрогеназой, обнаруженным только у прокариот.

Фитогормон (Phytohormone) Вещество, стимулирующее рост растений или другие процессы. Примеры: ауксин, цитокинин, этилен и т.д.

Фитопатогены (Phytopathogen) Организмы (грибы, бактерии, вирусы), вызывающие заболевания у растений.

Флавоноиды (Flavonoids) Фенольные соединения, синтезируемые растениями. Их структурную основу составляют два ароматических кольца, соединенных трехуглеродным мостиком. Отвечают за пигментацию растений, защищают их от грибов и насекомых.

Флуоресцеин (Fluorescein) Флуоресцирующий краситель, часто использующийся в качестве метки для антител. Позволяет визуализировать антитела после их связывания с антигеном.

Флуорофор (Fluorophore) Химическая группа, ответственная за флуоресценцию данного соединения.

Фосфдиэфирная связь (Phosphodiester bond) Связь между фосфатными группами при 3'- и 5'- углеродных атомах соседних нуклеотидов одной полинуклеотидной цепи.

Фотосинтез (Photosyntesis) Процесс превращения клетками высших растений энергии видимого света в энергию химических связей, сопровождаемый образованием органических соединений и кислорода из диоксида углерода и воды.

Фрагмент Кленова (Klenov fragment) Более крупный из двух фрагментов ДНК-полимеразы I E.coli, образующийся при ее протеолитическом расщеплении. Сохраняет полимеразную активность в направлении 5'→3' и экзонуклеазную — в направлении 3'→5'. Используется, в частности, при секвенировании ДНК.

Фрагментация ДНК (Shearing) Разрыв молекул ДНК под действием гидродинамических сил (например, при пропускании раствора ДНК через иглу шприца). Гидродинамические силы в растворе возникают в результате скольжения одного слоя жидкости относительно другого.

Функциональное картирование (Functional cloning) Идентификация гена исходя из известной аминокислотной последовательности его продукта.

Футпринтинг (Footprinting) Метод идентификации участков ДНК, специфически связывающихся с белками. В его основе лежит защита ДНК в местах контакта с белком от эндонуклеазного расщепления.

Хемилюминесценция (Chemiluminescence) Испускание света в ходе химической реакции.

Химера (Chimera) Организм, включающий клетки, ткани и органы разных организмов.

Хитиназа (Chitinase) Фермент, синтезируемый растениями при заражении патогенными грибами; гидролизует хитин клеточной стенки грибов. Хитиназу синтезируют и некоторые бактерии.

Холофермент (Holoenzyme) Молекула фермента, включающая все необходимые для функционирования субъединицы и кофакторы.

Хромогенный субстрат (Chromogenie substrate) Вещество, приобретающее определенную окраску после расщепления специфическим ферментом.

Хромосома (Chromosome) Структура, основу которой составляет конденсированная молекула ДНК; носитель генетической информации. Способна к воспроизведению с сохранением структурно-функциональной индивидуальности в ряду поколений. У эукариот находится в ядре клетки, у прокариот — непосредственно в цитоплазме.

Хромосомный сайт интеграции (Chromosomal integration site) Место в хромосоме, куда может встроиться чужеродная ДНК, часто без всяких последствий для организма-хозяина.

Х-сцепленный ген (X linked) Ген, локализованный исключительно на Х-хромосоме.

Целлюлоза (Cellulose) Высокомолекулярный линейный полисахарид, состоящий из остатков ß-D-глюкозы, соединенных (1,4)-связями. Участвует в образовании структурного скелета растительных клеток.

Целлюлосома (Cellulosome) Многокомпонентный белковый агрегат, присутствующий в клетках некоторых целлюлолитических микроорганизмов и содержащий все ферменты, обеспечивающие полное расщепление целлюлозы.

Центрифугирование в градиенте плотности сахарозы (Sucrose density gradient centrifugation) Метод разделения макромолекул по форме и размеру, основанный на различии их коэффициентов седиментации.

Циклический AMP, cAMP (Cyclic АМР) Циклический аденозинмонофосфат, соединение, участвующее во многих регуляторных процессах.

«Цинковые пальцы» (Zinc fingers) ДНК-связывающие домены, которые включают по два цистеиновых остатка и один гистидиновый. Эти аминокислоты взаимодействуют с ионом цинка, а участок полипептидной цепи между ними образует петлю в форме «пальца».

Цистрон (Cistron) Генетическая единица, эквивалентная гену и кодирующая отдельный белок.

Цитозин, С (Cytosine) Одно из четырех азотистых оснований, входящее в состав ДНК и РНК.

Цитокинины (Cytokinins) Растительные гормоны, индуцирующие деление клеток.

Частота аллеля (Allelic frequency) Отношение встречаемости одного из аллелей данного локуса к сумме встречаемостей всех аллелей у достаточно большого числа индивидуумов в данной популяции.

Частота использования кодона (Codon usage) Средняя частота использования кодона данным организмом, полученная для большой выборки структурных генов.

Частота рекомбинаций, рекомбинационный индекс (Recombination frequency, recombination index) Число рекомбинантов (или рекомбинантных хромосом) по отношению к общему числу потомков (или хромосом).

