Основы биоинформатики - Огурцов А.Н. 2013



Введение

Основания биоинформатики

Предмет биоинформатики

Особенность биоинформационных данных

Цели и задачи биоинформатики

Перспективы применения биоинформатики

Инфраструктура биоинформатики

Компьютерные компоненты биоинформатики

Интернет-компоненты биоинформатики

Биоинформационные данные, сети и базы

Биологические последовательности

Информация в молекулярной биологии

Выравнивание биологических последовательностей

Точечная матрица сходства

Примеры сравнения данных

Биологическая классификация и номенклатура

Примеры биоинформационного анализа

Поиск схожих последовательностей в базах данных

Понятие «информация»

Определение понятия «информация»

Количество информации

Свойства информации

Генетическая информация

Геномы и протеомы

Геномика

Картографирование генома

Методы секвенирования ДНК

Протеомика

Структура белков и информация

Биоинформатика в медицине

Методы биоинформационного анализа

Матрицы замен

Мера сходства последовательностей

Вес операций редактирования

Матрицы РАМ

Матрицы BLOSUM

Вычисление счёта выравнивания последовательностей

Алгоритмы выравнивания последовательностей

Алгоритм динамического программирования

Алгоритм глобального выравнивания

Алгоритм локального выравнивания

Приближённые методы быстрого поиска в базах данных

Значимость выравниваний

Множественное выравнивание последовательностей

Визуализация результатов выравнивания

Методы множественного выравнивания

Скрытые марковские модели

Филогенетический анализ

Гомология

Филогения и фенетика

Кладистические методы

Инструменты филогенетического анализа

Информационные принципы в биотехнологии

Секвенирование биологических последовательностей и экспрессия генов

Открытая рамка считывания

Определение сиквенса

Ярлыки экспрессируемых последовательностей

Экспрессия генов

Анализ белковой экспрессии

Использование результатов секвенирования

Функционирование и организация геномов

Проблемы анализа генов

Локализация генов в геноме

Геномы прокариот

Геномы эукариот

Анализ геномов

Однонуклеотидные полиморфизмы

Состав геномов

Горизонтальный перенос генов

Сравнительная геномика эукариот

Анализ и предсказание белков

Проблема расшифровки белковых структур

Предсказание вторичной структуры белка

Предсказание трёхмерной структуры белков

Программы предсказания белков

Проблемы в предсказании функции белка

Биоинформатика в фармации

Медицинская геномика и фармакогеномика

Глобальная фармацевтическая промышленность

Открытие и разработка лекарств

Фармакоинформатика

Компьютерная токсикология и иммуноинформатика

Список условных обозначений

Список литературы

Для любых предложений по сайту: [email protected]