Химия и биология белков - Ф. Гауровитц 1953
Гидролитическое расщепление белков
Порядок расположения аминокислот в пептидной цепи
Количественные данные об аминокислотном составе белков, приведенные в табл. 1, необходимы для характеристики белка и для изучения его структуры. Эти данные, однако, еще ничего не говорят о порядке расположения аминокислот в вытянутых пептидных цепях или о распределении различных аминокислот в белковой глобуле. Совершенно понятно, что физические и химические свойства двух белков, содержащих одинаковые аминокислоты, могут быть очень различны, если поверхность молекулы одного белка образована диссоциирующими аминокислотами, а поверхность второго белка — неполярными аминокислотами. Невозможно поэтому на основании процентного содержания аминокислот в данном белке предсказать его физико-химические свойства.
До сравнительно недавнего времени ничего не было известно о порядке расположения аминокислот в пептидных цепях белка. Только за последние несколько лет путем фракционирования продуктов частичного гидролиза белков были получены ценные данные в этом отношении. Зангер [53] изучил пептиды, выделенные при расщеплении инсулина (см. гл. XIII). Концевые аминогруппы этих пептидов были помечены путем конденсации их с динитрофторбензолом (см. гл. VII). Оказалось, что при дальнейшем гидролизе выделенные пептиды давали ДНФ-глицилизолейцин (ДНФ символизирует динитрофенил), ДНФ-глицилизолейцилвалин и ДНФ-глицилизолейцилвалилглицин. На этом основании был сделан вывод, что в этих пептидах аминокислоты расположены в следующем порядке: глицин—изолейцин—валин—глицин. Другие ДНФ-пептиды были выделены из ферментного гидролизата ДНФ-инсулина [126]. Подобным же образом было найдено, что при частичном гидролизе бактериального токсина грамицидина С образуются следующие дипептиды и трипептиды: валилорнитин, орнитиллейцин, лейцилфенилаланин, фенилаланилпролин, пролилвалилорнитин, валилорнитиллейцин и фенилаланилпролилвалин. На этом основании было сделано заключение, что в грамицидине С имеется следующая цепь из аминокислот, которая, замыкаясь, образует циклопептид: l-валин-l-орнитин-l-лейцин- d-фенилаланин-l-пролин1 [127] (см. гл. XV). Разделение смесей пептидов в этих исследованиях производилось при помощи бумажной хроматографии [29] или методом противоточного распределения [126].
Несмотря на то, что эти исследования дали сведения относительно структуры только небольших частей пептидных цепей, их значение необычайно велико, так как они непосредственно подводят нас к проблеме построения остова белковой молекулы из продуктов ее гидролитического распада.
1 Согласно новейшим данным, грамицидин С представляет собой не пентациклопептид, а декациклопептид (A. R. Battersby, L. С. Craig, 1. Am. Chem. Soc., 73, 1887, 1951). — Прим, ред.