Частота трансформации (Transformation frequency) Доля клеток в клеточной популяции, получивших чужеродную ДНК; выражается числом трансформантов к общему числу клеток.

Челночный вектор (Shuttle vector) Плазмидная ДНК, способная реплицироваться в клетках двух разных типов (например, в E.coli и клетках дрожжей).

Шайна—Дальгарно последовательность, сайт связывания рибосомы (Shine—Dalgarno sequence, ribosome-binding site) Нуклеотидная последовательность на 5'-конце мРНК (обычно AGGAGG), спаривающаяся с комплементарной последовательностью РНК-компонента (рРНК) малой субчастицы рибосомы.

Штамм (Strain) Культура генетически однородных микроорганизмов.

Экзогенная ДНК (Exogenous DNA) ДНК, выделенная из организма-донора и встроенная в вектор или хромосомную ДНК организма-хозяина. Называется также чужеродной (Foreign) и гетерологичной (Heterologous) ДНК.

Экзон (Exon) Участок гена, входящий в состав первичного транскрипта, который остается в нем после процессинга (вырезания интронов). Вместе с другими экзонами образует зрелую мРНК.

Экзонуклеаза III (Exonuclease III) Экзонуклеаза E.coli, отщепляющая нуклеотиды с 3'-концов двухцепочечной ДНК.

Экзополисахарид (Exopolysaccharide) Высокополимерное соединение, состоящее из остатков сахаров и секретируемое в окружающую среду некоторыми микроорганизмами.

Экспрессивность (Expressivity) Степень фенотипического выражения наследственного признака, кодируемого данным аллелем. Различают постоянную экспрессивность (в отсутствие изменчивости признака) и вариабельную.

Экспрессирующий вектор (Expression vector) Плазмидный вектор, сконструированный таким образом, чтобы клонированный ген экспрессировался только в определенной фазе клеточного цикла и только в течение определенного времени. Для этого в плазмиду встраивают сильный регулируемый промотор.

Экспрессия (Expression) Транскрипция и трансляция гена.

Электропорация (Electroporation) Образование пор в клеточных мембранах под действием электрического тока. Через эти поры в клетки проникает чужеродная ДНК.

Электрофорез (Electrophoresis) Метод разделения заряженных молекул (ДНК, РНК или белков), основанный на разной скорости их перемещения в электрическом поле.

Элонгация (Elongation) Последовательное присоединение мономеров к полимерной цепи.

Эмбриональные стволовые клетки, ES-клетки (Embryonic stem cells) Клетки из эмбрионов на стадии бластоцисты, способные к дифференцировке в любые типы клеток, в том числе и в клетки зародышевой линии, при введении в другой эмбрион на стадии бластоцисты.

Эндонуклеаза (Endonuclease) Фермент, гидролизующий внутренние фосфодиэфирные связи и расщепляющий молекулы ДНК и РНК. Эндонуклеазы участвуют в рекомбинации, репарации и рестрикции; в последнем случае называются рестриктазами (рестрицирующими эндонуклеазами).

Эндотоксин (Endotoxin) Токсин, не выделяемый клеткой в окружающую среду, а входящий в состав клеточной стенки; многие эндотоксины вырабатываются грамотрицательными бактериями и вызывают воспаление.

Энтеротоксин (Enterotoxin) Бактериальный белок, который, попадая в кишечник, вызывает диарею.

Энхансер (Enhancer) Специфический участок ДНК, многократно увеличивающий уровень транскрипции генов, расположенных на той же молекуле ДНК.

Эпитоп, антигенная детерминанта (Epitope, antigenic determinant) Часть молекулы антигена, взаимодействующая с антигенсвязывающим центром антител или Т-клеточного рецептора.

Эрлифтный биореактор (Airlift fermenter) Цилиндрический биореактор, в котором перемешивание осуществляется потоком газа, подаваемого снизу.

Этилен (Ethylen) Газ, действующий как растительный гормон. Способствует созреванию плодов, сохранению цветков, прорастанию семян, образованию корней; участвует в ответе растения на стрессовые воздействия.

Эукариоты (Eukaryotes) Организмы, у которых: 1) имеется ядро, где содержатся хромосомы; 2) в цитоплазме присутствует различные органеллы — митохондрии, хлоропласта и т.д. К эукариотам относятся животные, растения, грибы, некоторые водоросли.

«Эффект свидетеля» (Bystander effect) Уничтожение немодифицированных опухолевых клеток цитотоксичным продуктом, синтезируемым соседними генетически трансформированными клетками.

Эффективность трансформации (Transformation efficiency) Число клеток, получивших чужеродную ДНК, отнесенное к количеству трансформирующей ДНК. Выражается числом трансформантов на 1 мкг ДНК.

Эффектор (Effector) Небольшая молекула, связывающаяся с репрессором или ферментом и приводящая к их ингибированию или активации.

Эффекторные клетки (Effector cells) Клетки иммунной системы, разрушающие антигены.

Ядерное клонирование (Nuclear cloning) Получение живого организма из безъядерной яйцектетки с вживленным диплоидным соматическим ядром.