БИОХИМИЯ - Л. Страйер - 1984
ТОМ 1
ЧАСТЬ I. КОНФОРМАЦИЯ И ДИНАМИКА
ВОПРОСЫ И ЗАДАЧИ
1. В химии белка часто используются следующие реактивы:
СNВг Дансилхлорид
6 н. НСl β-Меркаптоэтанол
Мочевина Трипсин
Нингидрин Фенилизотиоцианат
Надмуравьиная кислота Химотрипсин
Какой из этих реактивов следует применить при решении следующих задач:
а) определение последовательности аминокислот в небольшом пептиде;
б) идентификация аминоконцевого остатка в пептиде (количество которого составляет менее 10-7 г);
в) обратимая денатурация белка, не содержащего дисульфидных связей. Какой понадобится дополнительный реактив, если в белке имеются дисульфидные связи?
г) гидролиз пептидных связей по карбоксильной группе ароматических аминокислотных остатков;
д) расщепление пептидных связей по карбоксильной группе метионинов;
е) гидролиз пептидных связей по карбоксильным группам остатков лизина и аргинина?
2. Какое значение pH следующих растворов:
а) 10-3 н. НСl;
б) 10-2 н. NаОН;
в) смеси равных объемов 0,1 М уксусной кислоты и 0,03 М уксуснокислого натрия;
г) смеси равных объемов 0,1 М глицина и 0,05 М NаОН;
д) смеси равных объемов 0,1 М глицина и 0,05 М НСl?
3. Каково соотношение основания и кислоты при pH 4,5,6,7 и 8, если рК кислоты равно 6?
4. Мышечный белок тропомиозин представляет собой суперспираль состоящую из двух α-спирализованных тяжей. Масса этого белка - 70 кДа. Средняя масса одного аминокислотного остатка около 110 Да. Рассчитайте длину молекулы.
5. Для расщепления пептидных связей в белках используют безводный гидразин. Каковы продукты реакции? Как можно было бы воспользоваться этим методом для идентификации С-конце- вой аминокислоты?
6. Адренокортикотропный гормон человека представляет собой полипептид со следующей аминокислотной последовательностью: Ser-Tyr-Ser-Met-Glu-
His-Phe-Arg-Trp-Gly-Lys-Pro-Val-Gly-Lys- Lys-Arg-Arg-Pro-V al-Lys-Val-T yr-Pro-Asp- Ala-Gly-Glu-Asp-Gln-Ser-Ala-Glu-Ala-Phe- Pro-Leu-Glu-Phe.
а) Рассчитайте примерно общий заряд этой молекулы при pH 7, приняв, что значения рК боковых цепей аминокислот равны приведенным в табл. 2.3, и считая рК концевых —NH3+- и —СООН-групп равными соответственно 7,8 и 3,6.
б) Сколько получится пептидов при обработке гормона бромистым цианом?
7. Этиленимин реагирует с боковыми цепями цистеина в белке с образованием S-аминоэтильных производных. Пептидные связи, образованные карбоксильными группами этих модифицированных цистеиновых остатков, гидролизуются трипсином. Почему?
8. Выделен фермент, катализирующий обменные реакции между дисульфидными и сульфгидрильными группами. Неактивная «разболтанная» рибонуклеаза под действием этого фермента быстро превращается в каталлитически активную форму. С другой стороны, этот же фермент быстро инактивируется под действием инсулина. Какой вывод относительно взаимосвязи между последовательностью аминокислот в инсулине и его трехмерной структурой можно сделать на основании этого факта?